Ознакомительная версия.
Кстати, если вас устроит структурная формула кислорода (O=O), вы можете поместить ее в документ, выполнив команду Atom → Add Molecule → O2 (Атом → Добавить молекулу → O2).
Первая половина реакции готова. Перейдем к фенолу. Как создать бензольное кольцо, вам уже известно. ОН-группа добавляется командой Branch → ОН (Присоединить → ОН) и щелчком возле атома, к которому она должна присоединиться.
Знак «+» вводится с панели Add Symbol (Добавить символ), вызываемой командой Symbol (Символ). Удалить его можно так же, как и текст.
Осталось лишь нарисовать молекулу ацетона – по номенклатуре – пропан-2-он. Значит, чтобы получить ацетон, к молекуле пропана в положение 2 нужно ввести кетогруппу =0. Поместить пропан в документ следует, выполнив команду Chain → Add → З-Propane (Цепь → Добавить → З-Пропан) (цифра возле названия углеводорода показывает количество атомов в углеродной цепи). Кетогруппа вводится командой Branch → =O (Присоединить → =O) и щелчком возле положения 2 в пропане. Как визуализировать углеродные атомы, читайте выше, в описании создания молекулы изопропилбензола.
Итак, уравнение реакции готово. Чтобы в реферате оно смотрелось гармонично, нужно привести в соответствие шрифты, применяемые при оформлении работы, и начертание символов в ChemPen3D. Так, если при наборе текста вы используете стандартный для документов Word шрифт Times New Roman с кеглем 10–12 пт, то такие же настройки лучше применить и в ChemPen3D. Для этого выполните команду File → Font (Файл → Шрифт) и установите в открывшемся окне необходимые параметры.
Вставить уравнение реакции в документ Word можно следующим образом. Выполните команду File → CopyToClipboard (Файл → Копировать в буфер), откройте документ Word и вставьте реакцию стандартным способом – командой Вставить контекстного меню.
Ознакомьтесь с несколькими замечаниями, которые в дальнейшем помогут вам при создании формул.
Чтобы заменить в молекуле один атом на другой, щелкните на нем правой кнопкой мыши и выберите в окне Atom Editor (Атомный редактор) новый. Кнопки R.AHn и R.nHA на открываемой параллельно панели Atom Tool (Атом) служат для смены последовательности атомов в группе. Так, с их помощью можно записать ОН-группу в форме НО.
Если требуется заменить одинарную связь на двойную или тройную, точно так же щелкните на ней правой кнопкой мыши и проведите необходимые замены. Всегда следите за соблюдением валентностей – программа не сообщает о нарушении их правил.
Чтобы создать копию структуры, выделите ее и в открывшемся окне Group Editor (Редактор групп) нажмите кнопку Clone (Дублировать).
В ходе написания реакции были рассмотрены практически все меню ChemPen3D. Чтобы не возникало путаницы с их многочисленными командами, приведены сведения о назначении наиболее важных из них.
• Symbol (Символ). Вызывает окно Add Symbol (Добавить символ), из которого в рабочую область можно вставить стрелки-разделители реагентов и продуктов реакции (в том числе и обратимой), символы частичных зарядов на атомах, знаки «+», °С. Отсюда же кнопкой Text (Текст) вызывается окно текстового редактора (Text Editor), в котором создаются комментарии.
• Benzene (Бензол). Команда Add (Добавить) помещает в документ молекулу бензола, Branch (Присоединить) вводит в структуру фенильный радикал, Fuse (Слить) позволяет создать конденсированное ароматическое соединение путем присоединения по двойной связи к бензольному кольцу (если оно есть в работе) еще одного кольца.
• Ring (Кольцо). С помощью команд этого меню в документ можно ввести командой Add (Добавить) циклический углеводород с количеством атомов углерода от трех до десяти, присоединить циклический радикал к другой молекуле командой Branch (Присоединить), создать конденсированную структуру командой Fuse (Слить) или сделать один из углеродных атомов общим для двух циклов командой Join (Объединить). Размер присоединяемого кольца выбирается здесь же.
• Chain (Цепь). Командой Add (Добавить) можно поместить в рабочую область предельный (нормальный или разветвленный) углеводород (первый столбик списка) или молекулу с двойной или тройной связью (второй столбик списка). Команда Branch (Присоединить) позволяет присоединить к молекуле углеводородный радикал.
• Branch (Присоединить). Меню содержит множество групп, наиболее часто встречающихся в органической химии.
• Atom (Атом). Позволяет вставлять в документ различные атомы (команда Add), ионы и молекулы (команды Add AHs и Add Molecule), а также присоединять атом к структуре (Branch) или соединять два атома связью (Link Atoms).
• Undo/Redo. Отмена/Восстановление последнего действия.
• Reset. Сброс из памяти последней команды.
