Самым вероятным пунктом вторжения долгое время считалось побережье близ Судака или Евпатории. Затем следовало ожидать дальнейшее продвижение войск к Севастополю для его осады.
Подобный сценарий был уже однажды опробован во время Крымской войны. Тогда, в декабре 1853 года, англо-французская эскадра вошла в Черное море, конвоируя транспорты с войсками. Через несколько дней союзники объявили России войну.
Только спустя месяц у Одессы появилась армада из 16 парусных, 3 винтовых линейных кораблей и 13 кораблей других классов под общим командованием вице-адмиралов Гамелена и Джорджа Дандаса.
Попытка высадить десант у Одессы не удалась, и эскадра, обстреляв город, ушла в крейсерство вдоль черноморского побережья. Только к концу августа 1854 г. союзники решились на высадку десанта в Крыму и взятие Севастополя. Для этого из Варны вышел объединенный флот в составе 89 кораблей охранения и 300 транспортов, имея на борту 62-тысячный десант.
В течение четырех дней войска беспрепятственно высадились в 30 километрах от Евпатории между озерами Камышлы и Кичик-Бель. 8 сентября при реке Альма произошло первое сражение, в котором 33,6-тысячный корпус русской армии потерпел поражение. Поняв, что дни Черноморского флота сочтены, командование решило затопить часть его кораблей и закрыть ими вход в Севастопольскую бухту. На дно легли 5 линейных кораблей и 2 фрегата. Спустя несколько дней началась осада Севастополя. Одновременно несколько меньших по численности десантов высадили у Керчи и Еникале, а поддерживающие их корабли, войдя в Азовское море, обстреляли все города побережья.
Тактическая инициатива полностью перешла к союзным войскам, а последовавшие затем ожесточенные обстрелы Севастополя с моря поставили его защитников в невероятно тяжелые условия.
Под руководством вице-адмиралов В. А. Корнилова и П. С. Нахимова, ставших народными героями, солдаты, матросы и простые жители города в течение почти года выдерживали осаду. Но силы оказались неравными. Отсутствие железной дороги, невозможность доставки войск и боеприпасов не позволяли усиливать ряды защитников Севастополя. В ночь на 28 августа 1855 г. по приказу главнокомандующего князя М. Д. Горчакова защитники города организованно покинули Севастополь, перейдя по деревянному понтонному мосту на его Северную сторону. В эту же ночь на дно бухты легли оставшиеся корабли, а укрепления, верфи и склады на Южной стороне сожгли или взорвали. Севастополь лежал в развалинах. Так спустя 349 дней окончилась героическая оборона Севастополя.
Войска союзников, истощенные жестокими боями, продолжать активных действий не стали. Через восемь месяцев они покинули Крым.
Постепенно в город начали возвращаться его жители. 9 августа 1856 года над городом был вновь поднят Российский флаг. Для возрождения города и судоходства Государственный совет принял решение о создании акционерной компании "Русское общество пароходства и торговли" (РОПиТ). 3 августа 1856 г. Общество начало свою деятельность.
С отменой в октябре 1870 г. Парижского договора значение Севастополя как будущего места базирования боевых кораблей заметно возросло. В 1871 г. главный командир Николаевского порта – основного места базирования малочисленного Черноморского флота – вице-адмирал Н. А. Аркас на заседании Государственного совета поднял вопрос о создании в Севастополе военной базы.
Спустя несколько месяцев, 14 января 1872 г., у великого князя Константина Николаевича состоялось совещание, на котором решили, что "… благоустройство Севастопольского порта заслуживает особого внимания правительства". Николаеву отводилась роль судостроительного центра, а Севастополь в дальнейшем "…должен сделаться местом стоянки судов Черноморского флота".
Севастополь в те годы представлял собой поселение с деревянными домиками среди развалин каменных домов, оставшихся со времени осады. Берега бухты были усеяны многочисленными деревянными причалами, не имевшими практически никакого оборудования. Все грузы с купеческих барж, барков и бригов увозились на телегах, запряженных лошадьми. Основную массу заходивших судов составляли парусные. И не случайно. Среди четырнадцати российских портов Севастополь по грузообороту занимал лишь одиннадцатое место, даже несмотря на столь удобную, обширную и тихую бухту. Главным недостатком этого порта являлось отсутствие железной дороги.
Фактически строительство порта, мастерских, стапелей и города следовало начинать заново. "Так как в настоящее время уже трудно ожидать сосредоточения против Севастополя таких средств атаки, какие были употреблены союзниками, то все укрепления должны быть устраиваемы не для противодействия правильной осаде, а с целью лишь воспрепятствовать высадке десанта в окрестностях Севастополя,"- говорилось в директиве Константина Николаевича. Особое значение придавалось укреплению Херсонесского полуострова.
