Всего в течение суток 12 апреля атаками штурмовиков было уничтожено 160 автомашин, 150 подвод и до 500 солдат и офицеров противника. Бомбардировочными действиями по населенным пунктам, занятым противником, было вызвано 10 больших взрывов и подожжен один железнодорожный эшелон.
Авиация Черноморского флота продолжала наносить удары по плавсредствам противника в порту Феодосия, а со второй половины дня — и по вражеским судам, производившим загрузку войск и техники в Судакской бухте. В районе мыса Херсонес прямым попаданием авиабомбы в корму был сильно поврежден немецкий эсминец.
В течение 12 апреля остатки разгромленной керченской группировки противника и немецко-румынские части, оборонявшие южное побережье Крыма, продолжали поспешно отходить на Севастополь. Отход осуществлялся по двум основным направлениям: сильно потрепанные части 98-й и 73-й пехотных дивизий, побросав большую часть техники и вооружения, отходили на автомашинах и частично пешим порядком по шоссе Старый Крым — Симферополь, а части группы «Кригер» и 2-й горнострелковой дивизии румын из района Камыши, Феодосия отходили вдоль южного побережья Крыма на Алушту — Ялту.
Большие потери отступавшему в панике противнику нанесли нападения крымских партизан, начавших с переходом в наступление войск 4-го Украинского фронта и Отдельной Приморской армии наносить сильные удары по врагу с тыла. Захватывая на основных коммуникациях отдельные населенные пункты или участки дорог, партизанские отряды вынуждали отступавшие немецкие части или с боем прорываться через эти населенные пункты и участки дороги, или обходить их, бросая или уничтожая при этом всю технику.
На 13 апреля командарм поставил войскам следующие задачи.
11-му гвардейскому стрелковому корпусу, действуя в направлении Новый Карабай, Цюрихталь, Васильевка, Карасубазар, к 15 часам подвижным отрядом выйти на линию Ново-Царицыно — Карасубазар. Главными силами к этому времени выйти на рубеж реки Мокрый Индол на фронте Новый Карабай — Цюрихталь.
3-му горнострелковому корпусу, действуя в направлении Владиславовка, Старый Крым, Салы, Карасубаши выйти подвижным отрядом на рубеж Карасубазар, Ени-Сала и главными силами на линию реки Мокрый Индол на фронте Акчора — Кишлав.
16-му стрелковому корпусу, действуя вдоль побережья Черного моря, выйти на рубеж в 15 км западнее города Судак и главными силами в район Судака.
Армейскому подвижному отряду по овладению городом Феодосия преследовать противника в направлении населенного пункта Карасубазар и к полудню овладеть последним.
Таким образом, глубина задач по преследованию противника была установлена командармом для подвижных корпусов не менее как 75–80 км. Беря в расчет, что с 13 апреля войска армии вступали в район горного Крыма, эти темпы, даже если и учитывать, что противник поставил себе в качестве основной цели как можно быстрее отойти в направлении Севастополя, были очень высокими. На территории горного Крыма действия основными силами армии возможны главным образом в направлении основных магистральных дорог. Действия вне дорог были возможны только небольшими подразделениями. Противник при отступлении широко использовал многочисленные инженерные заграждения, чему в немалой степени способствовал сам горный рельеф местности, не допускавший или сильно затруднявший обход и объезд заграждений, устроенных противником на дорогах.
Преследование противника по территории горного Крыма подвижными частями армии, согласно решению командарма, должно было вестись в двух основных направлениях. Во-первых, вдоль асфальтированного шоссе Феодосия, Старый Крым, Карасубазар, Симферополь, Бахчисарай, Севастополь, проходившего по северным отрогам Крымских гор, по сильно всхолмленной, но не типично горной местности, и допускавшей поэтому некоторую свободу маневра подвижными войсками и вне этой шоссейной дороги. Во-вторых, вдоль приморского шоссе Феодосия, Судак, Алушта, Ялта, Байдары, Севастополь, которое проходило по территории собственно горного Крыма с резко пересеченным рельефом местности и имело большое количество крутых поворотов, мостов и участков дороги, проложенным по карнизам и ущельям.
Учитывая характер местности, по которой предстояло с 13 апреля продолжать преследование противника войскам Отдельной Приморской армии, командарм принял решение основную массу подвижных частей направить в обход горной части Крыма по шоссе Феодосия — Симферополь и севернее его. В этом направлении действовали армейский подвижный отряд и подвижные части 3-го горнострелкового корпуса и 11-го гвардейского стрелкового корпуса.
