В 1504 году он под именем Франциска Литвина из Полоцка поступил в Краковский Университет на факультет свободных наук и искусств. Здесь он изучал то, что ему будет необходимо, и что ему может понадобиться в задуманном им деле. В Университете были профессора (Глаговский и др.), которые интересовались делом книгопечатания и переводами Священного Писания. А в самом городе Кракове имелась типография, хоть и латинская. И он знакомился там с книгопечатным делом и перенимал опыт, который ему после пригодился.
В 1506 г. он закончил Краковский Университет со званием Бакалавра свободных наук и искусств.
С 1506 по 1512 год Скорина где-то учился медицине и усугублял свои знания в области свободных наук и искусств. Вероятнее всего, это было в Праге. Там он мог получить и звание Доктора свободных наук и искусств, с которым он приехал в Падую. Там он мог подготовить почву для будущей деятельности в этом городе.
Возможно, что некоторое время (очевидно, по получении первого докторского звания), Скорина устроился в Дании и служил личным секретарём датского короля. И, в благодарность ему, приютившему его в трудный период его жизни, впоследствии он выслал ему свои издания, из которых там до нашего времени осталась и уцелела, хоть и в неполном виде, его «Малая Подорожная Книжка» Виленского выпуска 1522 года, в которой сохранилась и «Пасхалия» (то издание ныне находится в Королевской библиотеке Копенгагена).
В 1512 году Скорина отправился в Падую, где блестяще и успешно выдержал строгий экзамен на звание Доктора медицинских наук. Он получил это звание, чтобы быть подобно Св. Апостолу Евангелисту Луке Антиохийскому, покровителю имени его отца — врачом телесным и духовным.
Следующие четыре года (1512–1516) пошли у Скорины на подготовку к великому делу, которое он задумал, и которому посвятил свою жизнь. Теперь к этому делу он приблизился вплотную. Он связался с Виленским и Полоцким братствами, и с их помощью раздобыл средства для работы, верные списки Священного Писания, и получил от них всякую необходимую помощь.
Можно предполагать, что Скорина, как Виленский мещанин и причастный к кожевенному делу, сам был членом Кушнерского (кожевенного) Воскресенского братства, в число руководителей которого входили радца Богдан Онков и православный бургомистр Якуб Бабич (Иаков Бабич).
Не исключено, что за это время он посетил и свой родной город Полоцк, где в то время его духовный отец, овдовев и приняв монашество с именем Иосиф, стал Полоцким Архиепископом (1516 г.). У него, как у православного Архиерея, он мог взять благословение на своё святое дело, а также получить через него доступ к книжным сокровищам Полоцка. А среди них были и подлинные вернейшие списки Кирилло-Мефодиевских переводов Священного Писания и Богослужебных текстов, которые, в числе других пособий, он и использовал позже в своей работе.
Нужно было организовать типографию — приобрести оборудование, найти помещение, рабочих, приобрести весь необходимый для работы материал — краску, бумагу, и т. д.; вырезать шрифт, приготовить и вырезать гравюры, и т. д. Необходимо было заняться кропотливой и усидчивой работой — сличением различных списков книг Священного Писания, переводом устаревших и неудобопонятных древне-славянских слов и выражений на доступное простому народу славянско-белорусское наречие, которое он называл «русским языком». Необходимо было достать и самые верные списки Священных книг, которые бы стояли как можно ближе к Кирилло-Мефодиевскому переводу.
Одним словом — в эти подготовительные четыре года Скорина проделал титаническую работу по подготовке и изданию книг Священного Писания и начал своё издательское дело в Праге.
В 1516 г. он (согласно сообщению Пылко Полинского), издал, первым долгом, «Славянскую грамматику». Ибо он знал, что прежде, чем читать Священное Писание, народ должен обучиться грамоте.
В следующем, 1517 году, он начал издавать книги Священного Писания. Эта издательская его деятельность в Праге продолжалась без перерыва до конца 1519 года.
Из изданных им в Праге книг Священного Писания до нас дошли 23 кн. Ветхого Завета. Есть предположение, что должна где-то быть и 24-я книга — книга пророка Божия Иеремии. Ибо в дополнительной к ней книге «Плач Иеремии», которая дошла до нашего времени, имеется ссылка на предисловие к книге самого пророка Иеремии.
