Всех приходящих к ней она наставляла хранить православную веру и соблюдать Божии заповеди. Блаженная Матрона всегда скорбела о тех, кто забывал Бога. Известны случаи, когда, наставляя обращающихся к ней за помощью, она говорила, характеризуя их духовное состояние: «Они все кресты побросали, только ищут здоровья, чтоб им Бог дал».
Помимо молитвенной помощи и духовного совета блаженная иногда делала совершенно неожиданные предсказания. Незадолго до Великой Отечественной войны, также как и перед революцией 1917 года, она неожиданно сказала окружавшим ее: «Вот сейчас вы все ругаетесь, делите, а ведь война вот-вот начнется. Конечно, народу много погибнет, но наш русский народ победит». А когда началась война, блаженная Матрона просила всех приходящих к ней приносить ивовые ветки. Она их ломала на палочки одинаковой длины, очищала от коры, и молилась. Хожалки блаженной потом вспоминали, что пальцы ее были в ранках.
Примерно в это же время блаженная Матрона оказалась практически на улице. Она вынуждена была поселиться в Сокольниках в летней фанерной постройке. В военное время жить в Москве без прописки даже тем, кого не обвиняли в «религиозной пропаганде», было достаточно опасно. Уже с началом холодов блаженную навестила дочь ее односельчанки Евдокии Ждановой Зинаида. Узнав о тяжелом положении блаженной Матроны, она не только пригласила ее вместе с хожалками к себе, но и прописала их в своей квартире в Староконюшенном переулке. Там они прожили несколько лет. Блаженная Матрона оказывала большую молитвенную поддержку этой семье. Но уже по окончании войны местные власти обратили внимание на очаг «религиозной пропаганды». В результате дочь квартирной хозяйки Зинаиду арестовали за «религиозно-монархический заговор». Блаженной Матроне вновь пришлось переехать.
Переселившись на другое место, блаженная Матрона продолжила свой молитвенный подвиг. Приходящие к ней впоследствии вспоминали, как, принимая их, блаженная читала молитвы. Обычно это были известные молитвословия, читаемые в храме и дома: «Отче наш», «Да воскреснет Бог», девяностый псалом, «Господи Вседержителю, Боже сил и всякия плоти» (из утренних молитв). Она всегда подчеркивала, что помогает не сама, а Бог по ее молитвам. Поэтому, исцеляя болящих и одержимых, блаженная Матрона всегда призывала их к вере.
В этом плане показателен такой случай. Однажды по совету знакомых к блаженной обратилась одна женщина — ярая коммунисткабезбожница и к тому же политработник. Эту женщину постигло большее горе — ее супруг погиб на фронте, а их единственный сын сошел с ума. «Я пришла к вам от отчаяния, — сказала она, — мне идти некуда». Блаженная Матрона спросила ее: «Если Господь вылечит твоего сына, поверишь ли ты в Бога?» Женщина сказала: «Я не знаю, как это — верить». Тогда блаженная Матрона попросила воды и в присутствии несчастной матери стала громко читать над водой молитву. Подавая ей затем эту воду, блаженная сказала: «Поезжай сейчас в Кащенко (психиатрическая больница в которой лежал сын этой женщины), договорись с санитарами, чтобы они его крепко держали, когда будут выводить. Он будет биться, а ты постарайся плеснуть этой водой ему в глаза, и обязательно попади в рот». Она приехала в больницу и все сделала, как велела блаженная Матрона. Там был зал, куда с одной стороны барьера вывели ее сына, а она подошла с другой стороны. Пузырек с водой был у нее в кармане. Сын бился и кричал: «Мама, выброси то, что у тебя лежит в кармане, не мучай меня!» Ее поразило: откуда он узнал? Она быстро плеснула водой ему в глаза, попала в рот, вдруг он успокоился, глаза стали ясными, и он сказал: «Как хорошо!» Вскоре его выписали, и мать пришла благодарить блаженную Матрону.
Другой подобный случай, когда за помощью к блаженной Матроне обратились также неверующие люди — военный с женой. Их дочка стала одержимой — естественно никакое лечение помочь не могло — поскольку с точки зрения психиатрии девушка была совершенно нормальной. Тогда по совету случайной знакомой родители отвели девушку к блаженной Матроне. После того как блаженная почитала над девушкой молитвы — она полностью исцелилась.
Всем обращающимся к ней за молитвенной помощью блаженная Матрона советовала вести нравственную христианскую жизнь и никого не осуждать. Таким образом, многих она привела к вере и покаянию. Другие же, напротив, получив помощь остались равнодушны к наставлениям блаженной. Но блаженная Матрона по-прежнему молилась и за праведников и за грешников; и за почитателей и за недоброжелателей.
Последние годы жизни блаженная Матрона провела в доме у дальних родственников на подмосковной станции Сходня. Несмотря на старость и слабость блаженная по-прежнему старалась принимать всех приходящих к ней. В то же время внутренняя духовная жизнь блаженной осталась сокровенной не только для посетителей, но и для самых близких к ней людей. Известно лишь, что блаженная Матрона, не имея возможности посещать храм, часто просила родственников пригласить священника исповедовать и причастить ее.
В эти годы, когда восстановление страны после войны привело к улучшению благосостояния, блаженная сетовала на общее обмирщение жизни, на равнодушие к вере и на суеверия. К сожалению, в представлении многих и сама блаженная стала частью общего суеверия — слухи и сплетни, зародившиеся еще в прежние годы, падали на благодатную почву. Люди и молодые и уже пожилые, не имевшие твердой веры, хотели получить помощь, но никак не хотели менять свою жизнь. Блаженная обличала их пороки и старалась наставить на путь истинный. Но часто блаженная Матрона и сама понимала, что людей настроенных лишь на мирское благополучие трудно обратить к Богу. Тогда она обращалась к ним по-другому, она уговаривала их соблюдать Божии заповеди, говоря, что за это Бог пошлет им благополучие и достаток.
И, несмотря на общее обмирщение окружающих и равнодушие их к вере, блаженная Матрона неоднократно предсказывала возрождение церковной жизни в России, чем несказанно изумляла окружающих. Так землякам и родственникам, приезжавшим к ней за советом, она говорила, что церковь в Себине будет открыта: «Откроется церковь, куда она денется, откроется».
Заранее предчувствуя конец своей жизни, блаженная неоднократно говорила об этом близким людям. Некоторые понимали ее, некоторые же считали ее слова обычной старческой болтовней.
Сама блаженная Матрона часто задумывалась о месте своего погребения. Ей очень хотелось лежать на Даниловском кладбище, рядом с которым есть храм, как говорила она сама: «чтобы слышать службу». Узнав об этом, одна из почитательниц блаженной, церковница Параскева, трудившаяся в храме Ризоположения на Донской улице, предложила ей место на своем участке, рядом с могилой своей матери. Блаженная очень обрадовалась и согласилась. Также они с Параскевой