Вся ответственность за возрождение Севастополя возлагалась на вице-адмирала Н. А. Аркаса, с именем которого связано последующее его строительство.
В июне 1873 г. образовали Севастопольское градоначальство. Город получил главу – государственного администратора и хозяина и с того времени стал заметно преображаться.
Уже тогда стало ясно, что по своему положению Севастополь не мог быть хорошим торговым портом. Основным его недостатком являлось отсутствие железной дороги и длинный путь доставки грузов на материк через весь Крымский полуостров. В 1875 г. жизнь показала, что совместить в Южной бухте два порта, военный и торговый, невозможно. С того времени она отошла в ведение Морского и Военного министерств.
К Южной бухте подвели ветку железной дороги, затем появились двух- и трехэтажные каменные строения и причалы. Долгое время неотъемлемой частью бухты были две круглые "поповки" со стоящими рядом несколькими винтовыми рангоутными кораблями. В 1882 г. в бухте появилась императорская яхта "Ливадия". Ее своеобразный корпус и три стоящие в один ряд трубы удивляли жителей и гостей города.
Особенно интенсивное оборудование порта началось с 1884 г. Для этой цели использовали средства, отпущенные на двадцатилетнюю программу. Реконструировали и ветку железной дороги, построили железнодорожную станцию. После этого в порт в сутки могли доставлять до 400 вагонов.
По настоянию нового главного командира Черноморского флота и портов вице-адмирала А. А. Пе- щурова торговый порт из Северной бухты перевели в Стрелецкую. До этого в Феодосии в 1884 г. также начали строить причалы, подводя к городу ветку от Лозо- во-Севастопольской железной дороги.
В 1887 г. в Севастополь пришел на достройку первый черноморский броненосный корабль "Екатерина II". Через год он и другой броненосец "Чесма" начали испытания. С этого времени стоящие в Южной бухте корабли ежегодно пополнялись своими новыми собратьями.
Окончательно Севастополь как главная база Черноморского флота стал после отданного 11 мая 1890 г. императором Александром III приказа, в котором жители города прочли следующее: "Мы признали за благо сохранить за Севастополем значение исключительно военного порта и даровать городу сему средства для развития и преуспевания в будущем".
К середине 90-х годов Севастополь стал оплотом империи на юге. Главный Морской штаб так определил значение базы и Крымского полуострова в случае начала войны: "Крымский полуостров значительно развился за последнее десятилетие в экономическом отношении и, получив особо важное значение с перенесением в Севастополь базы Черноморского флота, уже сам по себе может быть целью наступательных операций противника. Поэтому все пути, ведущие в Крым, приобретают огромное значение, и попытки со стороны противника к обладанию им, дабы отрезать Крым, являются весьма вероятными, так как полуостров связан с Империей одноколейной железнодорожной линией Харьков-Лозовая-Севастополь, пересекающей Сиваш в 50 верстах восточнее Перекопского перешейка".
Учения по отражению вражеского десанта ежегодно входили в план боевой подготовки флота и проводились "на основании Высочайше утвержденного расписания сбора войск для летних занятий".
Наиболее массовыми учения по высадке десанта стали проводить с 1895 года, когда план захвата Босфора был разработан в Генеральном штабе в деталях. В учениях постоянно участвовали войска Одесского округа, оборонительного Севастопольского отряда и Практическая эскадра Черноморского флота.
Так, в проводившейся в 1897 г. высадке десанта Одесский отряд включал 8213 офицеров и солдат, 16 орудий, 427 лошадей. Севастопольский отряд насчитывал 7050 человек, 22 орудия и 364 лошади. Ему предстояло выполнить свои задачи, то есть помешать высадке и в случае неуспеха, вступив в бой, оборонять крымское побережье от Джарылгачской косы до Каланчанского лимана.
Участвовавшие в учении корабли делились на два отряда: боевой и транспортный. В первый вошли броненосцы "Три Святителя", "Георгий Победоносец", "Чесма", "Екатерина II", крейсер "Память Меркурия", канлодки "Запорожец", "Черноморец" и "Терец", минные крейсера "Казарский" и "Гридень" и 10 миноносцев. Транспортный отряд состоял из транспортов Добровольного флота "Херсон" и "Владимир" и пароходов РОПиТ "Новосельский", "Ростов", "Екатерина II", "Чатыр-Даг" и "Арарат". Всего в учении задействовали 31 корабль.