Книги Священного Писания Скорина издавал не по обычному порядку их канонического расположения в полной Библии, а отдельными выпусками. Порядок очерёдности, в каком издавались библейские книги, был таков, какой требовали условия того времени и неотложные нужды русского православного народа. В этом порядке была своя педагогическая разумность. А если бы Скорине удалось издать все книги Ветхого Завета и Нового Завета, то из отдельных выпусков легко можно было бы составить и полную Библию в каноническом порядке очерёдности книг в ней. Ибо, при издании книги Битие, Скорина предпослал этой книге титульный лист для всей Библии, и общее «Предословие во всю Библию Руского языка», в котором он перечисляет библейские книги в каноническом порядке.
Порядок очерёдности выпуска Скориною книг Священного Писания был им глубоко продуман. Он имеет в себе некую систему, приспособленную к первоочерёдным нуждам его народа.
Сначала была издана Псалтирь, как учебное пособие, и как книга, которая вкратце заключает в себе всё, что, находится в других библейских книгах Священного Писания. Она содержит в себе всё необходимое «для душного спасения» и для благополучия земной жизни людей.
Затем была издана книга «Иовъ», чтобы дать духовное утешение народу и подбодрить примером Иова Многострадального тех, кто начал падать духом, видя утеснение со всех сторон. Она издана для утешения тех, «они же суть в бедах и немощах положены».
Потом следует ряд нравоучительных книг священного Писания, которые необходимы были его народу для исправления упавшей в нём нравственности, — книги «Притчи Соломоновы», «Иисус Сирахов» (в сущности — те же притчи). «Экклезиаст», «Песнь песней» и «Премудрость Божия (Соломонова).
Затем Скорина издаёт ряд исторических книг — четыре книги Царств одним выпуском, с единой пагинацией. Это — пример водительства Божия в исторических судьбах людей.
Естественная очерёдность в издании Скориною и следующей группы книг Священного Писания. Это книги: «Руфь», «Эсфирь» и «Иудифь», а также «Иисус Навин». Они научают патриотизму и беззаветному служению своему народу.
После всего этого выпускается «Пятикнижие» Моисея, в котором дана история рода человеческого и Божий Закон — прообраз всех человеческих законов. Очевидно, всё же, Скорина надеялся издать всю Библию целиком, ибо пред Книгой Бытия он дал титульный лист для всей Библии, и «Предословие во всю Библию Руского языка». Но обстоятельства, вероятно, сложились так, что эту мечту пришлось отложить до более благоприятных времён,которые, наверное, так и не наступили...
Поэтому, после Пятикнижия мы видим не Книгу Судей (книга Иисуса Навина издана раньше), а пророческие книги — и, опять таки, не по порядку. Не без определённого педагогического умысла, он издал, в первую очередь, тех пророков, которые относятся к периоду пленения Вавилонского. Это — Книга Пророка Иеремии (не дошедшая до нас), и, как дополнение к ней — «Плач Еремии», и кн. Пророка Даниила. Иеремия — Пророк покаяния и обличения народа еврейского, Пророк начала Вавилонского плена; Пророк, при котором сбылось то, что он пророчествовал народу еврейскому за его отступление от Господа и правой веры и за его грехи в нравственной жизни. Даниил же — пророк во время самого плена; муж желаний, ободряющий народ скорым окончанием этого плена и показывающий будущие судьбы мира и человечества. Это — Пророк, который в хронологической точности открыл людям время пришествия в мир Избавителя и Искупителя их, Господа нашего Иисуса Христа. Это — напоминание своему народу, который тоже в это время находился в некоем пленении от иноземцев и иноверцев, что искреннее раскаяние, покаяние и исправление их нравов возвратит им милость Божию и поможет им освободиться от этого пленения.
Заканчивается Пражский период изданием «Книги Судей». Она издана Скориною для возбуждения у народа надежды на Господа, «к науце нам, Христианом» — когда грешим, то укрепляются наши враги душевные и телесные; когда же каемся и исправляемся, — говорит он в Предисловии, — то Господь посылает нам избавителей для душ и телес наших. Есть предположение (согласно сообщения того же Пылко Полинского), что Скорина в Праге предпринял 1-е издание «Апостола» (в 1519 г.), который им издавался трижды, хотя и дошёл до нас только в последнем издании — издании 1525 года.
В 1520 году в Праге и в Чехии возникла эпидемия смертельной страшной болезни. Без сомнения, Скорина, как Доктор медицины, принял самое деятельное участие в борьбе с этой эпидемией. Когда же эпидемия утихла, то осенью 1520 г. в стране начались гражданские беспорядки, и стало беспокойно там работать и жить.
