Генрих Брабантский с войсками двинулся снимать осаду с Яффы, но с полдороги возвратился, получив известие, что Яффа пала. Аль-Адил взял город штурмом, перебил гарнизон, в том числе несколько отрядов германских паломников, и полностью разрушил город. Вернувшись в Акру, герцог Брабантский принял на себя управление государством.
Через несколько дней, 20 сентября, в Акру с Кипра прибыл легат Конрад, архиепископ Майнцский, вместе с германскими князьями. Он предложил в мужья Изабелле и в короли кандидатуру недавно овдовевшего Амори де Лузиньяна, короля Кипра. Идея была удачной. Женившись на Изабелле, Амори объединял Акру и Кипр. Очевидно, выдвигая Амори, архиепископ Конрад имел в виду ленное подчинение объединенного государства германской короне. Бароны и ордены поддержали кандидатуру Амори, он сторонился партийных раздоров и был гораздо способнее своего брата Ги. Их выбор одобрил папа, рассчитывая объединить весь латинский Восток в одно государство. Амори согласился. В январе 1198 г. в Акре он вступил в брак с Изабеллой, а через несколько дней патриарх короновал их коронами короля и королевы Иерусалима. Это был четвертый брак Изабеллы (и третий ее брак как королевы).
С прибытием огромной германской армии стали отправляться домой оставшиеся после Третьего крестового похода французские крестоносцы. В октябре 1197 г. немцы и брабантцы под командой Генриха Брабантского двинулись, чтобы отвоевать Сидон и Бейрут. Подойдя к Сидону, они обнаружили его разрушенным и покинутым. Эмир Усама, морской разбойник, владевший Бейрутом, тоже начал его разрушать, но успел разрушить только часть стены, чем воспользовались крестоносцы и 24 октября вошли в город. Стены вскоре были восстановлены, и город передан как лен Жану д'Ибелену, сводному брату королевы. Теперь была восстановлена связь по суше между королевством и графством Триполи.
Поход на Иерусалим, намеченный императором Генрихом, решили отложить до весны, а пока отвоевать крепость Торон в Ливанских горах недалеко от Тира, ее гарнизон постоянно угрожал франкам на приморской равнине. В ноябре 1197 г. армия под командой Генриха, герцога Брабантского, и рейхсканцлера Конрада, епископа Хильдесхайма, осадила крепость, расположенную на высокой горе. С помощью горнорудных рабочих из германского Гослара, центра германских рудников, ушедших в крестовый поход, удалось пробиться через скалистые породы к стенам, начать подкопы под них и установить осадные машины. Осажденные, не надеясь на помощь, предложили сдать крепость вместе с пятьюстами пленными, если им будет гарантирована жизнь и сохранность личного имущества. Это предложение вызвало раздоры в христианском лагере, в котором не было единого руководства. Генрих Брабантский, находившийся в неприязненных отношениях с бездельником и сибаритом рейхсканцлером, и палестинские бароны были за то, чтобы принять предложение, немцы во главе с Конрадом -против, они настаивали на безусловной сдаче. Местные франки, опасавшиеся массовой резни после штурма, которая могла привести к джихаду, оповестили защитников и аль-Адила, что немцы пленных не берут. Осажденные поклялись умереть, но не сдаваться, а аль-Адил уговорил племянника аль-Азиза Османа Египетского выслать на помощь крепости армию. Энергия осаждавших начала ослабевать. В это время были получены известия о смерти императора Генриха VT в сентябре. Многие из германских предводителей заторопились на родину, чтобы быть дома при ожидавшихся раздорах и земельных переделах. И действительно, вскоре поступили вести о начавшейся в Германии гражданской войне между Штауфенами и Вельфами. Осаду решили снять. 2 февраля с юга приблизилась египетская армия. Простые солдаты хотели сражаться, но внезапно пронесся слух, что рейхсканцлер Конрад и предводители сбежали. Возникла всеобщая паника, армия бросилась бежать к морю и укрылась за стенами Тира.
5 марта 1198 г. в Акре на Коронном совете было решено возникшее во время Третьего крестового похода Германское госпитальное братство обратить в духовно-рыцарский орден святой Марии Тевтонской в Иерусалиме. Орден принял устав госпитальеров, вскоре после возникновения получил богатые земли в Германии и стал приобретать и строить замки в Святой Земле. Его первым владением была башня над воротами Сен-Никола в Акре, переданная ордену королем Амори. Вскоре они купили у правителя Тира замок Монфор и переименовали его в Штаркенберг. Позднее магистр ордена Герман фон Зальца перенес в него штаб-квартиру ордена.
Взятие Бейрута и возникновение Тевтонского рыцарского ордена — таковы были достижения Германского крестового похода. Снова, как ив 1190 г., смерть императора развалила германскую армию.
