Главная военно-морская комендатура «Средний Ядран» (штаб в Макарске, с 1943 г. в Сплите) — ей подчинялись комендатуры в Омише (база в Крило), Супетаре (базы в Милане, Сувитане, Постире, Боле, Повлиме и Сумартине), Макарске (базы в Башка-Воде, Подгоре, Играни, Заостроге и Граце), Метковиче (базы в Опузене и Неуме) и Хваре (базы в Стариграде, Йелсе, Врбоско и Сучурье)
Главная военно-морская комендатура «Южный Ядран» (штаб в Дубровнике) — ей подчинялись комендатуры в Трпанье (база в Драге), Оребиче (база в Трстенике) и Дубровнике (базы в Стоне, Слано, Шипане, Лопуде и Затоне), а также подкомендатура в Кавтате
Кроме главных военно-морских комендатур Главному командованию ВМС также подчинялись следующие военно-морские базы: 1-го класса (Црквеница, Сенья, Макарска, Хвар и Дубровник), 2-го класса (Карлобаг и Шипан) и 3-го класса (Кралевица, Обровац, Сучурье, Омиш и Кавтат)
Командование рек и речных путей сообщения:
Комендатуры в Сисаке, Бродна-Саве, Хрватске-Митровице, Земуне, Петроварадине, Вуковаре и Осиеке
речная флотилия с базой в Земуне — в ее состав входили 2 речных монитора, 5 патрульных катера, 2 речных катера, 2 вспомогательных минных тральщика и 1 вспомогательный катер. Все эти суда занималась патрулированием на Дунае и Саве
батальон морской пехоты — 1-я рота морской пехоты дислоцировалась в Осиеке, затем переведена в Земун), 2-я и 3-я роты морской пехоты дислоцировались в Земуне.
В 1944 г. хорватские ВМС насчитывали около 1300 человек и имели несколько крупных плавучих средств, входивших в состав немецкой 11-й охранной военно-морской дивизии. Штаб речной флотилии был переведен в Славонски-Брод и подчинялся теперь морскому штабу в Загребе. В этот период в составе флотилия оставались 2 речных монитора и несколько военных катеров, патрулировавших на Саве и Врбасе.
Командующими хорватских ВМС последовательно были: контра-адмирал Джуро Джакчин (апрель 1941 — конец 1943), капетан бойног брода Эдгар Ангели (конец 1943 — январь 1944) и контра-адмирал Никола Стейнфл (январь 1944 — май 1945)[49].
Хорватские ВВС (Hrvatsko Zrakoplovtvo / Hrvatske Zračne Snage) были созданы 12 апреля, а окончательно сформированы 21 апреля 1941 г. Как и сухопутные войска, и ВМС, они подчинялись министерству Домобрана, которое руководило военно-воздушными силами через Командование ВВС (Zapovjedništvo Zračnih Snaga). В свою очередь, в подчинении этого командования находились авиационные базы, с которых действовали хорватские летчики, и части противовоздушной обороны.
Первоначально было создано две авиационные базы, на которых к декабрю 1941 г. располагались следующие авиационные соединения:
1-я авиабаза «Загреб — Боронгай» (создана 1 июля 1941 г.):
1-я бомбардировочная авиагруппа в составе 1-й бомбардировочной эскадрильи
4-я истребительная авиагруппа в составе 10-й и 11-й истребительных эскадрилий
5-я бомбардировочная авиагруппа в составе 12-й и 13-й бомбардировочных эскадрилий (следует сказать, что две последние группы числились в составе хорватских ВВС только формально — это были части так называемого Хорватского авиационного легиона, который служил в составе германских Люфтваффе на Восточном фронте — более подробно мы расскажем о нем ниже)
2-я авиабаза «Сараево — Райловац» (создана 14 июня 1941 г.):
3-я бомбардировочная авиагруппа в составе 7, 8 и 9-й бомбардировочных эскадрилий
Осенью 1943 г. была создана еще одна авиационная база, которая получила пятый порядковый номер. В результате, 1 ноября 1943 г. боевой порядок хорватских ВВС выглядел следующим образом:
1-я авиабаза «Загреб — Боронгай»:
2-я авиагруппа в составе 1-й истребительной и 3-й бомбардировочной эскадрилий, а также 19-й эскадрильи связи
4-я истребительная и 5-я бомбардировочная авиагруппы (продолжали числиться в составе хорватских ВВС, но все еще находились на Восточном фронте)
2-я авиабаза «Сараево — Райловац»:
2-я авиагруппа в составе 4-й эскадрильи связи, 5-й и 6-й бомбардировочных эскадрилий
3-я авиагруппа в составе 7-й и 8-й бомбардировочных эскадрилий
5-я авиабаза «Баня-Лука»:
6-я авиационная группа в составе 13-й бомбардировочной эскадрильи и 18-й эскадрильи связи
Наконец, в конце 1943 г. была создана последняя авиационная база ВВС. Она получили третий порядковый номер. Хорватское командование планировало создать еще одну авиационную базу — 4-ю в Земуне, — но эти планы так и остались на бумаге. Таким образом, боевой порядок хорватских авиационных соединений оставался после последней реорганизации неизменным до самого конца войны и выглядел следующим образом (данные на 1 октября 1944 г.):
1-я авиабаза «Загреб — Боронгай»:
2-я авиагруппа в составе 1-й смешанной, 2-й истребительной, 3-й бомбардировочной эскадрилий и 19-й эскадрильи связи
11-я авиагруппа в составе 21, 22 и 23-й истребительных эскадрилий
2-я авиационная база «Сараево — Райловац»:
2-я авиагруппа в составе 4, 5, 6-й разведывательных и 20-й эскадрилий
3-я авиабаза «Мостар»:
3-я авиагруппа в составе 7-й бомбардировочной эскадрильи
5-я авиабаза «Баня-Лука»:
6-я авиагруппа в составе 13 и 15-й бомбардировочных и 14-й истребительной эскадрилий[51].