Это направление действия основной массы подвижных частей, с одной стороны, обеспечивало быстрейшее соединение с войсками 4-го Украинского фронта для организации совместного преследования остатков войск противника, отступающих из районов Северного Крыма и с Керченского полуострова в направлении Симферополь, Бахчисарай, Севастополь, а с другой стороны, позволило три из четырех имевших в составе армии подвижных отряда направить по путям, параллельным направлению отхода частей противника, отступавших вдоль приморского шоссе, обогнать последних и по дорогам, соединяющим центральное и приморское шоссе, выйти им в тыл.
Для фронтального преследования отходившей по приморскому шоссе группировки противника был выделен 16-й стрелковый корпус, в голове которого действовал корпусной подвижный отряд.
К этому времени в подвижных отрядах корпусов резко увеличилось количество автомашин, выбывших по технической неисправности, вследствие чего резко сократилось количество мотопехоты. Так, подвижный отряд 16-го стрелкового корпуса, пройдя Ак-Монайские позиции, имел 130 человек пехоты и всего 7 автомашин. Пехота вынуждена была размещаться на броне танков, там размещалась и рота саперов (35 человек), обеспечивающая продвижение подвижного отряда через заграждения противника.
Примерно на треть сократилось к 13 апреля и количество танков, входивших в состав подвижных групп корпусов. Часть из них выбыла от огня противника, но большая часть вышла из строя из-за технической неисправности. Материальная часть большинства танковых полков и особенно 63-й танковой бригады была очень изношена. Значительная часть танков принимала участие еще в сражении за Кавказ, а потом с боями прошла путь от Владикавказа до Керченского полуострова. На многих танках моторы и коробки передач ремонтировались и менялись не менее четырех раз. В результате этого в составе роты тяжелых танков 63-й бригады из пяти танков КВ, имевшихся в ней к моменту перехода войск армии в преследование, после прохода рубежа Владиславовки в ночь с 12 на 13 апреля в строю остался только один тяжелый танк, остальные же четыре выбыли по техническим неисправностям.
Таким образом, в составе каждого из подвижных отрядов корпусов вместо предусмотренных приказом командарма горнострелковой дивизии или двух полков стрелковой дивизии к 13 апреля входило не более одного батальона мотопехоты, причем неполного состава, и около двух третей первоначального количества танков, в результате чего боевая мощь корпусных подвижных частей значительно уменьшилась. В несколько лучшем положении был армейский подвижный отряд, так как материальная часть автобатальона и танкового полка, входивших в его состав, была менее изношена. После короткой остановки для дозаправки горючим подвижные части армии в ночь на 13 апреля вновь устремились в погоню за противником.
К утру 13 апреля подвижный отряд 3-го горнострелкового корпуса достиг Старого Крыма, занятого еще накануне вечером партизанами. При дальнейшем движении по магистрали Старый Крым — Симферополь отряд был остановлен огнем противника с восточной окраины населенного пункта Салы. Попытка овладеть им лобовой танковой атакой не удалась. Тогда в обход был направлен один из батальонов 63-й танковой бригады, который, выйдя в тыл противника, стремительным ударом с запада заставил немецкий отряд, оборонявший этот населенный пункт, отступить в направлении города Судак, бросив вооружение и технику. На преследование боевой группы противника был направлен передовой отряд 414-й стрелковой дивизии, который, настигнув остатки этой группы, окружил их и уничтожил. Часть немецкого отряда была рассеяна по горным лесам, где вскоре была уничтожена партизанами. После захвата населенного пункта Салы путь на Карасубазар был открыт.
Совершив тридцатикилометровый марш, подвижный отряд к 11 часам ворвался в Карасубазар (Белогорск). Примерно в это же время сюда подошел и подвижный отряд 11-го гвардейского стрелкового корпуса, действовавший через Новый Карабай, Цюрихталь и Васильевку.
В районе Карасубазара подвижные отряды Отдельной Приморской армии во взаимодействии с подошедшими к 16.00 с северо-востока частями 4-го Украинского фронта и 5-й бригады крымских партизан из Северного соединения окружили большую группу противника общей численностью более 5 тысяч человек. В окружении оказались подразделения 198-го саперного батальона, 282-го и 290-го пехотных полков 98-й пехотной дивизии, 170-го и 213-го пехотных полков 73-й пехотной дивизии, а также ряд других подразделений из состава тыловых частей керченской группировки противника. После короткого боя окруженной группе противника были нанесены большие потери. Остатки ее общей численностью до 2 тысяч человек сдались в плен. Лишь отдельным небольшим подразделениям противника удалось прорваться сквозь кольцо окружения и уйти в горы, где они вскоре были уничтожены или пленены посланными для их преследования подразделениями партизан.