26.12.1941 г. I-62 и I-64 (29-й ДПЛ), I-65 и I-66 (30-й ДПЛ) пришли в порт Самах.
29.12.1941 г. На подходах к атоллу Кваджелейн, Ro-60 (26-й ДПЛ) в штормовых условиях, из-за поломки гирокомпаса, выскочила на риф и, спустя 2,5 часа, была разбита о камни. Часть экипажа корабля погибла. Ro-61 и Ro-62 (26-й ДПЛ), Ro-65 и Ro-67 (27-й ДПЛ) пришли на атолл Кваджелейн. Ro-33 и Ro-34 (21-й ДПЛ) пришли в Такао.
2.01.1942 г. Корабли Четвертой и Пятой эскадр пришли в пункты базирования. I-16 (1-й ДПЛ), I-20 (2-й ДПЛ) и I-22 (3-й ДПЛ) вышли с атолла Кваджелейн и направились к Гавайским о-вам для поиска и атаки боевых кораблей противника.
29.12.1941 г. На совещании в Императорской ставке командующий Шестым флотом высказал недовольство деятельностью подводных сил в первый месяц войны и в качестве основной причины назвал неправильную организацию их боевого использования, навязанную командованием Объединенного флота и МГШ. Он предложил отказаться от участия ПЛ в совместных операциях с НК и перенацелить их на борьбу с торговым судоходством. Для успешного решения задачи вице-адмирал Мицуми Симидзу планировал сформировать пять оперативных соединений постоянного состава, находившихся в его непосредственном подчинении. МГШ не согласился с предложениями командующего Шестым флотом, но разрешил сформировать три соединения, получивших названия: Группа А — из ПЛ Шестой эскадры, для действий к востоку от 117° Ost и борьбы с боевыми кораблями, идущими из Австралии к о-вам Голландской Индии; Группа В — из ПЛ Пятой эскадры, для действий к западу от 106° Ost и борьбы с судоходством в Индийском океане; Группа С должна была быть сформирована после оккупации Малайи и действовать в районе между 103° и 117° Ost, обеспечивая захват Явы и Суматры.
3.01.1942 г. Ro-33 и Ro-34 (21-й ДПЛ) вышли из Такао и направились к о. Анамбас для борьбы с судоходством противника. I-24 (4-й ДПЛ) вышла с атолла Кваджелейн и направилась в район Гавайских о-вов для поиска и атаки боевых кораблей противника.
4.01.1942 г. I-1, I-2 и I-3 (7-й ДПЛ), I-4, I-5 и I-6 (8-й ДПЛ), I-10 (Второй флагман Второй эскадры ПЛ) сосредоточились в районе к юго-востоку от о. Оаху для борьбы с боевыми кораблями противника, следующими в Перл-Харбор. I-4 (капитан 3 ранга Накагава) на подходах к Перл-Харбор потопила американское торговое судно (4858 т). I-57 (19-й ДПЛ, капитан 3 ранга Накадзима) в районе к северо-востоку от Реданга потопила голландское торговое судно (3077 т).
5.01.1942 г. I-56 (19-й ДПЛ, капитан 3 ранга Охаси) на подходах к Редангу потопила два голландских торговых судна (суммарным водоизмещением 5100 т).
7.01.1942 г. I-65 и I-66 (30-й ДПЛ) вышли из порта Самах и направились в район к юго-западу от о-вов Ява и Суматра для борьбы с судоходством противника. I-121 и I-122 (13-й ДПЛ) вышли из бухты Кам-Рань и направились в Давао. I-62 и I-64 (29-й ДПЛ) вышли из порта Самах и направились в Бенгальский залив для борьбы с судоходством противника.
8.01.1942 г. I-123 и I-124 (9-й ДПЛ) вышли из Такао и направились в Давао.
9.01.1942 г. I-16 (1-й ДПЛ), I-20 (2-й ДПЛ), I-22 (3-й ДПЛ), I-24 (4-й ДПЛ), I-1, I-2 и I-3 (7-й ДПЛ), I-4, I-5 и I-6 (8-й ДПЛ), I-7 (флаг 2-й эскадры ПЛ) получили приказ сосредоточить усилия на поиске и атаке американского ОС TF.14 (во главе с АВ Saratoga). I-56 (19-й ДПЛ, капитан З ранга Охаси) на подходах к Редангу потопила английское торговое судно (2857 т) и два судна (американское и голландское, суммарным водоизмещением 5065 т) повредила.
10.01 1942 г. I-6 (8-й ДПЛ, капитан З ранга Инаба) атаковала тремя торпедами в 500 милях к юго-востоку от о. Оаху американский АВ Saratoga. Взрыв одной из торпед нанес тяжелые повреждения кораблю (шесть человек погибло и затопило часть КО), но он смог своим ходом дойти до Перл-Харбор и затем перейти в Бремертон для ремонта, который продолжался около трех месяцев. Командир I-6 доложил о гибели АВ. Ro-61 и Ro-62 (26-й ДПЛ), Ro-65 (флаг командира группы, 27-й ДПЛ) вышли с атолла Кваджелейн и направились к архипелагу Бисмарка для проведения разведки в интересах соединения вице-адмирала Нагумо. Ro-67 (флаг командира группы, 27-й ДПЛ), Ro-63, Ro-64 и Ro-68 (33-й ДПЛ) вышли с атолла Кваджелейн и направились к западному побережью США для обстрела береговых объектов. Деятельность этих ПЛ обеспечивал тендер Дзuнгей (флаг Седьмой эскадры ПЛ контр-адмирала Ониси). ЛКР Юра (флаг Пятой эскадры ПЛ), I-121 и I-122 (13-й ДПЛ), I-123 и I-124 (9-й ДПЛ) прибыли в Давао. I-65 (30-й ДПЛ, капитан-лейтенант Харада) к югу от о. Ява потопила английское торговое судно (2950 т). I-66 (30-й ДПЛ, капитан З ранга Яоситоме) в районе к юго-западу от о. Ява потопила американское торговое судно (З500 т). I-24 (4-й ДПЛ) на подходах к о. Оаху обнаружила американский АВ Lexington и, будучи в надводном положении, начала его преследовать, пытаясь выйти в торпедную атаку.
