В сентябре 1938 года Л.Л. Ракова арестовали. Сотрудники НКВД обвинили его в участии в «меньшевистской террористической организации». Раков провел под следствием один год и четыре месяца и чудом не погиб. Прошел побои и издевательства, но упорно боролся за свою честь и жизнь. 10 декабря 1939 года вышло постановление о прекращении следствия: «Военная прокуратура просит опротестовать перед народным комиссаром тов. Берия постановление Особого отдела, как необоснованное. Дополнительное расследование обвинение не доказывает, а других компрометирующих материалов не добыто. Постановили: 1. Следственное дело № 57369-38 по обвинению Ракова Л.Л. за недостаточностью собранных улик прекратить. 2. Ракова Л.Л. из-под стражи освободить». Находясь под арестом, Раков пишет стихи и в каждое свое стихотворение вкладывает все то, что любил, чем дорожил: книги, город, Эрмитаж, близкие ему люди. После освобождения возвращается в Эрмитаж, где продолжает работу над новыми выставками. С началом войны мобилизован в народное ополчение, но через две недели, благодаря усилиям директора Эрмитажа И.А. Орбели, был переведен в политический отдел армии. С осени 1941 года прикомандирован к Ленинградскому фронтовому Дому Красной армии. Весной 1942 года Раков выступает инициатором создания выставки «Великая Отечественная война советского народа против немецких захватчиков». В 1943 году решением Военного совета Ленинградского фронта ему была поручена организация выставки «Героическая оборона Ленинграда». В короткий срок перед организаторами выставки стояла задача собрать косвенные материалы и первоисточники по теме…
Обстрелы города продолжались, Ленинград был в осаде, но работа над выставкой продолжалась, и 20 апреля 1944 года экспозиция «Героическая оборона Ленинграда» была открыта. Своей масштабностью, величием, достоверностью и трагедией, той, что пережил блокадный Ленинград, поражала посетителей, и в этом была заслуга устроителей выставки, ее идейных вдохновителей — историка Л.Л. Ракова и художника Н.М. Суетина.
В мае 1947 года Раков назначается на пост директора Публичной библиотеки. В 1949 году в результате развернувшихся процессов над руководителями ленинградской партийной и городской власти был уничтожен Музей обороны Ленинграда. Раков, как и многие другие ленинградцы, попали в так называемое «ленинградское дело».
«Ленинградское дело» — серия судебных процессов в конце 1940-х и в начале 1950-х годов против партийных и государственных руководителей РСФСР. Репрессиям подверглись руководители ленинградской областной, городской и городских районных организаций ВКП(б). Массовые аресты проводились не только в Ленинграде, но и по всей стране. Толчком для репрессий послужил скандал, связанный с прошедшей в Ленинграде оптовой ярмаркой, которая была учреждена в итоге сепаратного договора руководства города, Совета министров РСФСР, во главе которого стоял выходец из Ленинграда М.И. Родионов, и секретаря ЦК ВКП(б) А.А. Кузнецова. Скандал с ярмаркой стал дополнением уже к имеющемуся компромату на ленинградцев. Их подозревали в подтасовке в ходе выборов нового руководства на конференции ленинградской партийной организации. Реальной причиной «ленинградского дела» считается борьба группировок на верхушке власти. После смерти А. А. Жданова люди его команды были дискредитированы перед Сталиным. Ленинградское руководство подозревали в попытке перенесения столицы РСФСР в Ленинград, подготовке формирования Компартии РСФСР. То есть фактически в создании параллельного центра власти. Сталину не нравились слишком вольные измышления руководителей города Ленинграда и области. Они становились «врагами государства и изменниками Родины». Мораторий на отмену смертной казни 26 мая 1947 года был отменен.
12 января 1950 года Президиумом Верховного Совета СССР принят Указ «О применении смертной казни к изменникам родины, шпионам, подрывникам-диверсантам».
