28 ноября вместе с вышедшим из Коломбо конвоем пленные были доставлены в Суэц, где всех, исключая тех, кто был на «Орвието», перевели на крейсер «Хэмпшир». Находящиеся на «Орвието» 2 декабря были доставлены в Порт-Саид. Там их уже ждал стоявший на бочке «Хэмпшир».
В Порт-Саиде пленным было объявлено, что их везут не в Англию, а на Мальту. Капитан 2 ранга Мюллер и все находившиеся с ним на лайнере офицеры и матросы «Эмдена» были также собраны на «Хэмпшире». Капитан 1 ранга Грант встретил их очень тепло, объявив немецких офицеров «гостями кают-компании», а Мюллеру даже уступил свою каюту, временно перебравшись в командирский «закуток» позади штурманской рубки.
В Порт-Саиде пленным офицерам закупили гражданскую одежду, а матросов переодели в английскую форму без знаков различия. Будучи на «Хэмпшире», пленные моряки «Эмдена» узнали о победе эскадры адмирала Шпее у Коронеля.
В воскресенье 6 декабря «Хэмпшир» пришел в Ла-Валетту, где пленных свезли на берег. После теплого гостеприимства, оказанного им английскими моряками, они могли едва ли ожидать подобного от английской военной полиции, охранявшей военнопленных. Капитан 2 ранга Мюллер вместе со своими офицерами был отправлен в лагерь Вердала, а старшины и матросы — в лагерь Сент-Клементо, а позднее на форт Сальваторе.
Мюллеру и его экипажу предстояло провести долгие годы в лагере военнопленных. Для динамичной и деятельной натуры капитана 2 ранга Карла фон Мюллера это была настоящая пытка. Пытка вынужденным бездействием, когда пожар войны полыхал над миром, а его страна сражалась за свое существование. Целыми днями Мюллер писал письма семьям своих погибших моряков, а затем пытался описать историю «Эмдена» и восстановить все подробности последнего боя своего крейсера. Его часто видели погруженным в размышления, молча прогуливавшимся по каменным плитам крепостного дворика, где размещался офицерский лагерь. С «Эмденом» было покончено, но его верные угольщики пережили своего патрона.
За день до гибели крейсера, 8 ноября 1914 года, лейтенант Лаутербах с 16-ю матросами повел угольщик «Эксфорд» к острову Сокотра в западной части Индийского океана, чтобы там ожидать «Эмден», поскольку Мюллер планировал перенести район операций к выходу из Красного моря. «Эксфорд» тщетно прождал «Эмден» в условленном месте до конца ноября, а затем пошел в направлении Паданга на западном побережье Суматры.
11 декабря, находясь в видимости берега, «Эксфорд» держался в пятимильной зоне, где на него просто наткнулся английский вспомогательный крейсер «Гималайи». Лаутербах пытался доказать, что «Эксфорд» находится под защитой голландского нейтралитета, но англичане слушать ничего не захотели. Сопротивление было невозможно. Лаутербах и его 16 матросов были пересажены на английский вспомогательный крейсер «Эмпресс оф Джапан», который 15 декабря доставил их в Сингапур. Пленных отправили в лагерь Танглин, где их радостно встретили моряки «Эмдена», захваченные на «Понтопоросе» и «Маркоманнии». Оба судна 12 октября были захвачены английским крейсером «Ярмут». «Маркоманнию» успели затопить, а «Понтопорос» был приведен в Сингапур.
15 февраля 1915 года в Сингапуре взбунтовался полк 5-й Индусской пехотной дивизии и освободил немецких военнопленных. Английские войска подавили бунт и переловили почти всех освобожденных пленных отправив их от греха подальше в Австралию. Но лейтенанту Лаутербаху удалось бежать во время бунта из Сингапура. Пережив массу приключений, лейтенант сумел добраться до Голландской Индии, откуда прибыл в Соединенные Штаты. Добравшись до Нью-Йорка, Лаутербах сел там на пароход и в октябре 1915 года вернулся в Германию. Он был произведен в обер-лейтенанты и с января 1916 года по ноябрь 1917 года командовал вспомогательным кораблем "К".
В соавторстве с журналистами Лаутербах написал несколько книг о своих приключениях.
Из содержавшихся на Мальте попытку побега совершил только лейтенант Фикенчер. Бежав из лагеря, он некоторое время скрывался в Ла-Валетте, а затем на простой весельной лодке добрался до Сицилии. Однако, к этому времени Италия уже находилась с Германией в состоянии войны, и лейтенант просто попал из одного плена в другой. Позднее он был обменен по линии Красного Креста и 21 октября 1917 года вернулся к себе домой в Аугсбург.
В октябре 1916 года капитана 2 ранга Мюллера неожиданно переправили с Мальты в Англию. В сентябре 1917 года Мюллеру удалось бежать из лагеря, но он был вскоре пойман и в ноябре 1917 года приговорен к 56 суткам одиночного заключения. В январе 1918 года из-за серьезного ухудшения здоровья (приступы тропической малярии) Мюллер был отпущен из плена, прибыл в Роттердам и был интернирован в Голландии. Дав слово чести не участвовать в войне, бывший командир «Эмдена» получил разрешение съездить в свой родной город Бланкенберг в Гарце.
В начале 1918 года Германия была уже далеко не той страной, которую помнил Мюллер. Патриотический энтузиазм августа 1914 года давно растаял без следа. Об «Эмдене» и его славных делах почти забыли. Говорили о Вердене и Ютланде, о мясорубках и газовых атаках на Западном фронте, о вступлении в войну Соединенных Штатов, о мятежах на флоте, о стачках на военных заводах, о голоде, порожденном английской блокадой.
Страшная война с миллионами погибших коренным образом изменили страну и народ. Газеты, с первых страниц которых имя капитана 2 ранга Мюллера когда-то не сходило, едва заметили его возвращение. Еще в 1914 году Мюллер был награжден Железным Крестом 1 и 2 класса, но кого можно было теперь этим удивить. Железные Кресты всех классов тысячами раздавались рядовым, подбившим английские танки или отбившим у французов собственные траншеи. В связи с этим Главный Морской Штаб — единственное место, где о Мюллере еще помнили, — решил отметить одного из лучших командиров Германского флота, представив его к высшей боевой награде — Большому Кресту за доблесть — «Пулл ля Мерит».
Представление по инстанции было направлено в Военно-Морской кабинет Кайзера, который возглавлял адмирал фон Мюллер — однофамилец командира «Эмдена». Адмирал фон Мюллер реагировал весьма холодно. В частном письме начальнику Главного Морского Штаба адмиралу фон Гольцендорфу он заметил, что если бы не популярность в стране командира «Эмдена», его следовало бы отдать под суд за непродуманные действия у Кокосовых островов, приведшие к потере корабля. Адмирал фон Гольцендорф ответил длинным рапортом на имя главы Военно-Морского кабинета, где указывал, что несмотря на очевидные ошибки, командир «Эмдена» по совокупности своих действий заслужил награду, к которой его представил Главный Морской Штаб. Рапорт был препровожден непосредственно Кайзеру, который несмотря на все, еще сохранил в своей душе остатки предвоенного романтизма.
