Каждая из рот имела особое назначение и использовалась штабом филиала как отдельная боевая единица:
1-я рота — предназначалась для проведения диверсионно-террористических операций в тылах советских воинских частей.
2-я — несла охрану территории штаба и состояла из фольксдойчей.
3-я рота под командованием Решетникова состояла из бывших советских военнопленных и применялась в антипартизанских акциях.
При формировании вышеназванных рот их личный состав состоял в основном из немцев и русских, служивших в 502-м егерском батальоне. Впоследствии роты пополнялись коллаборационистами. Так, рота Решетникова была создана на базе остатков антипартизанского отряда Мартыновского, созданного немцами в 1942 году на территории Ленинградской области. В 1944 году этот отряд действовал в Италии. В роте также служили люди, завербованные Решетниковым в лагере № 8 в городе Цешин (Чехословакия).
При штабе находились самостоятельные диверсионные группы по 15 — 18 человек в каждой. Группы постоянно находились в ожидании заброски в советский тыл партиями по 3 — 4 человека. Большинство членов этих групп ранее служили в полиции городов Порхова и Дриссы (Ленинградская область) и были завербованы осенью 1944 года в Данциге, где пребывали в сборном лагере для эвакуировавшихся пособников (гражданский лагерь Хог).
Все подразделения «СС Ягдвербанд Ост» делились на группы:
1) Балтийская группа под руководством штурмбаннфюрера СС Пехау готовила повстанческие группы для действий в Прибалтике и сеть агентуры для оседания. Кадры для них вербовались из числа членов антисоветских прибалтийских организаций. В августе 1944 года в Латвии балтийской группой была создана повстанческая организация «Межа кати» («Дикая кошка» — латв. или «Wilde Katze» — нем.). Организация состояла из ряда диверсионных групп, сформированных по принципу землячества и соответственно этому названных: латгальская, видземская, курземская и др. Штаб «Дикой кошки» располагался на хуторе Дравас Кубилюсской волости Кулдигского уезда.
В «Межа кати» вербовались военнослужащие латвийских дивизий СС, полицейских батальонов, айзсарги. Здесь они получали дополнительное «образование» и документы, свидетельствующие об их принадлежности к «Ваффен СС Ягдвербанд». Всего организация насчитывала в своих рядах более 1000 человек, многие из которых проходили спецподготовку при фронтовой разведгруппе 212 (бывшая абвергруппа-212). В начале 1945 года «кошачьи» диверсанты усилили свою деятельность в тыловых районах Советской армии. На их усиление были переброшены три группы под общим наименованием «Линда». Помимо диверсионно-террористической деятельности, «Межа кати» вела антисоветскую пропаганду, издавала газету «18 ноября», занималась созданием тайных лесных баз. После капитуляции Германии «Дикая кошка» перешла на нелегальное положение.
В качестве резерва «Межа кати» в Германии находились группа диверсантов-латышей ротенфюрера СС И. Рудынскиса и эстонская рота унтершарфюрера СС Алупкре. Обе группы были подготовлены к заброске на территорию Прибалтики.
2) Общерусская группа имела в своем составе южнорусскую подгруппу гауптштурмфюрера СС Кирша в селе Санта-Глаус в Чехословакии. Подгруппа Сухачева была подготовлена в чешском городе Трутнов (Траутенау). Украинская подгруппа во главе с Т. Бульбой-Боровцом размещалась в городе Альтбургунде.
В январе 1945 года при занятии Хохензальца передовыми советскими частями «СС Ягдвербанд Ост» был уничтожен, значительная часть руководящего и рядового состава погибла или была пленена. Из остатков формирования весной 1945 года на территории Чехословакии были созданы две группы, которые вели работу по переходу организации на нелегальное положение.
Истребительное соединение «Запад»
«СС Ягдвербанд-Вест» дислоцировался в Висбадене и вел разведывательно-диверсионную работу на Западном фронте против армий союзников СССР по антигитлеровской коалиции.
Филиал состоял из двух оперативных групп: «СС Ягдайнзатц-Норд-Вест» (г. Фленсбург) и «СС Ягдайнзатц-Зюд-Вест».
Истребительное соединение «Юг»
Филиал «СС Ягдвербанд-Зюд» в городе Тремсе вел работу на территориях Югославии, Албании и Испании. Филиал состоял из нескольких подразделений.
