Еще в 1938 г. Кароль Войтыла поступил в Ягеллонский университет на философский факультет. 6 сентября 1939 года 184 преподавателя Ягеллонского университета были арестованы и отправлены в Заксенхаузен; Войтыла начинает подпольную учебу; работает каменотесом на шахте Закжувек. Затем – на химзаводе в Борек – Фаленцки, вплоть до поступления в подпольную семинарию осенью 1942 года.
Для Польши годы после смерти Ю.Пилсудского и до начала Второй мировой войны были временем довольно трудным, когда смогли выйти наружу самые противоречивые настроения общественности, во многом определявшие новую политику власти, повлиявшую на предвоенную ситуацию.
Польское правительство в межвоенный период относилось к своей оппозиции очень сурово. Несмотря на это, польские политические партии именно в данный исторический период достигли своего расцвета и получили расположение общественных кругов. Только польская Коммунистическая партия была распущена в 1938 году. Это произошло по не выясненной причине и многие современники считали, что роспуск был санкционирован из Москвы. Интересен тот факт, что юридическая система работала практически независимо от правительства, а университетская среда в данное время являлась оплотом антиправительственных настроений, не испытывая каких-нибудь репрессий и ограничений со стороны властей.
Неверно считать, что антисемитизм в Польше в межвоенный период являлся частью государственной политики Начальника государства. Сам Ю. Пилсудский не испытывал сильной враждебности к евреям, равно как и к представителям различных религиозных конфессий и не проводил каких – либо мер против иудеев. Но вот именно после его смерти националистические идеи стали ускоренными темпами набирать силу, приобретать множество сторонников, стремившихся их реализовать. Данное явление носило не организованный, а стихийный характер, наиболее ярко проявляясь преимущественно в сельской местности, на периферии, где население отличалось низким уровнем общей культуры.
Польский антисемитизм получил свое оформление еще в XIX веке, а основой ему послужили сложные социальные и политические процессы, столетиями влиявшие на взаимоотношения народов, проживавших на польских землях. Еврейское население всегда составляло немалое число жителей Речи Посполитой, при этом терпело притеснения и унижения со стороны практически всех народов многонациональной «Республики Польской», как в переводе звучало название государства.
Что касается отношения церкви к нарастающей волне антисемитских настроений, следует отметить тот факт, что в рядах антисемитов было немало сельских священников, а важную роль в процессе вовлечения духовенства в антисемитскую пропаганду сыграло заявление архиепископа Гнезно и Примаса Польши Августина Глонда в церковном послании что «евреи борются против католической Церкви». Также Примас заявлял, что евреи «стоят в авангарде безбожия, большевизма и низвержения власти… Не требует доказательства тот факт, что евреи обманщики, стяжатели и сводники. Фактом является и то, что влияние молодых евреев в сфере религии и морали на польскую молодежь крайне отрицательно». Однако духовенство в основной своей массе не принимало антисемитских настроений и критиковало националистическую политику новой власти. Одним из непримиримых противников национализма и антисемитизма был упомянутый нами выше архиепископ краковский Адам Стефан Сапега. Архиепископ скрывал в монастырях и церковных помещениях и частных домах большое число евреев, которым выдавал документы на новое имя и свидетельства о крещении. Он был наставником и покровителем подпольно обучающихся семинаристов. На него ровнялась молодежь в среде священства.
Отношение самого Иоанна Павла II к евреям на протяжении всей его жизни было доброжелательным и дружественным. С детских лет Войтыла много общался со своими сверстниками-евреями, в школьные годы дружил со своей соседкой Гинкой Беер, которая на два года была старше его. Гинка часто приходила к Войтылам домой и уважала Кароля Войтылу-старшего, отца Лолека, своего школьного друга. Войтыла-старший сам всегда искренне доброжелательно относился к евреям и так же воспитывал своего сына. Гинке удалось получить разрешение на отъезд в Палестину сразу после окончания школы, и прощаться она зашла только к Войтылам. В дальнейшем она вспоминала, что еще в те далекие 30-е годы поняла, что «не все поляки такие хорошие», как эта семья. Родителям Гинки так и не удалось переехать к ней в Палестину: мать погибла в Освенциме, а отца расстреляли в СССР.