Амори с самого начала своего правления настоял на том, что правление обоими королевствами будет раздельным и что кипрские деньги короля нельзя будет тратить на нужды материкового королевства. Кипр был объявлен наследственным королевством, и наследником Амори — его сын Гуго. В королевстве на Святой Земле права наследования принадлежали королеве Изабелле, и в случае смерти Амори она могла вновь выйти замуж, и ее новый муж стал бы королем. Наследницей королевства была дочь Изабеллы от второго брака, Мария Монферратская. Даже если бы у Амори и Изабеллы родился сын, вряд ли он смог бы претендовать на корону. Фактически, однако, от этого последнего брака Изабеллы в живых остались две дочери, Сибилла и Мелизанда.
Амори оказался умным и энергичным королем. Вместе с Высоким судом он провел преобразование конституции таким образом, чтобы были ясно изложены королевские права. В упорядочении законов Амори помог Рауль Галилейский, его соперник относительно руки Изабеллы, известный правовед. Он выпустил «Livre au Roi» («Книгу короля»), новый свод законов королевства, который укрепил права короля. Амори, однако, не любил своего более молодого соперника и, связав с Раулем неудачное покушение на себя весной 1198 г. четырех германских рыцарей, вынудил его уйти в Триполи.
Как только германские крестоносцы отправились на родину, Амори начал переговоры о перемирии с аль-Адилом. Мир был нужен обеим сторонам, так как у Амори не было сил, а аль-Адил стремился войти во владение всем наследием брата. Перемирие было заключено 1 июля 1198 г. на пять лет и восемь месяцев. Яффа осталась за мусульманами, Бейрут и Жибле — за франками, а Сидон делился между ними. Смерть старого Жослена III де Куртне около 1200 г. не привлекла ничьего внимания.
Тем временем в Антиохии снова начались раздоры. В 1197 г. внезапно умер старший сын Боэмунда III Антиохийского, Раймунд, женатый на армянской принцессе. От него остался маленький сын Раймунд-Рубен, который должен был унаследовать Антиохию. Боэмунд III отправил вдову Алису с сыном в Киликийскую Армению, может быть, он хотел передать наследие сыну Сибиллы, а может быть, просто не хотел подвергать риску жизнь внука.
Внук Боэмунда прибыл в Сис в январе 1198 г., во время коронации Льва. Архиепископ Конрад Майнцский захотел обеспечить германскому императору ленное верховенство не только на Кипре, в Армении и, возможно, в Акре, но и в Антиохии. Он поспешил из Сиса в Антиохию и вынудил Боэмунда III и антиохийских баронов дать клятву, что наследником княжеского трона будет Раймунд-Рубен.
Он, однако, не учел двух обстоятельств: во-первых, того, что франки, греки и сирийцы в Антиохии боялись армянского регенства (Боэмунду III было 54 года, и он мог не дожить до совершеннолетия внука), и, во-вторых, беспринципного честолюбия младшего сына князя, графа Боэмунда Триполийского.
Молодой Боэмунд зарекомендовал себя человеком с шаткой моралью, однако хорошо разбиравшимся в законах и умевшим найти правовые аргументы, чтобы оправдать свои неправые действия. Он немедленно отказался признать законность принесенных в пользу Раймунда-Рубена клятв. Тамплиеры, ненавидевшие Льва за то, что тот отказался вернуть им Баграс (Гастен), поддержали графа. Госпитальеров молодой Боэмунд перетянул на свою сторону богатыми пособиями и обещаниями. Пизанцы и генуэзцы были привлечены обещанием торговых уступок. Антиохийская коммуна, боявшаяся господства армян, также была за него. В конце 1198 г. граф Боэмунд прибыл в Антиохию и прогнал отца, коммуна принесла ему клятву верности. Против молодого Боэмунда была только антиохийская латинская церковь, возглавляемая старым недругом графа, Петром из Ангулема, который, до того как стать патриархом в Антиохии, был епископом в Триполи.
Король Лев и армянский католикос забросали Рим потоком жалоб. Хотя папа Иннокентий III сомневался в искренности подчинения армянской церкви, он ни в коем случае не хотел отталкивать новых приверженцев. Неприятие действий молодого Боэмунда папой и патриархом заставили его примириться с отцом, вновь впустить его в Антиохию и возвратиться в Триполи. Старый Боэмунд теперь перешел на сторону сына. Тем временем тамплиеры развили в Риме бешеную деятельность. Иннокентий намекнул Льву, что если он хочет получить Антиохию, то должен отдать Баграс тамплиерам. Однако Лев ни за что не хотел расставаться с крепостью. Конференция с участием старого Боэмунда III, патриарха Антиохии Петра и короля Льва ни к чему не привела. Раздосадованный несговорчивостью Льва, патриарх перешел на сторону молодого графа Боэмунда, и, когда после смерти князя-отца в апреле 1201 г. тот прибыл в Антиохию, на его стороне были коммуна, ордены и церковь. Многие из дворян, особенно те, в чьих жилах текла армянская кровь, помня свою присягу и опасаясь деспотического характера Боэмунда, бежали в Сис.