«СС Ягдвербанд-Зюд-Ост» дислоцировался в Вене и имел в подчинении оперативные группы «СС Ягдайнзатц Словакия», «Болгария» и «Хорватия», опираясь в своей диверсионно-террористической деятельности на националистические группировки этих стран.
Истребительное соединение «Север»
«СС Ягдвербанд-Норд» дислоцировался в городе Нойштрелиц близ Берлина.
Вся агентура «СС Ягдвербанд» подбиралась с учетом знания языка страны, где ей предполагалось действовать. Агенты изучали следующие специальные дисциплины: практику и теорию диверсионного дела, способы вывода из строя промышленных предприятий, знакомились с оружием советского, американского и английского производства. Обучение личного состава проводилось непосредственно в подразделениях. При необходимости мог быть организован выезд для дополнительной подготовки в войсковые школы СС (ваффеншулле). Так, для углубленного изучения парашютного дела курсанты выезжали в школу парашютистов в местечке Ойенхаузен близ Ганновера. Когда подготовленная часть диверсантов отбывала на выполнение задания, занятия в подразделениях не прекращались, а после возвращения с задания курсанты возвращались в свое подразделение и продолжали обучение. Инонациональный состав обучался отдельно от немцев и более конспиративно.
В конце 1944 года по приказу Скорцени была создана диверсионная спецшкола. До мая 1945 года она находилась на горе Шварценберг близ города Трутнова. Под учебные и жилые помещения были заняты строения бывшего дома отдыха офицеров ВВС. Школа вела подготовку диверсантов для совершения акций на железнодорожных магистралях в районах Витебска, Смоленска, Бобруйска, Минска. В марте 1945 года в учебную программу были внесены дополнения, курсанты стали также изучать методику ликвидации высшего комсостава Советской армии и партийных органов.
Курсантами школы были бывшие военнопленные, зарекомендовавшие себя на службе у оккупантов. Общее количество слушателей достигало 100 человек, в том числе несколько женщин. Все учащиеся были разделены на четыре взвода. Школой было подготовлено украинское подразделение истребителей танков (100 человек).
Накануне капитуляции Германии школа получила приказ о переподчинении начальнику войсковой группы генералу Штрахвицу для действий в районах, уже занятых советскими частями, но большая часть личного состава попала в плен к передовым частям американской армии.
500-й/600-й парашютно-десантный батальон войск СС
До включения в состав истребительного соединения войск СС 500-й (затем 600-й) парашютно-десантный батальон использовался в качестве самостоятельной боевой единицы для проведения специальных операций.
Первая попытка формирования парашютно-десантной части войск СС была предпринята в 1937 году, когда небольшая группа добровольцев из полка СС «Дойчланд» была направлена в центр подготовки парашютистов люфтваффе в город Стендаль. Курс обучения длился с 23 мая по 17 июля и был свернут после трагической гибели одного из курсантов. Вторая попытка создания отдельного подразделения парашютистов СС была предпринята в 1943 году. Основным толчком для принятия этого решения рейхсфюрером СС послужила удачная операция по освобождению Муссолини.
Набор добровольцев в парашютно-десантный батальон СС предполагалось вести из числа военнослужащих войск СС и из военнослужащих СС, осужденных за дисциплинарные поступки к пребыванию в штрафном лагере войск СС и полиции, а также штрафлагере СС Дахау и военной тюрьмы СС в Данциг-Матцкау. При возвращении в строй бывшим осужденным возвращались их прежние чины. При штабе батальона постоянно действовало специально созданное юридическое 3-е подразделение. Вновь сформированная часть носила наименование «500-й СС парашютно-десантный батальон». В целях прикрытия батальон был зашифрован как «штрафная часть войск СС». Первым командиром батальона был штурмбаннфюрер СС Герберт Гильхоффер.
В ноябре 1943 года личный состав батальона начал проходить курс парашютно-десантной подготовки в местечке Мадарушка-Баня близ города Сараево, где к тому времени располагалась 3-я школа воздушно-десантных подразделений люфтваффе. В самом начале 1944 года батальон был переброшен в район города Папу (Венгрия) для завершения курса обучения прыжкам. По окончании обучения часть личного состава была переброшена в Югославию и в апреле 1944 года прошла крещение огнем близ города Тузла в Боснии-Герцеговине.