Скорцени промолчал, а рейхсфюрер удалился быстрыми шагами. Гюнше, ставший очевидцем того, как Гиммлер наорал на Скорцени, успокоил последнего, сказав, что в таком состоянии дискутировать с Гиммлером бесполезно. Штудент снова вызвал Скорцени и сообщил, что на следующий день в 8.00 они вылетают в Рим для подготовки операции. Выйдя от Штудента, Скорцени дозвонился до Фриденталя и потребовал к телефону своего адъютанта оберштурмфюрера СС Карла Радля. Услышав в трубке голос Радля, он начал диктовать свои приказы: отобрать во Фридентале 30 лучших солдат, унтеров и офицеров, переодеть их в форму парашютистов люфтваффе и предоставить им соответствующие документы; к 6.00 прибыть с отобранными людьми на аэродром в Стаакен и ожидать команду на вылет.
Утром 27 июля 1943 года Штудент и Скорцени вылетели в Рим. После прибытия в Вечный город они нанесли визит верховному командующему на юге генерал-фельдмаршалу Альберту Кессельрингу. Здесь "человек со шрамами" столкнулся с тем, что Кессельринг полностью доверял своим итальянским союзникам и отказывался даже думать об их возможной измене. Это обстоятельство существенно осложнило задание Скорцени — ему предстояло действовать втайне от генерал-фельдмаршала. Между тем уже в мае 1943 года немцы начали готовить операцию "Аларих" — оккупацию Италии, Позже название операции было сменено на "Ось". 27 июля Кессельринг полупил приказ начать подготовку к проведению операции, в ходе которой планировалось захватить новое руководство Италии и жизненно важные объекты в стране. Генерал Штудент должен был арестовать короля Виктора-Эммануила. 29 июля в Италию прибыли отобранные Радлем во Фридентале люди — 50 солдат и офицеров. Людям Скорцени было поручено арестовать 10 представителей новой власти. Самой сложной целью был сын короля Виктора-Эммануила и наследник престола принц Умберто Пьемонтский. Огромный дворец принца (около 2000 помещений) находился в самом центре Рима. Скорцени и его люди могли только предполагать, где именно находятся комнаты принца.
Пока новое итальянское правительство готовилось к выходу из войны, немцы лихорадочно искали место, в котором прятали Муссолини. В распоряжение Скорцени были переданы 10 офицеров из VI управления для скорейшего выявления этого места. В Берлине по требованию Гиммлера над установлением места содержания Муссолини бились арестованные экстрасенсы. Так где же прятали Муссолини? Первую неделю своего заключения дуче провел на острове Понца. Местное население оказалось лояльным свергнутому диктатору, и заговорщикам пришлось перевести Муссолини ночью 7 августа на уже упоминаемый остров Маддалена. 15 августа Скорцени получил от кригсмарине информацию о том, что дуче содержится на острове Маддалена После консультаций с генералом Штудентом Скорцени решил послать для разведки на остров своего офицера, унтерштурмфюрера СС Варгера, — он единственный владел итальянским языком. Варгер в образе моряка-выпивохи должен был посетить остров и в беседах с завсегдатаями забегаловок узнать дополнительную информацию по острову. В этой великолепной задумке был один затруднительный момент — унтерштурмфюрер СС Варгер вообще не употреблял спиртного… Скорцени и Радль в считаные дни приобщили Варгера к алкоголю и стали готовить его к отправке на остров. 18 августа Варгер и Скорцени вылетели из Рима на аэродром Виено-Фиорита в Сардинии. По прибытии Скорцени передал Варгера доверенному лицу из ВМФ, а затем вернулся на Виено-Фиорита. На аэродроме Скорцени добился разрешения на разведывательный полет над островом. На обратном пути самолет был перехвачен английскими истребителями, после чего потерпел крушение. Виной аварии, по мнению Скорцени, был итальянский бензин низкого качества. При крушении "человек со шрамами" повредил плечо и сломал три ребра. За эти травмы Скорцени 18 августа 1943 года был награжден черным знаком за ранение.
Оправившись от травм, Скорцени с Радлем и представителями люфтваффе и кригсмарине начали подготовку операции на Маддалене. Накануне унтерштурмфюрер Варгер своими глазами видел дуче на острове. Оказалось, Муссолини держат взаперти на вилле "Вебер". 23 августа Скорцени отправился на остров. В разгар подготовки к операции из ОКВ пришла телеграмма — "Согласно информации абвера. Муссолини содержится в заключении на небольшом островке вблизи Эльбы. Гауптштурмфюрер Скорцени должен немедленно подготовить воздушно-десантную операцию. О готовности сообщить в ОКБ, которое определит дату акции". Получение телеграммы совпало с подготовкой к совещанию в ставке Гитлера. Скорцени упросил Штудента взять его в качестве сопровождающего в "Волчье логово". В ставке Гитлера Скорцени было предоставлено слово, и он сумел доказать, что Муссолини находится на острове Маддалена. Гитлер пообещал отменить операцию на Эльбе и попросил Скорцени рассказать о своем плане.
Скорцени перевел дух и начал рассказ — накануне операции в порт Маддалены войдут немецкие катера, якобы для визита вежливости, катера остаются ночевать в порту. Наутро к острову подходят тральщики из порта Полау, на чьих палубах размещены люди из Фриденталя и рога гренадер из штурмовой бригады СС "Рейхсфюрер СС". Высадка происходит под прикрытием катеров, при этом десант должен делать видимость, что идут маневры. Численность итальянских солдат на острове превышала 500 человек, поэтому немцам была необходима и удача.
План понравился Гитлеру и присутствующим. Гитлер отвел Скорцени в сторону и негромко сказал, что если Скорцени потерпит неудачу или на острове не окажется Муссолини, то О КВ будет вынуждено заявить, что "человек со шрамами" действовал на свой страх и риск. Скорцени ответил, что понимает это.
— Вам повезет, Скорцени, — закончил Гитлер. — Я уверен в этом!
В приподнятом настроении Скорцени вернулся в Италию. 27 августа офицеры РСХА Капплер, Гребл и Прибке организовали бегство дочери Муссолини Эдды и его внуков в Германию, а на 28 августа была назначена спецоперация по освобождению дуче, о чем было доложено в О КВ. Однако вечером 27 августа выяснилось, что рано утром Муссолини был вывезен на гидроплане Красного Креста с острова Маддалена. После войны Скорцени обвинил в утечке информации адмирала Канариса. Предательство Канариса и других офицеров абвера вообще было одной из любимых тем "человека со шрамами". Легко объяснять свои ошибки и провалы злым умыслом конкурентов!
Опять начался поиск свергнутого диктатора. В ходе одной из поездок в Вигно дель Валле Скорцени увидел известный ему по Маддалене гидроплан, выполнявший перевозку думе. Путем опросов удалось установить, чго снятый с гидроплана Муссолини был погружен в медицинскую машину и увезен в неизвестном направлении. Началась проработка возможных мест пребывания дуче. Изначально рассматривались три версии больница, Перуджи и Трезименское озеро. Позже основной версией стал горный массив Гран-Сассо. Версия подтвердилась, когда была перехвачена радиограмма инспектора карабинеров генерала Гуэли, в ней указывалось, что подготовка обеспечения безопасности Грап-Сассо завершена. Предполагалось, что Муссолини был заключен в отеле "Камио Императоре" на высоте 2212 метров. Единственный путь, ведший к отелю, — канатная дорога.