После первичных спасательных работ, возникает вопрос о политической поддержке будущего общества. Скай и Аракити твёрдо стоят за империю, остальные против. Вновь побеждает железная воля Ская, но Дарк и Мрак отказываются признать Империю. Они навсегда покидают Корректоров, и образуют собственную структуру, Конфедерацию. Между Конфедерацией и Империей начинается холодная война.
Скай демонстрирует выдающийся талант Императора, и получает поддержку Драко, Тайги и Викинга. Рэйдэн и Сумрак отказываются участвовать в политической жизни Империи, мотивируя это неуверенностью в своих силах после ошибки.
Несколько сотен лет продолжается планомерная ликвидация последствий Катаклизма, которая равно ведётся Империей и Конфедерацией. Напряжение в отношениях между структурами растёт. Скай официально отказывается признать Дарка за главу равноценного союза, рассматривая Конфедерацию лишь как автономную подструктуру Империи. Противостояние усиливается.
Рэйдэн ведёт с Диктаторами сложную игру, наотрез отказавшись увеличить их число. Парралельно он и Скай усиленно разыскивают по всей Галактике возможных природных мутантов, аналогичных Императору. Признаки Диктаторов, которые Рэйдэн внедрил в генетический код драконов, не передаются по наследству. Дарк заявляет, что он сделал это специально, Рэйдэн не отрицает.
Спустя много веков после Катаклизма Галактика имеет относительно устойчивую структуру, разделённую на Империю и Конфедерацию. Остальные политические формации столь незначительны по сравнению с главными, что их можно не брать в расчёт. Обе основные структуры тоталитарны, обе держатся на авторитете лидеров. Империя значительно превосходит Конфедерацию в военном и экономическом отношениях. Планетарные правительства, как правило, демократические. Общую координацию осуществляет Скай (в Империи) и Дарк (в Конфедерации). Противостояние между формациями постоянно растёт.
Приблизительно спустя 600 лет от возвращения Диктаторов, Рэйдэн обнаруживает сигнал древнего, неисправного темпорального маяка. Согласно этому сигналу, где-то родился новый природный Диктатор, не уступающий по своим возможностям Скаю. Начинаются глобальные поиски, которые продолжаются много лет. Постоянно происходят столкновения поисковых отрядов Империи и Конфедерации, нагнетается взрывоопасная обстановка. Успех сопутствует Империи, Рэйдэн и Скай обнаруживают молодого дракона по имени Винг, обещающего в скором времени стать наиболее могущественным Диктатором в мире. Винг принимает приглашение в организацию Корректоров, и становится ближайшим помощником Ская. Равновесие сил резко смещается в пользу Империи.
Дарк, поставленный перед фактом неизбежного распада Конфедерации, идёт на отчаянный шаг. Он нападает на корабль, несущий Аракити и её сына. Согласно разведданым, маленький сын Ская впервые в истории унаследовал Силу отца. Нападение имеет частичный успех — ребёнок исчезает в районе холодной планеты Мортар, а раненная Аракити вынуждена бежать с поля боя. Скай, придя в ярость, обьявляет Конфедерации войну.
На протяжении трёх лет в районе планеты Мортар ведутся отчаяные поиски исчезнувшего дракончика. Тем временем флот Конфедерации постепенно сдаёт позиции, натиск Империи не удаётся сдержать. Наконец, на третий год поисков удача поворачивается к Дарку лицом. Его агенты сообщают, что молодой Диктатор обнаружен. Дарк и Мрак лично отправляются на Мортар, о чём сразу узнаёт Скай. Император вместе с Драко, Тайгой, и Вингом, бросается наперерез. Происходит схватка между давними противниками, в которой Дарк терпит поражение. Он и Мрак изгоняются за пределы Галактики, Конфедерация вливается в Империю.
Три года спустя, Скай обьявляет о смене всего политического курса своего правительства. Отныне Империя перестаёт существовать, её сменяет сложная демократическая структура Ароан. Во главе Ароана стоит по-прежнему Скай, теперь Ароан-Вождь, внутренняя система правления исключительно сложна и организована по многоуровневому принципу. Инициаторы нового курса — Драко и Тайга Локхарты, разработавшие эту систему, и с помощью Винга испытавшие её на планете Уорр. Несколько лет Диктаторы пытаются внедрить новую систему, но безуспешно.
Тем временем Рэйдэн призывает Винга и Тайгу к себе на станцию, и раскрывает им свою главную тайну. Выясняется, что генетические изменения, ответственные за Силу Диктаторов, изобретены не Рэйдэном. Используя машину времени, он обнаружил в далёком будущем, на выжженой после ядерной войны планете Санлайт двух мутантов, молодых драконов Коршуна и Тикаву. Исследовав их, Рэйдэн пришёл к выводу, что те представляют собой следующую ступень эволюции. И тогда он задумал на редкость необычный шаг — похитив их сына, доставить его на Дракию, где тайно заменить на ребёнка семьи Фалькорров. Тайга и Винг приходят в ужас, но Рэйдэн обьясняет, что так как Скай уже Император, то обмен в любом случае имел место. Более того, он демонстрирует доказательства, что именно Тайга совершила обмен. Поставленные перед фактом, Диктаторы вынуждены согласится, и отправляются на Санлайт.
Именно в этот сложный момент возвращается Дарк. На этот раз он весьма тщательно подготовлен. Захватив машину времени Рэйдэна, он перехватывает корабль, на котором только-что рождённого Ская должны доставить на Дракию. С помощью Мрака он одерживает победу над Вингом, захватив его в плен. Тайга вынуждена бежать, чтобы предупредить остальных. Дарк, маленький Скай и Винг исчезают.
Диктаторы бросаются на помощь, что и предвидел Дарк. Используя машину времени он организует локальный хроноклазм, в котором Дарк — Император Галактики, а Ская никогда не существовало. Рэйдэн и остальные с трудом спасаются от флота Империи, теперь принадлежащего Дарку, и принимаются искать Ская. Рэйдэн убеждён, что Скай жив. Дарк правит, укрепляя свои позиции, Диктаторы пытаются восстановить контроль над Галактикой, Рэйдэн и Сумрак заняты поисками Винга. Драко и Тайга стараются удержать молодого сына Ская, Каэла, от нападения на Дарка. Назревает страшная война.
— Теория Времени — наиболее сложное достижение моего народа. Она ещё не до конца исследована.
— Скажи, почему мы не можем отправится в прошлое, и помешать Дарку до того, как он напал на нас?
— Потому что одна подобная попытка уже была. Ты не забыл?
(пауза)
— Но то была ошибка.
— Последствия которой мы пытаемся исправить до сих пор. И вспомни, что мои расчёты доказали — попытайся мы предупредить нас самих о Катаклизме, и произошёл бы парадокс. Именно тот, который сотворил Дарк.
