При подготовке к исследованиям учёными было изучено более тысячи страниц подлинных документов из испанских архивов. Изучение «Сан Эстебана» стало настоящей полевой археологической лабораторией. Помимо подводных исследований были проведены раскопки на берегу, чтобы обнаружить лагерь выживших после катастрофы и спасательной экспедиции.
В течение сезона 1973 года были проведены основные подводные изыскания. На поверхность было поднято более чем 12 тысяч кг различных бытовых предметов. Самой массивной и ценной находкой стала часть кормы с килем. Они позволили оценить размеры судна и более тщательно его идентифицировать. В соответствии с полученными данными оно имело длину примерно 21—30 м и водоизмещение в 170—286 тонн. Так же был поднят якорь судна, оружие, инструменты, различные металлические изделия, серебряная монета и слиток. Среди интересных и ценных находок оказалось зеркало, сделанное из полированного пирита, и лезвия из обсидиана.
Таким образом, были обнаружены все три судна, входившие в злополучный Серебряный флот 1554 года.
Однако история на этом не заканчивается, поскольку большая часть серебра и по сей день находится на дне моря.
«Санта Мария де лос Ремедиос»
Безопасное использование тихоокеанских прибрежных маршрутов имело большое значение для Испании. Огромные богатства, добывавшиеся на копях в Перу, отправлялись затем в порты Арики и Кальяо. Оттуда сокровища перевозились морским путём в Панаму, через которую эти ценности и попадали в Карибское море. В дальнейшем хорошо вооружённый Флот Материка должен был доставлять их в Гавану и далее в Кадис.
В отличие от Карибского моря, где галеоны были хорошо вооружены и следовали крупными караванами для защиты от пиратов, испанские корабли в Тихом океане были практически беззащитны и потому не раз становились жертвами морских разбойников.
Не меньшую опасность представляли и подводные рифы и мели на побережье Чили, Перу, Эквадора и Колумбии. Одной из таких жертв стал галеон «Санта Мария де лос Ремедиос». Он отплыл в 1590 году из Кальяо в сторону Панамы в качестве капитаны эскадры из 4-х кораблей. На борту этих кораблей располагался один из самых ценных грузов, когда-либо перевозившихся из Нового Света
В грузовом манифесте значилось 12 тонн золота и 174 тонны серебра, 176 сундуков серебряной посуды и 7 сундуков золотой церковной посуды, 313 «коробок подарков», содержание которых остаётся тайной. В качестве пассажиров на борту располагались 46 торговцев, которые, по предположениям, везли не менее миллиона дукатов, поскольку направлялись на ежегодную ярмарку и планировали сделать большие закупки. Учитывая контрабанду, которая составляла до 50% от официальной части груза, можно с уверенностью сказать, что это судно несло груз стоимостью около 1 миллиарда долларов в современном эквиваленте.
Согласно архивным данным, армада покинула Перу в середине апреля и в начале мая остановилась в порту в заливе Манта, чтобы пополнить свои запасы и переждать вероятную опасность со стороны пиратов, появление которых испанцы опасались гораздо больше, чем штормов. Капитана, как наиболее ценный корабль, стояла ближе всего к берегу, что самым роковым образом сказалось на её судьбе.
4 мая сильнейший шторм пронёсся над заливом. Три корабля сопровождения успели сняться с якоря и выйти в море, чтобы продолжить свой путь, и ожидали только появления «Санта Марии». Однако, оказавшись в самой глубине бухты, галеон был отрезан от остальной эскадры. Испанцы не успели сняться с якоря, а сильнейший встречный ветер и штормовые волны сделали это совершенно невозможным. Единственным выходом было остаться в бухте и постараться удержаться на якорях.
Якорные канаты не смогли удержать тяжелогружёный галеон. Сорвавшись с якорей, «Санта Мария» напоролась на скалы у самого берега. На палубе началась паника. Моряки и пассажиры начали прыгать в самую большую из шлюпок и вскоре настолько перегрузили её, что она пошла на дно. Две другие шлюпки, спущенные на воду, были немедленно перевёрнуты волнами. В результате только 23 человека смогли спасти свои жизни и выбраться на берег.