11.01.1942 г. I-121 и I-122 (13-й ДПЛ), I-123 и I-124 (9-й ДПЛ, флаг командира группы капитана 1 ранга Кеиу Ендо) вышли из Давао и направились к северному побережью Австралии. ПЛ несли на себе по 42 мины заграждения. I-65 (30-й ДПЛ, капитан-лейтенант Харада) к югу от о. Ява потопила голландское торговое судно (3155 т).
12.01 1942 г. I-24 (4-й ДПЛ) прекратила преследование АВ Lexington из-за выхода из строя системы погружения и всплытия (деформировались клапаны вентиляции носовой группы ЦГБ). I-23 (3-й ДПЛ) пришла на атолл Кваджелейн.
13.01.1942 г. I-8 (флаг 3-й эскадры ПЛ) вышла с атолла Кваджелейн и направилась к западному побережью США (между Сан-Франциско и Сиэтлом) для борьбы с судоходством противника. I-68 и I-69 (12-й ДПЛ) вышли с атолла Кваджелейн и направились в район между о. Мидуэй и западным побережьем США для борьбы с судоходством противника, I-71 и I-72 (20-й ДПЛ) вышли с атолла Кваджелейн и направились к Гавайским о-вам для борьбы с боевыми кораблями и судоходством противника. I-73 (20-й ДПЛ) вышла с атолла Кваджелейн и направилась к атоллу Мидуэй для борьбы с боевыми кораблями и судоходством противника. I-56, I-57 и I-58 (19-й ДПЛ) получили приказ следовать в Пенанг.
14.01.1942 г. I-124 (9-й ДПЛ) в море Флорес обнаружила идущий в охранении двух ЭМ американский ТКР Houston. Попытка I-123 и I-124 атаковать противника не увенчалась успехом из-за большой дистанции. I-64 (29-й ДПЛ, капитан З ранга Огава) в Бенгальском заливе потопила американское торговое судно (З700 т).
17 01.1942 г. В проливе Сунда, в 25 милях от о. Кракатау, I-60 (28-й ДПЛ) была потоплена глубинными бомбами английским ЭМ Jupiter. Ro-61 и Ro-62 (26-й ДПЛ), Ro-65 (27-й ДПЛ) прибыли в район архипелага Бисмарка. Ro-63 (33-й ДПЛ) безрезультатно обстреляла атолл Джонстон. I-56, I-57 и I-58 (19-й ДПЛ) пришли в Пенанг. I-64 (29-й ДПЛ, капитан З ранга Огава) в Бенгальском заливе потопила английское торговое судно (3700 т).
18.01.1942 г. I-15 (1-й ДПЛ), I-19 (2-й ДПЛ) и I-26 (4-й ДПЛ) вышли с атолла Кваджелейн и направились в Йокосуку для переоборудования в ТН обслуживания летающих лодок "Каваничи" (H8K1). I-24 (4-й ДПЛ) получила приказ следовать к Маршалловым о-вам и затем к Перл-Харбор для выбора района, в котором можно было бы произвести дозаправку летающих лодок топливом. I-18 (2-й ДПЛ) вышла с атолла Кваджелейн и направилась к о. Мидуэй для его обстрела. I-10 (второй флаг 2-й эскадры ПЛ) пришла на атолл Кваджелейн.
19.01.1942 г. I-123 (9-й ДПЛ) выставила 42 мины заграждения в проливе Торрес (между Австралией и Новой Гвинеей). I-122 (13-й ДПЛ) выставила 20 мин заграждения в районе к северу от порта Дарвин.
20.01.1942 г. I-124 (9-й ДПЛ) при попытке выставить мины в проливе Кларенс, на подходах к порту Дарвин, была потоплена американским ЭМ Edsall и австралийским ТЩК Deloraine. Корабль затонул на глубине 12 м со всем экипажем. Впоследствии водолазам флота США удалось проникнуть в центральный пост ПЛ и извлечь книги военно-морских кодов, которые затем передали дешифровщикам в Перл-Харборе. Ro-61 и Ro-62 (26-й ДПЛ), Ro-65 (27-й ДПЛ) обеспечивали налет палубной авиации соединения вице-адмирала Нагумо на Рабаул, служа навигационными ориентирами. I-121 (13-й ДПЛ) выставила 42 мины заграждения в проливе Кларенс. I-122 (13-й ДПЛ) выставила 20 мин заграждения в районе к северо-востоку от порта Дарвин. I-24 (4-й ДПЛ) пришла на атолл Вотье, приняла топливо и получила приказ следовать к атоллу Мидуэй для его обстрела. I-66 (30-й ДПЛ, капитан 3 ранга Яоситоме) к югу от Ява потопила американское торговое судно (2670 т). Ro-33 и Ro-34 (21-й ДПЛ) пришли в Давао после патрулирования у о. Анамбас.