CpG, CpG-островки — участки ДНК, в которых находится большое количество динуклеотидов CpG, то есть высокий процент цитозина (С), за которым следует гуанин (G).
S-аденозилметионин — молекула, которая используется в качестве источника метильных групп, то есть молекула — донор метильных групп, которые метилируют другие молекулы (например, ДНК или гистоны).
Библиография
Введение
Esteller, М., «Noncoding RNAs in human disease», Nature Reviews Genetics, 12, № 12, ноябрь 2011.
Guil, S., Esteller, M., «DNAmethylomes, histone codesand miRNAs: tying it all together», The International Journal of Biochemistry & Cell Biology, 41, № 1, январь 2009.
Lopez-Serra, L., Esteller, M., «Proteins that bind methylated DNA and human cancer: reading the wrong words», British Journal of Cancer, 98, № 12, июнь 2008.
Глава 1
Fraga, M. E, Ballestar, E., Paz, M. E, S. ropero et al., «Epigenetic differences arise during the lifetime of monozygo tic twins», Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America, 102, № 30, июль 2005.
Heyn, H., Carmona, E J., Gomez, A., H. J. Ferreira et al., «DNA methylation profiling in breast cancer discordant identical twins identifies DOK.7 as novel epigenetic biomarker», Carcinogenesis, 34, № 1, январь 2013.
Javierre, В. М., Fernandez, А. Е, J. Richter et al., «Changes in the pattern of DNA methylation associate with twin discordance in systemic lupus erythematosus», Genome Research, 20, № 3, февраль 2010.
Глава 2
Buganim, Y., Faddah, D. A., Jaenisch, R., «Mechanisms and models of somatic cell reprogramming», Nature Reviews Genetics, 14, № 6, июнь 2013.
Humpherys, D., Eggan, К., H. Akutsu et al., «Epigenetic instability in ES cells and cloned mice», Science, 293 № 5527, июль 2001.
Theunissen, T. W., Jaenisch, R., «Molecular control of induced pluripotency», Stem Cells Research, 14, № 6, июнь 2014.
Глава 3
Heijmans, В. T, Tobi, E. W., A. D. Stein et al., «Persistent epigenetic differences associated with prenatal exposure to famine in humans», Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America, 105, № 44, ноябрь 2008.
Osborne-Majnik, A., Fu, Q., Lane, R. H., «Epigenetic mechanisms in fetal origins of health and disease», Clinical Obstetrics and Gynecology Journal, 56, № 3, сентябрь 2013.
Roseboom, Т. J., Painter, R. С., A. F. van Abeelen et al. «Hungry in the womb: what are the consequences? Lessons from the Dutch famine», Maturitas, 70, № 2, октябрь 2011.
Глава 4
Chong, S., Vickaryous, N., A. Ashe et al., «Modifiers of epigenetic reprogramming show paternal effects in the mouse», Nature Reviews Genetics, 39, № 5, май 2007.
Dolinoy, D. C., Weidman, J. R., Waterland, R. A., Jirtle, R. L., «Maternal genistein alters coat color and protects Avy mouse offspring from obesity by modifying the fetal epigenome», Environmental Health Perspectives, 114, № 4, апрель 2006.
Wolff, G. L., Kodell, R. L., Moore, S. R., Cooney, C. A., «Maternal epigenetics and methyl supplements affect agouti gene expression in Avy/a mice», The FASEB Journal, 12, № 11, август 1998.
Глава 5
Chittka, A., Wurm, Y., Chittka, L., «Epigenetics: the making of ant castes», Current Biology, 22, № 19, октябрь 2012.
Herb, B. R., Wolschin, E, Hansen, K. D., M. J. Aryee et al., «Reversible switching between epigenetic states in honeybee behavioral subcastes», Nature Neuroscience, 15, № 10, октябрь 2012.
Wang, X., Wheeler, D., Avery, A., A. Rago et al. «Function and evolution of DNA methylation in Nasonia vitripennis», PLoS Genetics, 9, № 10, el003872, 2013.
Глава 6
Enard, W., Fassbender, A., F. Model et al., «Differences in DNA methylation patterns between humans and chimpanzees», Current Biology, 14, № 4, февраль 2004.
