Эти и многие другие силы, от невидимых Странствующих Рыцарей, мстящих отрядов Расколотых легионов и до изгоев из Черных Щитов, сражались в Эре тьмы, иногда прибиваясь к той или иной стороне, а в остальное время преследуя собственные загадочные цели. Как и все, что касается той эпохи анархии, многие истории погибли в пламени войны, поглотившей Империум. Большинство тех битв в тенях навеки останутся безвестными, но их последствия, без сомнений, отзовутся в эпохах, и судьбы многих величайших героев и коварных деспотов, когда-либо возвышавшихся из массы человечества, навсегда были утеряны в Эре тьмы.
Разделенное королевство
За промежуток времени между возникновением Гибельного шторма в начале 007.М31 и основанием Робаутом Жиллиманом Империума Секундус в 010.М31, гражданская война разгорелась по всей галактике. Хотя большинство легионов, как предателей, так и лоялистов, представляли собой могучие армии под прямым командованием примархов, каждый из них имел меньшие по численности войска, которые выполняли многочисленные задачи по всему Империуму. С появлением Гибельного шторма многие из тех приданных сил были потеряны, отрезаны, изолированы или попросту исчезли без вести. Иногда возвратившиеся из внешней пустоты отряды крестового похода находили объятый пламенем Империум, и не знали, какая участь постигла братьев, поэтому обстоятельства вынуждали их творить собственную судьбу и определять свою принадлежность в галактике крови, войны и хаоса.
Целые когорты истораторов и мудрецов пытались сложить цельную картину статуса и расположения основных сил легионес астартес в тот период. По всей видимости, полностью ее составить не получится никогда, поэтому наши сведения остаются неполными.
Темные Ангелы
Большая часть 1-го легиона воевала с Повелителями Ночи почти на всем протяжении этого времени, а после того, как Лев одержал верх над примархом-предателем у Тсагуальсы, он направил в восточную часть галактики множество ударных отрядов с целью выследить раздробленных врагов. Многие из них не вернулись, выполняя задачи в сегментуме Ультима и за его пределами. Некоторые из этих групп сталкивались с такими же изолированными или осиротевшими силами легионес астартес. С некоторыми они находили общие цели, тогда как с другими сражались до смерти, ибо Гибельный шторм сделал невозможным все их попытки возвратиться домой или получить новые приказы.
Дети Императора
Пока предатели продвигались к Терре, практически весь III легион собрался в единый флот вокруг своего флагмана, «Гордости Императора», и долгие месяцы после Истваана-5 он переживал травматическое перерождение, превращаясь в нечто совершенно иное в погоне за недавно пробудившейся темной похотью. Со временем Фулгриму удалось вернуть контроль над блудными сыновьями и повести их на задание, в итоге которого он перешел на новую и устрашающую форму бытия. Оставшиеся Дети Императора получили приказ выслеживать и уничтожать лоялистов, которым посчастливилось скрыться. За дело с удовольствием взялись многие преторы легиона, и выполняли они его с крайней изобретательностью.
Железные Воины
После Истваана-5 Хорус поручил примарху Пертурабо взять штурмом ключевые миры-крепости лоялистов, в особенности те, что защищали пограничье сегментума Солар. К концу 009.М31 кампания находилась в самом разгаре, и, хотя основной флот Железных Воинов был вместе с примархом, значительные осадные контингенты действовали по всему Империуму.
Пока Железные Воины с трудом продвигались в удерживаемые лоялистами секторы, захватывая по пути главные миры-бастионы, они постепенно превращались в бессердечных поработителей, которые надзирали за снабжением предателей в недавно покоренных мирах. Из-за новой роли они нередко становились целями осиротевших легионес астартес, поэтому стали настоящими экспертами в отражении подобных налетов.
Белые Шрамы
Из-за коварства Альфа-легиона большая часть V легиона была втянута в длительную и ожесточенную войну с орками на Чондаксе, и когда взошли семена Ереси Хоруса, некоторое время было неизвестно, кому верен его примарх, Джагатай-хан. Те, кто действовал глубже в космосе, не знали о намерениях примарха, поэтому свою верность им пришлось определять самим. Позже примарх очистил легион от всех, кто занял сторону Хоруса, и изгнал тех, кто был близок к этому. Последних он отправил в самоубийственную кампанию по проникновению и убийствам, выпустив в галактику множество групп «Сагьяр Мазан», независимых охотников.
Космические Волки
Космические Волки понесли тяжелые потери в боях против легиона Тысячи Сынов на Просперо, а впоследствии и против Альфа-легиона, однако остались грозной силой, которую держали в резерве для защиты Терры от раннего и до среднего периода Ереси Хоруса. Тем не менее, по своим собственным причинам, еще раньше Леман Русс направил много небольших отрядов присматривать за другими легионами. Судьба некоторых из них остается для нас загадкой, а некоторые другие, вероятно, действовали или в одиночку, или же в составе групп вместе с другими похожими отрядами, отрезанными от командования своего легиона.
Имперские Кулаки
Большая часть Имперских Кулаков стояла гарнизоном на Терре со своим примархом, укрепляя оборону мира перед неизбежным вторжением Воителя. Однако многие из них потерялись или рассеялись на волнах варпа по дороге в или из системы Фолл, так что им пришлось воевать вместе с другими такими же изолированными группами легионес астартес. Прочих перед Ересью Хоруса расставили в качестве гарнизонов по бескрайнему Империуму, и с переходом планет в «Темную империю» Воителя многим этим войскам пришлось с боями отступать.
Повелители Ночи
В этот период времени Повелители Ночи представляли собою крайне раздробленный легион; в середине Трамасского крестового похода их флот попал в засаду Темных Ангелов, а примарх получил тяжелые ранения от руки своего брата. Севатар, Первый капитан легиона, попытался взять под контроль ядро Повелителей Ночи, но многие отдельные роты и ордены бушевали по целому сегментуму Ультима, выполняя темные кровопролитные задания среди звезд. До тех пор, пока весь легион не вернулся к примарху, эти отряды не воссоединялись в одно целое, но даже тогда некоторые предпочли остаться во тьме, привыкнув к ночи, которая стала им родной, и больше не желая подчиняться верховному командованию.