Из постановления бюро Ленинградского горкома ВКП(б) о Ракове Л.Л.: «Проверкой установлено, что Раков Л.Л. был одним из организаторов порочной экспозиции в Музее обороны Ленинграда. Экспозиция музея не отвечала сталинской периодизации Великой Отечественной войны. Оборона Ленинграда показывалась в отрыве от событий на фронтах Великой Отечественной войны, в ней затушевывалась забота партии и правительства и лично товарища Сталина о Ленинграде, умалялась роль рабочего класса и трудящихся в обороне Ленинграда. Вместе с тем экспозиция подхалимски восхваляла роль бывших руководителей обкома и горкома ВКП(б) — Кузнецова, Попкова, Капустина и других. Раков был инициатором создания портретной галереи ныне разоблаченной партийной группы. В экспозиции музея раскрывались секретные данные обстановки на бывшем Ленинградском фронте и обороны города (карты, таблицы, данные обстрела). Бывший руководитель Музея обороны Раков незаконно держал в музейных мастерских и в самом музее взрывчатые материалы, мины, боевые снаряды, патроны, пулеметы, винтовки, автоматы. Работая после музея директором Государственной Публичной библиотеки, Раков допустил засоренность кадров людьми, не вызывающими политического доверия, и враждебными элементами. Бюро горкома ВКП(б) постановило: 1. Снять Ракова Л.Л. с работы директора Государственной Публичной библиотеки. 2. Вопрос о партийной ответственности Ракова Л.Л. передать на рассмотрение парткомиссии ОК ЛГК ВКП(б). Подписал секретарь горкома ВКП(б) В. Андрианов».
20 апреля 1950 года Раков был арестован. 27 октября 1950 года следствие было закончено. Заслушивание дела происходило 31 октября 1950 года в закрытом судебном заседании в городе Москве, без участия обвинения и защиты и без вызова свидетелей.
Военная коллегия постановила: «Ракова Льва Львовича подвергнуть тюремному заключению на двадцать пять лет и с конфискацией всего лично ему принадлежащего имущества». В тюремной карточке было записано: «Измена Родине и антисоветская агитация».
Вот один из самых ярких документов «ленинградского дела»:
В. Абакумов
№ 6370/А «18» января 1950 года.
Совершенно секретно.
Центральный комитет ВКП(б) товарищу Сталину И.В.
При этом представляю список на остальных арестованных по «ленинградскому делу». МГБ СССР считает необходимым осудить Военной коллегией Верховного суда СССР в обычном порядке, без участия сторон, в Лефортовской тюрьме, с рассмотрением дел на каждого обвиняемого в отдельности.
Первое. — Обвиняемых, перечисленных в прилагаемом списке с 1-го по 19-й номер включительно: Соловьева, Вербицкого, Левина, Бадаева, Вознесенского, Курбатина, Вознесенскую, Бондаренко, Харитонова, Бурилина, Басова, Никитина, Талюш, Сафонова, Галкина, Иванова, Бубнова, Петровского, Чурсина, — к смертной казни — расстрелу, без права обжалования, помилования и с приведением приговора суда в исполнение немедленно.
Второе. — С 20-го по 32-й номер списка включительно: Григорьева, Колобашкина, Синцова, Бумагина, Бояр, Клеменчук, Кузьменко, Таирова, Шумилова, Никанорова, Хованова, Ракова и Белопольского, — к 25 годам заключения в тюрьму каждого.
Третье. — С 33-го по 38-й номер списка: Тихонова, Павлова, Лизунова, Подгорского, Ведерникова и Скрипченко, — на 15 лет заключения в особый лагерь каждого.
Прошу Вашего разрешения.
Абакумов
В. Абакумов
№ 7220/А 1950 год Совершенно секретно Центральный Комитет ВКП(б) товарищу Сталину И.В.
При этом представляем обвинительное заключение по делу Кузнецова, Попкова, Вознесенского, Капустина, Лазутина, Родионова, Турко, Закржевской и Михеева, всего в количестве девяти человек. Считаем необходимым осудить всех их Военной коллегией Верховного суда Союза ССР, причем основных обвиняемых Кузнецова, Попкова, Вознесенского, Капустина, Лазутина и Родионова, в соответствии с Указом Президиума Верховного Совета СССР от 12 января 1950 года, к смертной казни — расстрелу, без права помилования, с немедленным приведением приговора суда в исполнение. Турко — к 15 годам тюрьмы, Закржевскую и Михеева — к 10 годам тюремного заключения каждого. Состав суда определить: председательствующий — заместитель председателя Военной коллегии Верховного суда Союза ССР генерал-майор юстиции Матулевич И.О., члены суда — генерал-майор юстиции Зарянов И.М. и генерал-майор юстиции Детистон И.В. Дело заслушать в Ленинграде без участия сторон (прокурора и адвокатов) в закрытом заседании, без опубликования в печати, но в присутствии 100–150 чел. из числа партийного актива ленинградской организации. Слушание дела, с учетом необходимости тщательной подготовки судебного разбирательства, можно было бы, по нашему мнению, начать 25 сентября 1950 года. Просим Ваших указаний.
Абакумов, Вавилов
Из докладной записки С.Н. Круглова и И.А. Серова Н.С. Хрущеву о реабилитации родственников лиц, осужденных по «ленинградскому делу»:
