В первую половину июня английские корабли несколько раз пытались сбить советскую флотилию с занимаемых ею позиций в районе реки Топса, но северодвинцы отразили все их атаки, причинив при этом повреждения монитору и двум канонерским лодкам. На минных заграждениях, поставленных флотилией, противник потерял два тральщика. В напряженных боях был сорван замысел интервентов по захвату Котласа. Враг, понеся большие потери, оказался вынужденным перейти к обороне.
Летом 1919 г. общая обстановка на фронтах гражданской войны начала складываться в пользу Красной Армии. Колчак, потерпев тяжелые поражения, поспешно отступал на восток. Было сорвано первое наступление Юденича на Петроград. Закончилась крахом новая авантюра белофиннов в районе Олонец, Петрозаводск.
Таким образом, угроза соединения интервентов с Колчаком и Юденичем отпала. Провалились планы расширения агрессии на Севере.
Усиливалось сопротивление трудящихся в тылу захватчиков. Жесточайший террор, репрессии и запугивания не могли сломить воли советских людей к борьбе за Советскую власть. На оккупированной интервентами территории ширился фронт подпольной работы, развивалось партизанское движение, в котором активно участвовали многие бывшие матросы флотилии Северного Ледовитого океана. Вспыхивали волнения и восстания в белогвардейских войсках.
Под влиянием большевистской агитации иностранные солдаты и матросы начали сознавать грабительский, захватнический характер войны империалистов против Советской республики. Они все настойчивее требовали прекращения интервенции и отправки их на родину. Участились случаи неповиновения целых частей: в январе 1919 г. отказались подчиняться своему командованию несколько подразделений, действовавших на Мурманской дороге, и французский полк, а весной — 67-й итальянский полк. Волнения усиливались также в американских и английских частях.[73] Ширилась интернациональная солидарность трудящихся капиталистических стран с Советской республикой. Английские рабочие требовали отозвать войска из России и прекратить войну. Массовые забастовки и демонстрации проходили под лозунгом "Руки прочь от России!".
Поражения на фронтах, рост революционных настроений в оккупационных войсках, политические выступления рабочего класса в крупнейших капиталистических странах вынудили империалистов Антанты и США принять решение о выводе своих вооруженных сил из европейской части Советской России. Однако интервенты не прекращали боевых действий до последнего дня пребывания на советской земле. 1 августа англичане попытались захватить Онегу, освобожденную частями Красной Армии и восставшими солдатами 5-го северного белогвардейского полка. Под прикрытием кораблей интервенты высадили десант из 700 солдат. Но он решительными действиями советских войск был разгромлен.
В ночь на 10 августа английское командование предприняло наступление на северодвинском направлении с целью обеспечить благоприятные условия для отвода своих войск в Архангельск и замены их белогвардейскими частями. Совершив глубокий обходный маневр, интервенты вышли в тыл советским войскам и речной флотилии. Для ликвидации прорыва врага корабли флотилии высадили десант. При поддержке корабельной артиллерии моряки решительной атакой выбили неприятеля из деревни Чудиново, но под давлением превосходящих сил интервентов были вынуждены отойти. Тогда канонерские лодки "Павлин Виноградов" и "Карл Либкнехт" обрушили на врага мощный огонь своих орудий. Понеся большие потери, англичане бежали. И на этот раз наступательные действия противника были сорваны.
Командование 6-й армии, получив сведения о готовящейся эвакуации иностранных войск, решило сорвать ее и разгромить интервентов. Общее наступление частей Красной Армии и флотилии на Северном фронте началось 4 сентября. При поддержке артиллерии кораблей оборона противника была прорвана. Войска фронта заняли несколько населенных пунктов. Тральщики успешно проделали проходы в двух минных заграждениях врага, и артиллерийские корабли получили возможность продвигаться вперед, поддерживая наступавшие части.
Под ударами Красной Армии рухнули планы интервентов на организованный отход и планомерную эвакуацию своих войск. К тому же в те дни резко понизился уровень воды в реке. 17 сентября па Чакомском перекате англичане вынуждены были взорвать мониторы «М-25» и "М-27".[74] В ночь на 27 сентября последние английские корабли поспешно покинули Архангельск. Белогвардейские войска генерала Миллера еще некоторое время продолжали удерживать свои позиции, но вскоре под ударами Красной Армии начали отступать. Однако продвижение Северо-Двинской флотилии задержалось из-за магнитных мин, которые впервые в истории были применены английскими кораблями для прикрытия отхода своих войск. Средств борьбы с ними тогда еще не было не только у советского флота, но и у самих англичан.
Морякам флотилии пришлось затратить немало усилий, чтобы ликвидировать минную опасность. В сентябре в составе флотилии имелось лишь 11 тральщиков, поэтому к тральным работам привлекались и другие корабли. Для ускорения работ минный отряд был усилен 150 матросами.[75] Применение обычных тралов не давало результатов. Более того, попытка уничтожить новые мины с их помощью закончилась подрывом трех тральщиков.
29 октября водолазам удалось вытащить магнитную мину. Минеры после тщательного ее изучения разработали несколько конструкций тралов, но это не дало большого эффекта. Помогла флотская смекалка: моряки быстро углубили обходный фарватер и по нему провели корабли. 13 октября они смогли возобновить огневую поддержку частей Красной Армии, встретивших сопротивление белогвардейцев в районе реки Шипилиха. Совместными усилиями кораблей и сухопутных войск противник был выбит с занимаемых им позиций. Однако в связи с приближением ледостава кораблям пришлось уйти на зимовку. Наступление временно приостановилось.
В начале 1920 г. наступательные действия 6-й армии возобновились. Флотилия выделила для борьбы на суше отряд из 736 моряков и сформировала бронепоезд "Красный моряк". Наступление развивалось успешно. Трудящиеся Северного края оказывали активную поддержку наступающим частям Красной Армии. Под ударами советских войск солдаты белогвардейских частей начали сдаваться в плен целыми подразделениями. 20 февраля 1920 г. войска 6-й армии вступили в Архангельск. Перед этим в городе вспыхнуло восстание рабочих и матросов. Восставшие освободили из тюрем политических заключенных, вступили в бой с остатками белогвардейских войск и помешали им увести корабли и суда, находившиеся в Архангельске, в том числе линкор «Чесма», 2 миноносца, подводную лодку "Св. Георгий", 2 посыльных судна, 6 тральщиков, ледокол «Святогор».
