В своей структуре Караул Смерти не придерживается строгой организации отрядов и рот, которую диктует Кодекс Астартес. Единственная рабочая тактическая единица в нем — истребительная группа, которая может быть организована и экипирована так, как капитаны Караула считают нужным. На одну миссию группа может выйти на мотоциклах, а на следующую — на могучем "Лендрейдере". Те боевые братья, у которых есть необходимые навыки, могут выйти на поле боя, одетые в массивные терминаторские доспехи, или в легкие бронежилеты разведчиков с плащом-хамелеоном. Иногда несколько истребительных групп объединяются в одну боевую группу — верный признак того, что им предстоит встреча с очень опасным противником.
Всем космическим десантникам, которые в Карауле Смерти впервые, неизбежно требуется некоторое время, чтобы приспособиться к этому чуждому способу организации. Особенно это касается орденов, которые строго следуют Кодексу Астартес, таких как Ультрадесант или его преемники. На практике, боевого брата, который не смог бы приспособиться, не пошлют в Караул Смерти, а те, которые смогли — превращаются в самых высокоэффективных воинов.
"Кто позволяет чужаку жить — тот разделяет грех его существования"
— Инквизитор Аполлион
Древние клятвы, согласно которым был сформирован Караул Смерти, обязывают его сражаться с ксеноугрозами, где бы они ни появлялись и какую бы форму ни принимали. Миссии, выполняемые Караулом Смерти, многочисленны и разнообразны — от стояния на страже главной угрозы до сопровождения инквизитора-охотника на ксеносов в безрассудной миссии за пределами известного пространства. Несмотря на разнообразие типов миссий, которые выполняет Караул Смерти, есть несколько основных, из которых формируется основа большинства операций.
Одна из самых простых, и одновременно самых сложных обязанностей Караула Смерти состоит в том, чтобы выдержать вечное и бессменное бдение против действий ксеносов. И на этом основана система крепостей и станций Караула. Каждая из них расположена в области, где есть известная угроза или в стратегически важном регионе, через который подобная угроза могла бы достичь имперских миров. Пример первого рода — станция Караула, размещенная на внешнем крае системы, известной как убежище для остатков древней расы ксеносов, и ее задача — препятствовать возвращению врага. Пример второго рода — крепость Караула, размещенная на пересечении известных варп-маршрутов, по которым передвигаются инопланетные захватчики.
Расследование потенциальных угроз — жизненно важная задача Караула Смерти. Часто вызывают отдельные истребительные группы, чтобы те выполнили зачистку области, в которой предположительно действуют опасные чужаки. Недавно обнаруженные миры, которые посещают Эксплораторы или Свободные Торговцы могут быть расценены как опасные и требующие расследования Караулом Смерти, иногда в сопровождении инквизитора или иных специалистов. Такие миссии могут быть очень рискованными, поэтому истребительные группы должны быть хорошо подготовлены к столкновению с любой угрозой. Эти миссии часто проходят в такой дали, где нет возможности получить подкрепление или эвакуироваться, если что-то пойдет не так, поэтому боевые братья должны приглядывать друг за другом и брать с собой как можно больше боеприпасов. Миссии по расследованию могут завести истребительную группу на разнообразные миры с разными условиями, и все её члены должны быть подготовлены к этому. Боевых братьев может ожидать форсирование раскаленной пустыни из раскрошенной кристаллической серы или кислотного болота, кишащего чуждыми хищниками. Со всей вероятностью, разведка природы любой возможной ксеноугрозы ограничена или несущественна, и поэтому группа должна быть готова столкнуться с любым противником — от диких варваров на летающих рептилиях, до существ с чрезвычайно развитыми психическими способностями. И цель этих миссий чаще состоит в том, чтобы наблюдать за природой угрозы так, чтобы истребительная группа, при содействии (если нужно), могла вернуться позже и уничтожить её.
"Зачистка" — миссия, в который Караул Смерти сталкивается с известным врагом, возможно, тем, за которым раньше наблюдала разведывательная группа. Её цель — очистить данную область, планету или всю систему от присутствия чужаков. Потому что Империум решил упрочить свое присутствие в области, которая должна быть безопасной от угроз, или потому что в ней планируется масштабная колонизация. В целом, Караул Смерти вовлекается в такие миссии, против таких врагов, с которыми у Имперской Гвардии и обычных сил Космического Десанта мало опыта сражений, что в случае Адептус Астартес указывает на действительно серьёзную угрозу. У Караула Смерти могут быть специальные навыки или обширный опыт сражений против подобных угроз, которого может недоставать другим доступным силам. Миссии по зачистке довольно различны по своим масштабам: от простой атаки на территорию, удерживаемую ксеносами, до изнурительной кампании против целого вида чужаков. Порой Империум терпит присутствие ксеносов на своей территории, пока те не угрожают ему, но некоторые расы чужих настолько мерзкие, что их присутствия нельзя допустить в принципе.
Особенно опасный тип миссии — ликвидация определенной цели. Задача подобной миссии состоит в том, чтобы убить определенного чужака, тем самым подорвав действия его подчиненных, так что другим Имперским силам достаточно внезапно появиться. Это одни из самых опасных миссий, которые выполняет Караул Смерти, и балансируют между риском потери чрезвычайно опытных и ценных воинов Караула Смерти и отказом от миссии. Несмотря на потенциальный риск, есть много чужих рас, против которых эта миссия может оказаться чрезвычайно эффективной. Например, тираниды, как известно, являют собой наиболее иерархизированную структуру из всех, какие только наблюдались — прогрессивные и высшие формы жизни управляют низшими. Кажется, что даже самые высшие формы не приказывают, а скорее направляют волю коллектива, поэтому убийство такого существа может оказать разрушительное действие на меньших существ. Несколько таких миссий были успешно проведены во время войны против флота-улья Бегемот, в котором небольшие элитные истребительные группы Караула Смерти высаживались на биокорабли тиранидов, с боем прорывались не по коридорам, а по артериям, и убивали организмы, управляющие целыми флотами. Подобный эффект наблюдался и в битвах с Тау. После убийства одного из касты эфирных, обычно хорошо скоординированные силы Тау были повергнуты в полный хаос и превратились в идеальная мишень для атаки.