В 1942 году Войтыла поступил в семинарию, которая после ареста пяти семинаристов, произведенного гестапо, перешла в подполье. Набор семинаристов, поступивших в 1942 году, был первым из курсов, обучавшихся в подполье. Этот факт не мог не оказать определенного влияния на душевный настрой учащихся. Жизнь и учеба в подполье усилила патриотические настроения студентов. Войтыла некоторое время (до осени 1944 года) продолжал работу на химической фабрике и семинарскую учебу.
В течение долгой жизни Кароль Войтыла много раз оказывался в смертельной опасности, в бытность его Понтификом, на Войтылу 13 мая 1981 года было совершено покушение, заказчики которого так и не были установлены. Много раз вследствие болезни или несчастного случая Папа Иоанн Павел II находился при смерти. Но всегда судьба хранила его. Первый раз серьезная опасность жизни будущего Папы угрожала в 1944 году. 29 февраля, когда он возвращался с работы на фабрике, Войтыла был сбит немецким грузовиком и оказался в больнице. Офицер, сбивший Кароля, не стал убивать его, а отправил пострадавшего на другой машине в больницу. У Войтылы оказалось очень сильное сотрясение мозга, и пострадала рука, но он выжил. Это событие будущий Понтифик расценил как доказательство того, что жизненный путь был выбран правильно и Богу будет угодна его жизнь.
Полностью Войтыла ушел в подполье после того, когда начались облавы на возможных участников Варшавского восстания 1 августа 1944 года. В августе были арестованы и расстреляны многие друзья и знакомые Кароля, в том числе однокурсник Ежи Захута. Облава была устроена и на дом, в котором жил Кароль, когда он находился там. Кароль спрятался в полуподвальном помещении, и по неизвестной причине немцы не стали спускаться туда. После этого инцидента Войтыла перестал приходить домой и переселился на квартиру Адама Сапеги, а его имя было исключено из списков рабочих фабрики. Для властей, фашистов и большинства знакомых Войтыла бесследно исчез.
Свою учебу в семинарии Кароль Войтыла завершил в 1946 году. Теперь основной задачей будущего священника стала подготовка к принятию духовного сана. Прежде чем получить сан священника, кандидату предстояло быть посвященному в нижние духовные должности. Два низших духовных чина Войтыла получил еще в 1944 году, а в 1945 получает также два других младших чина. 20 октября 1946 года кандидат Кароль Войтыла был возведен в сан дьякона самим Адамом Сапегой, к этому времени уже ставшим кардиналом. Следующей ступенью иерархии было священство.
Согласно церковной традиции, перед рукоположением в священники кандидат должен провести в уединении и молитве 6 дней. День рукоположения Войтылы был выбран 1 ноября, когда Церковь празднует торжество Всех святых.
Войтыла был единственным кандидатом на посвящение в сан в это день. Рукоположение совершал архиепископ кардинал Сапега в своей личной часовне.
Посвящение в сан в Католической Церкви происходит на торжественной литургии, когда кандидат, облаченный еще только в альбу (белую длинную одежду с поясом), ораль и епитрахиль, опускается на колени перед епископом, который совершает обряд. На левой руке кандидата переброшена риза, а в правой горит свеча. Затем руководители семинарии должны подтвердить, что данный кандидат достоин посвящения в сан, а епископ (архиепископ, кардинал, человек в любой церковной должности, имеющий сан епископа) говорит, что посвящаемый теперь обязуется быть совершенным в вере и своих действиях. Кандидат перед епископом и алтарем падает ниц, распростерши руки ввиде креста, а в это время произносятся молитвы в храме, которыми Церковь просит святых и Бога, чтобы кандидат был посвящен в сан Божьей силой. Затем, на голову стоящего на коленях кандидата епископ возлагает руки, призывая силу Святого Духа снизойти на посвящаемого. После совершения перечисленных обрядов епископ (лицо в любой церковной должности, обладающее епископским саном) облачает кандидата в священническую ризу. Звучит гимн Святому Духу. Связав руки кандидата лентой из белой ткани, епископ вкладывает в них чашу и дискос для причащения и говорит о том, что кандидат отныне получает право служить литургию. Кандидат, после того как ему освободят руки, передает зажженную свечу епископу и продолжает участие в литургии в качестве священника.
