Населенность Европейской России в зависимости от причин, обусловливающих распределение населения империи. Статистический временник, II, вып. первый. – СПб., 1871.
Обозрение деятельности Общества по общей географии. «Двадцатипятилетие Русск. геогр. общества». – СПб., 1872.
О прежних руслах Амударьи. «Московские ведомости», № 294.-М., 1873.
О деятельности Брюссельской географической конференции. «Известия РГО». -1876.
Землеведение Азии К. Риттера. Т. IV. Дополнение к т. III. Сост. П. П. Семеновым и Г. Н. Потаниным. – СПб., 1877.
Землеведение Азии К. Риттера Т. V. Пер. и изд. под руководством П. П. Семенова. – СПб., 1879.
Мураевенская волость (Данковского у. Рязанской губ.). «Сборник материалов для изучения сельской поземельной общины».-СПб., 1880.
Статьи в издании «Статистика поземельной собственности и населенных мест Европейской России», издание Ц. С. Ком., вып. I, II, IV, V – СПб., 1880–1884.
1) Несколько общих выводов из данных по статистике поземельной собственности и населенных мест Центральной Земледельческой области, вып. I. – СПб., 1880.
2) Несколько общих выводов и данных по статистике поземельной собственности и населенных мест Московской промышленной области, вып. II. – СПб., 1881.
3) Несколько общих выводов из данных по статистике поземельной собственности и населенных мест Нижне-Волжской области, вып. IV – СПб., 1884.
4) Несколько общих выводов из данных по статистике поземельной собственности и населенных мест губерний Литовской и Белорусской групп, вып. V – СПб., 1882.
О возвращении Амударьи в Каспийское море. «Московские ведомости», № 45. – М., 1881.
О возвращении Амударьи в Каспийское море (окончание). «Московские ведомости», № 46. – М., 1881.
Область Крайнего Севера Европейской России в ее современном экономическом состоянии. «Живописная Россия». Отечество наше в его земельном, историческ., племен. и бытовом значении. Под общ. ред. П. П. Семенова. Т. I. -СПб.;М., 1881.
Озерная область в ее современном экономическом состоянии. То же издание. Т. I. – СПб.; М., 1881.
Эрмитаж и картинные галереи Петербурга. То же издание. Т. I.-СПб.; М., 1881.
Общий обзор экономического состояния Финляндии. То же издание. Т. П. – СПб.; М., 1882.
Белорусская область в ее современном экономическом состоянии. То же издание. Т. III. – СПб.; М., 1882.
Литовская область в ее современном экономическом состоянии. То же издание. Т. III. – СПб.; М., 1882.
Общий обзор коневодства по данным переписи 1882 г. Конская перепись 1882 г. Изд. Гл. Упр. Гос. Конноз., с. IX–XXX.
Краткое руководство для собирания жуков или жесткокрылых (Coleoptera) и бабочек или чешуекрылых (Lepidortera). – СПб., 1882. 2 изд. – СПб., 1893.
Список жесткокрылых, собранных в 1879 г. Г. Н. Потаниным, определенных П.П.Семеновым. «Очерки Сев. – Зап. Монголии Г. Н. Потанина», вып. III. – СПб., 1883.
Западная Сибирь в ее современном экономическом состоянии. «Живописная Россия». Отечество наше в его земельном, историческ., племен. и бытовом значении. Под общ. ред. П. П. Семенова. Т. XI. – СПб.; М., 1884.
Небесный хребет и Заилийский край. То же издание. Т. X.-СПб.; М., 1885.
Географическо-статистический словарь Российской империи. TV. – СПб., 1885.
Этюды по истории нидерландской живописи, ч. I. – СПб., 1885. Приложение к Вестнику изящных искусств.
Речь в честь проф. Норденшельда. «Известия РГО». Т. XVIII.-СПб., 1885.
Речь о Н.М.Пржевальском. «Известия РГО». Т. XXII, вып. 1.-СПб., 1886.
Речь на юбилее И.К.Айвазовского. «Известия РГО». Т. XXIII.-СПб., 1887.
