Ведение разведки возлагалось на все без исключения японские лодки, выходившие в море. При этом, помимо самолетов, они использовали оптические приборы, документы с потопленных транспортов, опрос захваченных пленных, радиопеленгование и радиоперехват. В последние годы войны для разведки использовали радиолокацию. Здесь надо сказать, что радиотехническое вооружение на японские ПЛ внедрялось чрезвычайно долго и с большим трудом. Командиры кораблей быстро оценили его достоинства, но МГШ проявил удивительный консерватизм. Так, капитан 3 ранга Хасимото в феврале 1943 г., будучи командиром I-158, по собственной инициативе установил на ней один из образцов авиационной РЛС. Опыт не дал положительных результатов, и МГШ не стал разбираться в причинах. Лишь в сентябре 1943 г. на Ro-44 (капитан-лейтенант Фудзимото) смонтировали станцию обнаружения надводных целей, а внедрение станции обнаружения воздушных целей затянулось вплоть до февраля 1944 г. Объяснялось это тем, что МТД не хотел принимать на вооружение армейские образцы (как технически не приспособленные к морским условиям), а разработку своего завершил лишь в конце ноября 1943 г. Планомерное оснащение японских лодок радиотехническим вооружением началось в феврале 1944 г. Вместе с тем, МГШ и командование Шестого флота не смогли (или не захотели) разработать оперативно-тактические приемы его боевого использования. В результате, радиолакационные станции порой становились причиной гибели японских ПЛ. Показателен пример Ro-55, Ro-112 и Ro-113, которые были потоплены в течение одной недели (соответственно 7-го, 11-го и 12-го февраля 1945 г.) у о. Лусон американской ПЛ Batfish, выходившей в атаку по данным станции радиотехнической разведки (AN/APR-1). Ее успех обеспечили сами японцы, длительное время не выключавшие свои РЛС обнаружения воздушных целей. Только к концу воины МГШ ввел в действие инструкции по повседневному и боевому использованию радиотехнического вооружения, строящиеся корабли получили новые формы надстроек и ограждения рубок, снижавшие радиолакационную заметность, легкие корпуса покрывали специальным каучуковым составом, а механизмы (в том числе и вспомогательные) монтировали на двухкаскадных амортизаторах, что снижало уровень первичных аккустических полей.
Среди специальных операций Шестого флота можно выделить обеспечение летающих лодок "Каваничи" (H8K1) во время атаки Перл-Харбор. Для этой цели I-15, I-19 и I-26 оборудовали цистернами для перевозки и передачи в море авиационного топлива. 28.02.1942 г. I-15 и I-19 заняли позицию у атоллов Френч-Фригейт. Навигационное обеспечение операции осуществляли: I-26, патрулировавшая в 200 милях к юго-западу; Ro-61 и Ro-62, занявшие позицию между атоллами Вотье и Френч-Фригейт. 3.03.1942 г. летающие лодки дозаправились с I-15 и I-19. 4.03.1942 г. они нанесли удар по Перл-Харбор. Подобный рейд планировали повторить в рамках операции по захвату атолла Мидуэй, но американцы узнали о планах МГШ и заранее развернули у атоллов Френч-Фригейт свои противолодочные корабли. Сама идея использовать ПЛ для обеспечения летающих лодок в открытом океане нашла продожение в создании специальных кораблей типа SH. Боевые лодки для этой цели использовались лишь в конце 1942 г., когда I-21 у Соломоновых о-вов дважды передавала топливо на летающие лодки "Каваничи" (H8K1), ведшие разведку в районе о-вов Фиджи и Самоа.
Лодки привлекались для спасения экипажей погибших кораблей и самолетов. В отличие от американцев, японцы не смогли организовать надежную систему спасения. Подобные операции проводились без достаточной подготовки и не согласовывались с другими силами флота. Так, 3.03.1943 г. I-17 и I-26 направили из Рабаула в море Бисмарка для спасения экипажей судов и кораблей, разгромленного противником конвоя. Одновременно сюда пришли несколько эсминцев, командиры которых не знали о присутствии лодок. Лишь благодаря случайности японские офицеры раэобрались в обстановке. 4.03.1943 г. I-17 и I-26 подобрали с воды 350 человек, которых доставили 5.03.1943 г. в Рабаул. Ранее упоминавшиеся Ro-55, Ro-112 и Ro-113 вышли в море для спасения экипажей сбитых самолетов. Их действия не были согласованы с авиационным командованием и командиры были вынуждены все время использовать радиолакационные станции для определения местоположения своих самолетов.