• File. Данное меню содержит стандартные команды открытия нового (New) или уже существующего файла (Open), сохранения документа в стандартном формате ChemPen3D – СНР (Save) или других доступных форматах (Save As), распечатки документа (Print), копирования формул в буфер обмена (CopyToClipboard), настройки шрифтов (Font).
Помимо стандартных пунктов, в меню File (Файл) есть команды, позволяющие создавать трехмерное изображение молекулы с соблюдением соотношения размеров атомов, длин связей и валентных углов. Благодаря SD-функциям вы не только узнаете, как в действительности выглядят молекулы того или иного вещества, но и сможете украсить свой доклад эффектным рисунком.
Создание 3D-изображения рассмотрим на примере нуклеотида – основной структурной единицы молекулы ДНК, которая выполняет в организме роль носителя генетической информации.
В первую очередь нужно построить обычную двухмерную молекулу так же, как было описано выше (рис. 4.6).
Рис. 4.6. Двухмерная структура нуклеотида
Как видно на рисунке, молекула получилась ровная, с прямыми углами, однако сделано это лишь для удобства восприятия. На самом же деле геометрия молекулы (длины связей и валентные углы) совершенно иная и соответствует наименьшей энергии (другими словами, молекула стремится к тому, чтобы в ней не было каких-либо напряжений и межатомных отталкиваний). Чтобы привести ее в реальное состояние, необходимо выполнить команду File → 3D Optimizer (Файл → 3D Оптимизатор) и в открывшемся окне Optimize Geometry (Оптимизировать геометрию) нажать кнопку GO. На ваших глазах в структуре изменятся длины связей и углы между ними. Чтобы отобразить скрытые атомы водорода, выполните команду Atom → Add Hs 3D (Атом → Добавить Н 3D).
Теперь перейдем к самому интересному – трехмерной визуализации. За вид молекулы в трехмерном пространстве отвечает пункт 3D Views (3D-виды) меню File (Файл). Выполнив соответствующую команду, вы сможете выбрать один из 15 типов отображения. После этого молекула превратится в красочную 3D-структуру (рис. 4.7).
После выполнения команды File → 3D Animator (Файл → 3D-аниматор) молекула начнет вращаться в выбранном вами направлении.
Рис. 4.7. Трехмерная структура нуклеотида (в двух ракурсах)...
Примечание
В видеоуроке «Урок 4.2. Создание химических формул», который находится на компакт-диске, прилагаемом к книге, показано, как работать с программой ChemPen3D.
Глава 5 Построение графиков и диаграмм
• Оформление диаграмм
• Построение графиков и диаграмм в Excel
• Построение графиков и диаграмм в Word
• Обмен данными между приложениями Microsoft Office
Используя графики, вы сможете гораздо нагляднее представить данные, содержащиеся в работе. Диаграммы оживляют числа, с их помощью значения могут превратиться в рисунки, на которых отобразится тенденция изменения данных. Строить диаграммы можно как в текстовом редакторе Word, так и в табличном процессоре Microsoft Excel, после чего вставлять их в документ.
Диаграмма в тексте выглядит точно так же, как и рисунок. Поэтому в дипломной, курсовой либо какой-то другой работе ее следует оформлять соответствующим образом – она обязательно должна иметь подпись, начинающуюся со слова «Рис.», после которого следует номер рисунка. Подпись располагают обязательно в нижней части диаграммы. Никаких других заголовков не требуется. Для лучшего понимания, что именно отображено на диаграмме, возле ее осей располагают подписи значений, а рядом размещают таблицу с описанием значений цветов элементов диаграммы. В этой таблице должно быть написано не что-нибудь вроде малопонятного ряд 1 (именно это появится там автоматически, если диаграмма не оформлена должным образом) – здесь необходимо указать, что означает каждый элемент диаграммы того или иного цвета. Фон должен быть белый, никаких дополнительных линий, кроме осей, не допускается. Кроме этого, в тексте работы помещают ссылку на диаграмму в таком же виде, как и на обычный рисунок, – «рис. номер».
5.2. Построение графиков и диаграмм в Excel
В первую очередь необходимо определиться в базовых понятиях. Диаграмма – это графический способ отображения некоторых числовых данных таблицы. Она всегда связана с таблицей значений, в которой размещены числовые данные, собственно представленные в диаграмме. Поэтому построение диаграммы осуществляется либо одновременно с созданием таблицы значений, или после этого. В строках таблицы значений отображены серии данных – наборы чисел, которые будут воспроизведены на вертикальной оси диаграммы, также называемой осью значений. На диаграмме классического вида – гистограмме – серии данных отображаются в виде столбцов одинакового цвета. Столбцы таблицы значений представляют собой категории. Они отображаются на диаграмме вдоль горизонтальной оси, которая также называется осью категорий.
Ознакомительная версия.