Остальные корабли эскадры, не подозревая о катастрофе, отплыли далее в сторону Панамы, полагая, что капитана догонит их в пути. Только через три месяца после прибытия в порт власти узнали о трагической судьбе флагмана. Они немедленно попытались организовать спасательную операцию, однако сильные ветры и течения не позволили достичь залива Манта до сентября. За это время «Санта Мария» была окончательно разбита волнами. Индейцы-ныряльщики смогли извлечь не более 1% от затонувших сокровищ.
Спустя три года король послал другую экспедицию, поскольку груз галеона был слишком ценным, чтобы о нём можно было просто забыть, но она обнаружила ещё меньше, поскольку к тому времени пески окончательно занесли остатки судна на дне.
Сгрузив такие большие ценности на один корабль, испанцы сами поплатились за свою жадность. С тех пор любые попытки добраться до затонувшего груза заканчивались провалом.
В конце XVI века испанцы уже создали эффективно функционировавший торговый маршрут между испанскими владениями на Филиппинах и Мексикой, с большой выгодой для себя обменивали американское серебро на предметы роскоши из Китая. Однако нападение английского пирата Френсиса Дрейка на тихоокеанские владения испанской короны заставили власти задуматься об их более детальном изучении. Было принято решение исследовать калифорнийское побережье для поиска гаваней, в которых могли бы укрыться манильские галеоны от нападений пиратов и штормовой погоды.
Для выполнения этой миссии Филипп II выбрал Себастьяно Родригеса Цермено. Он зарекомендовал себя отличным навигатором и превосходным лидером по время плавания через Тихий океан в Манилу на корабле «Сан Педро». Однако возвратиться на этом галеоне обратно оказалось невозможно из-за его крайней изношенности. Потрепанный штормами, он имел сильную течь, корпус был изъеден морскими червями и сильно оброс кораллами. О плавании на таком судне не могло быть и речи. Тогда Цермено арендовал другое, более крепкое и новое — «Сан Августин», на котором и предстояло исполнить волю короля. Это был достаточно крупный корабль длиной 80 и шириной 23 фута. Своими габаритами он примерно соответствовал «Золотой Лани» Дрейка
«Сан Августин» оставил Манилу 5 июля 1595 года. Он был загружен шёлком, фарфором и золотом Корабль взял курс на северо-восток, пока не достиг 35° с.ш., где западные ветры направили его в Акапулько. Судно находилось в плачевном состоянии из-за сильных штормов по пути. Перегруженный галеон глубоко сидел в воде. Экипаж был вынужден проводить каждые два часа из трёх за помпами, откачивая поступающую воду.
Команда проявляла волнение и требовала от капитана, чтобы он немедленно направился в Акапулько, вместо того чтобы, как было предписано, заниматься описанием побережья и составлением карт.
Галеон достиг побережья Америки в районе мыса Мендоцино и направился на юг вдоль берега, пока не показался высокий горный хребет, выступавший далеко в море (ныне он называется Пойнт Рейс). Недалеко имелся удобный залив с речкой, что позволяло запастись пресной водой (сейчас это залив Дрейка, поскольку несколькими годами ранее в этом месте нашёл приют знаменитый английский пират).
Цермено вопреки желанию большинства членов команды приказал встать на якорь у входа в бухту. 7 ноября 1595 года он торжественно объявил окрестные земли владениями испанского короля. После этого большая часть команды высадилась на берег и разбила лагерь. В течение трёх недель они отдыхали на берегу, вступив в связь с очень дружественным индейским племенем, обменивая безделушки на продукты питания.
В конце ноября разразилась буря. Поскольку бухта не укрывала судно от южного ветра, «Сан Августин» был сорван с якорей и выброшен на песчаную отмель, получив множество пробоин в корпусе. Двое членов экипажа утонули. Остальные со страхом наблюдали, как штормовые волны разбивают тонущий корпус корабля.
Когда буря утихла, Цермено сумел спасти кое-какие запасы и часть шёлка, однако в целом положение испанцев оказалось весьма незавидным. Они находились на диком берегу, без средств к существованию и надежды на спасение.
Капитан оказался перед тремя выходами из ситуации: поселиться на месте крушения среди индейцев и ждать, пока другой корабль не появится на горизонте и спасёт их или пройти 1500 миль по побережью, пока не достигнут испанских поселений, или попытаться послать в Акапулько шлюпку с надеждой, что она доплывёт до порта. Цермено выбрал третий путь. 76 человек и собака погрузились в большую лодку и, хотя она была переполнена, отплыли с места крушения. Ей дали гордое название «Сан Бонавентура».