Туркестан и Закаспийский край в 1888 году. «Известия РГО». Т. XXIV. – СПб., 1888.
Речь в память Н.М.Пржевальского. «Известия РГО». Т. XXIV.-СПб., 1888.
Отчет о путешествии в Туркестан. «Турк. Вед.», 1888. № 43.
(Биографический очерк) «Г.Н.Потанин». – «Нива», 1888. № 5.
Этюды по истории нидерландской живописи, ч. II. – СПб., 1890. Приложение к Вестнику изящных искусств.
Речь в чрезвычайном собрании РГО по случаю VIII съезда русских естествоиспытателей и врачей 3 января 1890. «Известия РГО». Т. XXVI. – СПб., 1890.
Отзыв о трудах Г. Е. и M. Е. Грумм-Гржимайло. «Отчет РГО» за 1891.
Значение России в колонизационном движении европейских народов. «Известия РГО». Т. XXVIII. – СПб., 1892.
Сибирь и Великая Сибирская железная дорога. – СПб., 1893 (Изд. составлено при участии П. П. Семенова).
Предисловие к соч. «Тангутско-Тибетская окраина Китая и Центральная Монголия» Г. Н. Потанина. – СПб., 1893.
Предисловие, заключение и пр. в соч. Г. Е. Грумм-Гржимайло «Описание Амурской области». Под. ред. П. П. Семенова. – СПб., 1894.
Землеведение Азии К. Риттера. Восточная Сибирь. Озеро Байкал и прибайкальские страны. Забайкалье и степь Гоби. (Новейшие сведения об этих странах 1832–1890 гг. и т. д.), ч. I, сост. П. П. Семенов, И. Д. Черский и Г. Г. ф. Петц. – СПб., 1894.
То же, ч. II, сост. те же. – СПб., 1895.
История полувековой деятельности РГО 1845–1895. При содействии А. А. Достоевского. Т. I–III. – СПб., 1896.
Речь на юбилейном собрании РГО 21 января 1896. «Известия РГО», т. XXXII, вып. I. – 1896.
Сибирь и торговля России с Китаем и Японией. Статья в сборнике «Производительные силы России» к Всероссийской Нижегородской выставке, под ред. В. И. Ковалевского. – СПб., 1896.
Характерные выводы из первой всеобщей переписи. «Известия РГО». Т. XXXIII. – СПб., 1897.
Сибирь. Статья в издании «Окраины России. Сибирь, Туркестан, Кавказ и полярная часть Европейской России». Под ред. П. П. Семенова. – СПб., 1900.
Общий обзор (в разделе: Пространство, население и государственное устройство) в книге: «Россия в конце XIX века», изд. для Всемирной выставки в Париже, под ред. В. И. Ковалевского. – СПб., 1900.
Заключение П. П. Семенова о трудах П. К. Козлова, А. Н. Казнакова и В. Ф. Ладыгина. «Отчет РГО» за 1902 г.
Общее руководство (совместно с В. И. Ламанским) изданием «Россия – полное географическое описание нашего отечества», под ред. В.П.Семенова. Изд. А. Ф. Девриена. 1899–1914.
Кроме общего руководства изданием, П. П. Семеновым написаны очерки:
1) Растительный и животный мир. Т. П. Гл. 3 (с А. П. Семеновым; П. П. принадлежит описание растительного мира).
2) Исторические судьбы Среднерусской черноземной области и культурные ее успехи. Т. II. Гл. 4 (с В. П. Семеновым).
3) Замечательные населенные места и местности в т. 1, гл. 8 и 9, в т. II, гл. 8 и 9 (с В. П. Семеновым) и значительная часть гл. 8 и 9 в томах III, VI и VII.
Слово президента П. П. Семенова-Тян-Шанского в торжественном юбилейном собрании Русского энтомологического общества 26 февраля 1910 года. «Русское энтомологическое обозрение». Т. X, № 1–2. 1910.
Новая картина в собрании Б. И. Ханенко. «Старые годы», 1910.
Мемуары. Т. III. Эпоха освобождения крестьян в России (1857–1861). Петроград, 1915.