Японские лодки высаживали на побережье противника агентов армейской разведки, готовились к высадке достаточно крупных десантов, имевших на вооружении даже танки. Для решения последней задачи привлекались "стандартные" крейсерские лодки и разрабатывались специальные транспортные корабли.
Б.8 Использование быстроходных японских ПЛ против боевых кораблей
К защите о-вов Метрополии МГШ планировал привлечь высокоскоростные лодки типов ST и STS. Они создавались на основе немецких технологий и являлись аналогами немецких ХХI и ХХIII-й серий. Считалось, что, благодаря высокой скорости надводного хода, они смогут прорвать охранение американских авианосцев. При этом лодки должны были выходить в атаку группами по пять-шесть кораблей. Устройство "шнорхель" позволяло им длительное время находиться под водой. Во время атаки корабли использовали бы обычные торпеды. Ввиду отсутствия топлива, вступавшие в строй лодки боевой подготовкой не занимались, и отработать на практике новые тактические приемы не удалось.
Б.9 Карликовые лодки в японском Императорском флоте
В 1932 г. Нориосси Йоко предложил идею создания человекооуправляемых торпед, но из-за невозможности спасения их экипажей после выполнения боевой задачи пришлось отказаться от этой идеи. МТД начал работы над двумя проектами сверхмалой лодки: — чисто электрическим и дизель-электрическим. Оба корабля должны были иметь радиус действия 30 км и нести две торпеды. В начале 1934 г. ф. "Мицубиси" по проекту инженера Нисимура построила вполне удачный научно-иследовательский глубоководный аппарат Нисимура (№ 1). МГШ заинтересовался зтой лодкой и на верфи флота в Куре построил такой же аппарат. Полученный опыт позволил в 1936 г. ввести в строй две карликовые лодки типа А (открытое наименование "Мишень — А"). В этих кораблях японцев привлекла возможность их прорыва в хорошо охраняемые порты и базы. Первоначально на этих лодках планировали размещать диверсантов, затем специальные заряды, но в конце концов остановились на торпедном варианте. Предполагалось, что массированное использование карликовых ПЛ позволит нейтрализовать линейные силы противника незадолго до их выхода в море. С этой целью их надлежало доставить, по возможности скрытно, в точку запуска, т. е. на дистанцию не больше 80 миль до цели. После ввода в строй прототипов Ha-1 и Ha-2 их испытали в 1939 г. на гидроавианосце Чuтосэ. Хотя результаты этих испытаний не удовлетворяли МГШ, гидроавианосец Чийода модернизировали в транспорт 12 (при необходимости 20) карликовых лодок, а пять находившихся в постройке крейсерских ПЛ типа С1, оснастили механизмами, необходимыми для их боевого использования. В соответствии с боевыми инструкциями, носитель в подводном положении выходил в исходную точку. Экипаж переходил на карликовую лодку, и носитель после погружения направлялся в точку запуска. Здесь карликовая ПЛ переходила на автономный режим и, руководствуясь показаниями гирокомпаса или ведя разведку через перископ, прорывалась в порт или базу, где командир корабля выбирал цель и применял по ней торпеды.
Новый вид оружия не встретил восторга у адмирала Ямамото и ряда высших офицеров МГШ. Они считали, что после первого же использования карликовых лодок, противник будет готов к отражению их последующих атак. В принципе, Ямамото оказался прав. 7.12.1941 г. при прорыве в гавань Перл-Харбор японцы бесполезно потеряли все пять карликовых лодок. Это объяснялось техническим несовершенством самих лодок и хорошей противолодочной обороной американской базы. Тем не менее, офицер, руководивший операцией, доложил, что им удалось потопить один из линкоров, и МГШ был удовлетворен результатами атаки. Однако противник захватил один из кораблей, детально ознакомился с его конструкцией и смог принять необходимые меры для обороны своих баз и портов. Лишь 31.05.1942 г. две карликовые лодки (с I-16 и I-20) смогли в гавани Диего-Суарес (о. Мадагаскар) потопить английский танкер British Loyalty (6993 т) и повредить линкор Ramillies. По-видимому, сказалось плохое взаимодействие между союзниками. Одновременно три другие карликовые лодки (с I-22, I-24 и I-27) безрезультатно атаковали порт Сиднея. Обе атаки предворяли разведывательные полеты бортовых самолетов с одной из крейсерских лодок группы. В конце 1942 г. японцы последний раз использовали в качестве носителей корабли. 15.11 и 29.11.1942 г. у Лунга-Пойнт (Соломоновы о-ва) четыре лодки атаковали соединения противника, и только Ha-20 с I-20 удалось повредить американский войсковой транспорт Alchiba (6198 т).