Главной проблемой хорватской авиации на всем протяжении ее существования оставалось техническое оснащение и кадровый состав. Хорватские пилоты действовали, преимущественно, на самолетах устаревшего образца, многие из которых являлись трофеями. Так, уже в июне 1941 г. немецкое командование передало своему новому союзнику 60 самолетов бывших Югославских королевских ВВС. К концу 1941 г. боевая мощь хорватской авиации несколько усилилась: немцы передали им ряд своих устаревших боевых машин, а также некоторые трофейные английские и французские. В результате, численность ВВС НГХ в этот период составила 95 самолетов, но из них только 60 % были пригодными к боевым действиям. В 1942 г. главным поставщиком самолетов для хорватских ВВС стала Италия. Всего в течение года она передала НГХ 98 самолетов, что позволило создать новые авиасоединения и увеличить общую численность боевых машин до 160. Итало-немецкие поставки продолжались и дальше: уже к сентябрю 1943 г. хорватские ВВС располагали 228 самолетами, правда, только 177 из них были пригодны к боевым действиям. С середины лета 1944 г. из хорватских ВВС началось массовое дезертирство: целые экипажи перелетали на сторону партизан Тито. Все это, в совокупности с растущими потерями (только за 1943 г. было потеряно более 60 самолетов), привело к тому, что к концу апреля 1945 г. на аэродроме Загреба осталось всего только 30 боевых машин[52].
По большей части хорватские самолеты действовали в качестве поддержки немецких ВВС в антипартизанских операциях. Однако в конце войны им пришлось столкнуться с бомбардировщиками и истребителями англо-американских союзников в небе над хорватскими городами.
Гораздо лучше, чем с боевыми машинами, в хорватских ВВС обстояло дело с обученными кадрами. Так, после капитуляции Югославии, в вооруженные силы нового государства вступило значительное количество ее бывших летчиков. Одновременно с этим началась и усиленная подготовка новых кадров (обычно, при помощи немцев). Все это привело к тому, что на конец 1941 г. в ВВС НГХ числилось более 2600 человек: 200 офицеров-пилотов, 50 унтер-офицеров-пилотов и 2400 технического и вспомогательного персонала. А в 1943 г. общая численность личного состава хорватской авиации достигла почти 10 тыс. человек[53].
Штабу ВВС подчинялась также командование зенитной артиллерии (Zapovjedništvo Protueroplanske Obrane), в составе которого было два противовоздушных округа:
1-й округ противовоздушной обороны «Загреб» в составе 1-го и 2-го батальонов противовоздушной обороны и
2-й округ противовоздушной обороны «Сараево» в составе 3-го и 4-го батальонов противовоздушной обороны
Еще одним подразделением, которое подчинялось Командованию ВВС, была 1-я хорватская парашютная рота (1ša Hrvatska padobranska lovačka satnija), которая была сформирована в конце 1941 — начале 1942 г. До конца августа 1943 г. личный состав роты проходил подготовку, а уже в сентябре был брошен в свой первый бой против партизан-коммунистов восточнее Загреба. В ноябре 1943 г., в ходе боя за Копривницу (там находилось место дислокации роты) хорватские парашютисты были почти полностью разбиты: в общей сложности их потери составили 20 человек убитыми и пропавшими без вести. После этого рота была отведена в Загреб на отдых, где ее временно расформировали. Вскоре, однако, подразделение было вновь восстановлено. За счет новых добровольцев удалось сформировать уже не одну, а четыре роты, которые в июле 1944 г. были развернуты в 1-й хорватский парашютный батальон, получивший почетное название «Хорватские орлы» (1ša Hrvatska padobranska lovačka bojna “Hrvatski Orlovi”). Местом дислокации нового батальона был выбран Загреб, а его непосредственным начальником — командир 1-й авиабазы. С осени 1944 по весну 1945 г. батальон участвовал в многочисленных антипартизанских операциях. Последний день существования этого подразделения — 14 мая 1945 г., когда оно вместе с остальными хорватскими войсками, сдалось британцам.