15 января 1814 года в Баратарии проходила широкая распродажа рабов и награбленных товаров. Таможенное ведомство отправило 12 солдат во главе с лейтенантом Стаутом для конфискации нелегального товара, но по прибытии на место отряд был атакован, Стаут убит, двое солдат тяжело ранены, остальные взяты в плен и через несколько дней отпущены на свободу.
Спустя два месяца окружной прокурор Граймз докладывал губернатору штата, что за полгода пиратами было завезено в Баратарию товаров на 1 млн долларов. По меньшей мере одна десятая часть жителей Нового Орлеана была связана с нелегальной торговлей, и в иные дни в пиратском логове собиралось до 500 новоорлеанских скупщиков краденого.
В июне 1814 года судно федеральной полиции задержало корабль баратарийца по прозвищу Джанни Огненная Борода, который ограбил 2 испанских судна. 18 июля судья Холл уведомил Пьера Лафитта, арестованного на улице, что Огненная Борода назвал его, Лафитта, своим сообщником.
3 сентября того же года в Баратарию прибыл британский бриг под командованием капитана Локкайера. Последний передал Жану Лафитту письмо генерала Николса, командующего английскими войсками во Флориде. Шла война между Британией и США, и англичане хотели использовать флибустьеров Баратарии в качестве лоцманов. Лафитту предлагали чин капитана 1 ранга и 30 тыс. долларов, но он отказался сотрудничать с англичанами, о чем уведомил губернатора Луизианы. Последний простил пирату его прошлые прегрешения и закрыл глаза на «неожиданное» бегство Пьера Лафитта из городской тюрьмы. В то же время находившийся в Новом Орлеане коммодор американского флота Дэниэл Т. Паттерсон и командир 44 го пехотного полка полковник Т. Росс, имея инструкции морского министра атаковать пиратскую базу в Баратарии, 11 сентября подготовили против флибустьеров карательную экспедицию. 16 сентября американские солдаты атаковали Баратарию, захватили стоявшие там суда с грузами и взяли в плен около 80 пиратов, в том числе старшего брата Лафитта – Доминика по прозвищу Капитан Доминго, а также Рене Белюша. Укрепления Баратарии были срыты, дома разрушены.
17 декабря 1814 года, в связи с угрозой британского вторжения в Луизиану, командующий военным округом генерал Эндрю Джексон приказал выпустить из тюрьмы баратарийцев, изъявивших желание сражаться против англичан, и обещал представить президенту США прошение о помиловании бывших пиратов. 20 декабря Жан Лафитт был лично представлен генералу Джексону и в ходе беседы подтвердил желание своих людей помочь американским войскам.
23 декабря началось сражение за Новый Орлеан. Все попытки англичан захватить город были отбиты, баратарийцы, охранявшие форт Сент-Джон на северной окраине, проявили невероятную стойкость и умение палить из пушек. В первых числах января 1815 года англичане отступили. Генерал Джексон официально поздравил Капитана Доминго и Рене Белюша, командовавших 3 й и 4 й батареями, и отметил «мужество и верность» братьев Лафитт. В середине марта того же года из Вашингтона в Новый Орлеан доставили декрет о полном прощении баратарийцев; документ был подписан президентом США Джеймсом Мэдисоном и государственным секретарем. Хотя братья Лафитт получили амнистию, все их имущество было конфисковано. Чтобы поправить дела, они решили снова заняться незаконным промыслом – контрабандной торговлей и пиратством.
В начале 1817 года братья Лафитт согласились стать тайными агентами испанской разведки, получив кодовые номера 13—1 (для Пьера) и 13—2 (для Жана). Испанские власти в Гаване поручили им внедриться в среду флибустьеров, действовавших в Мексиканском заливе, что они и сделали, преследуя свои интересы.
23 марта того же года братья прибыли на шхуне «Кармелита» к острову Галвестон в Техасе, где вели переговоры с французским корсаром Луи д’Ори и мексиканским партизаном Франсиско Миньей. 7 апреля флотилии д’Ори и Миньи отплыли из Галвестона на освобождение Мексики, а Жан Лафитт приступил к оборудованию на острове своей базы.
Луи д’Ори, поссорившись с Миньей, вернулся в Галвестон 4 мая и с удивлением увидел, как несколько десятков корсаров возводят на берегу дома и склады. Узнав, что он здесь больше не командует, д’Ори ушел в другие края. Вскоре на Галвестоне поселились ветераны Баратарии Джанни Огненная Борода, Венсан Гамби и Рене Белюш, получивший каперскую грамоту от самого Симона Боливара.
Летом 1818 года американский государственный секретарь вручил президенту Монро меморандум, в котором говорилось: «…так как территория между реками Сабина и Рио-Браво является Луизианой, Галвестон принадлежит нам. Прекрасным случаем подтвердить наш суверенитет была бы посылка экспедиции против Лафиттов». Монро начертал на полях меморандума: «Согласен, но действуйте без ажиотажа. Уведомите Лафиттов, что им надлежит убраться». Приказ очистить бухту и остров Галвестон был вручен Жану Лафитту в конце лета полковником Грэмом. Лафитт сделал вид, что готов подчиниться, но в действительности продолжал использовать Галвестон в качестве своей главной базы. Весной 1819 года республиканское правительство Мексики официально назначило его губернатором острова.
3 января 1821 года в Галвестон прибыла американская военная шхуна «Энтерпрайз» под командованием капитан-лейтенанта Кирни. Последний передал Жану Лафитту требование правительства США ликвидировать галвестонскую базу. 2 марта того же года это ультимативное требование было выполнено.
Командуя черной шхуной, Жан Лафитт продолжал рыскать по просторам Мексиканского залива и Карибского моря. Его брат Пьер умер у берегов Юкатана в ноябре 1821 года. Жан, совмещая контрабандную торговлю неграми рабами с морским разбоем, вертелся в кубинских водах до января 1822 года, когда его судно было расстреляно из пушек английским военным кораблем. Вплавь он добрался до кубинского берега, где в окрестностях города Санта-Крус-дель-Сур его схватила испанская стража. Несколько недель Жан Лафитт провел в тюрьме города Пуэрто-Принсигги (совр. Камагуэй), затем его перевели в больницу Сан-Хуан-де-Дьос, откуда он сбежал 13 февраля того же года. Губернатор Пуэрто-Принсипи писал 19 марта, что Жан Лафитт находится вместе с бандой пиратов на якорной стоянке Ринкон-Гранде в одной лиге от Виаро (на северном побережье Кубы). Видимо, в течение нескольких лет он продолжал заниматься нелегальной работорговлей, затем след его потерялся.
По мнению ряда исследователей, 7 июня 1832 года под именем Джона Лафлина он сочетался в Чарлстоне браком с Эммой Мортимер. 4 апреля 1834 года у них родился сын Жюль, а два года спустя – второй, названный Гленном. В 1836 году супруги поселились на берегу Миссисипи в Сент-Луисе, где Джон Лафлин открыл контору по торговле орудийным порохом. В 1848 году Жан Лафитт – уже под собственным именем – совершил поездку во Францию, куда он доставил груз пороха для «неизвестного покупателя».