Hernando-Herraez, I., Prado-Martinez, J., P. Garget al., «Dynamics of DNA methylation in recent human and great ape evolution», PLoS Genetics, 9, № 9, el003763, 2013.
Heyn, H., Moran, S., Hernando-Herraez, I., S. Sayols et al., «DNA methylation contributes to natural human variation», Genome Research, 23, № 9, сентябрь 2013.
Глава 7
Deng, X., Berletch, J. B., Nguyen, D. K., Disteche, С. M., «X chromosome regulation: diverse patterns in development, tissues and disease», Nature Reviews Genetics, 15, № 6, июнь 2014.
Maclary, E., Hinten, M., Harris, C., Kalantry, S., «Long noncoding RNAs in the Xinactivation center», Chromosome Research, 21, № 67, декабрь 2013.
Schulz, E. G., Heard, E., «Role and control of X chromosome dosage in mammalian development», Current Opinion in Genetics & Development, 23, № 2, апрель 2013.
Глава 8
Hancks, D. С., Kazazian, Н. Н. jr., «Active human retrotransposons: variation and disease», Current Opinion in Genetics & Development, 22, № 3, июнь 2012.
Konkel, M. K., Batzer, M. А., «А mobile threat to genome stability: The impact of nonLTR retrotransposons upon the human genome», Seminars in Cancer Biology, 20, № 4, август 2010.
Yoder J. A., Walsh, С. P., Bestor, T. H., «Cytosine methylation and the ecology of intragenomic parasites», Trends in Genetics Journal, 13, № 8, август 1997.
Глава 9
Anderson, О. S., Sant, К. E., Dolinoy, D. C., «Nutrition and epigenetics: an interplay of dietary methyl donors, onecarbon metabolism and DNA methylation», Journal of Nutritional Biochemistry, 23, № 8, август 2012.
Bertolo, R. E, McBreairty, L. E., «The nutritional burden of methylation reactions», Current Opinion in Clinical Nutrition and Metabolic Care, 16, № 1, январь 2013.
Fernandez, A. E, Esteller, M., «Viral epigenomes in human tumorigenesis», Oncogene, 29, № 10, март 2010.
Глава 10
Ausio, J., Paz, A. M., Esteller, M., «MeCP2: the long trip from a chromatin protein to neurological disorders», Trends in Molecular Medicine, pii: SI4714914 (14)000562. doi: 10.1016/j.molmed.2014.03.004, апрель 2014.
Berdasco, M., Esteller, M., «Genetic syndromes caused by mutations in epigenetic genes», Human Genetics, 132, № 4, doi: 10.1007/s004390131271 x, апрель 2013.
Javierre, В. M., Esteller, M., Ballestar, E., «Epigenetic connections between autoimmune disorders and haematological malignancies», Trends in Immunology, 29, № 12, doi: 10.1016/j.it.2008.08.008, декабрь 2008.
Portela, A., Esteller, M., «Epigenetic modifications and human disease», Nature Biotechnology, 28, № 10, октябрь 2010.
Urdinguio, R. G., Sanchez-Mut, J. V., Esteller, M., «Epigenetic mechanisms in neurological diseases: genes, syndromes and therapies», The Lancet Neurology, 8, № 11, ноябрь 2009.
Zaina, S., Heyn, H., Carmona, Varol F. J. et al., «А DNA Methylation Map of Human Atherosclerosis», Circulation Cardiovascular Genetics Journal, pii: CIRCGENETICS. 113.000441, август 2014.
Глава И
Esteller, m., «Epigenetics in cancer», The New England Journal of Medicine, 358, № 11, март 2008.
Heyn, H., Esteller, M., «DNA methylation profiling in the clinic: applications and challenges», Nature Reviews Genetics, 13, № 10, октябрь 2012.
Rodriguez-Paredes, М., Esteller, М., «Cancer epigenetics reaches mainstream oncology», Nature Medicine, 17, № 3, март 2011.
Глава 12
Azad N., Zahnow, C. A., Rudin, С. M., Baylin, S. B., «The future of epigenetic therapy in solid tumours lessons from the past», Nature Reviews Clinical Oncology, 10, № 5, май 2013.
Federation, A. J., Bradner, J. E., Meissner, A., «The use of small molecules in somaticcell reprogramming», Trends in Cell Biology, 24, № 3, март 2014.
