Казалось, Путин на 100 % доверяет Медведеву. Собственно, он охотно стал бы президентом и в третий раз, но старая Конституция запрещала пребывание на этой должности три срока подряд. Зато возвращению Путина в Кремль после перерыва ничто не мешало. Ему нужно было заполнить лишь один пробел в сроке своих полномочий, и для этой роли он не нашел никого более подходящего, чем своего давнишнего верного управляющего делами Медведева. Но для этого нужно было подробно обсудить план действий. Поэтому никого не удивило, что первым официальным актом Медведев объявил своего покровителя премьер-министром. Все вопросы о назначениях должны были быть согласованы между президентом и премьером. Согласно Конституции в главные компетенции главы государства входит оборона, внутренняя и внешняя политика и безопасность. Во время президентства Путина высокопоставленные чиновники представали перед ним с отчетом каждую субботу. При Медведеве постоянные заседания этой группы лиц не проводились. Сложилось впечатление, что «силовые министры» продолжали служить Путину. Медведев заседал в Кремле, как в тюрьме, окруженный верными путинскими соглядатаями, в основном, выходцами из спецслужб.
В течение трех лет Медведев не мог назначить ни одного из своих доверенных лиц на главные посты. А Путин, напротив, в кадровой политике опирался на партию «Единая Россия», которую сам лично и возглавлял. Медведев не симпатизировал «Единой России» и даже инкриминировал ей нечестную конкуренцию в региональных выборах. Он критиковал монополию этой партии и выражал надежду на появление политической альтернативы. Неудивительно, что партия власти подчинялась только Путину, а Медведева игнорировала. «Единая Россия» была сильна, партия обладала абсолютным большинством в Государственной Думе, как и почти во всех региональных парламентах. Хотя Медведеву и удалось уволить нескольких засидевшихся губернаторов, их последователи были набраны опять же из рядов «Единой России». Теоретически кремлевской партии вменялось в обязанность подготовить кандидатуры выдвиженцев для следующих президентских выборов. На эту партию Путин мог положиться. Она без промедления оказала бы ему поддержку, пожелай он снова вступить в Кремлевские палаты.
Однако, к большому удивлению многих наблюдателей, путинский воспитанник Медведев в роли президента выработал свою собственную программу, отличную от идей Путина. Медведев отличался от спецслужби-стов в окружении Путина либеральным образом мыслей. Это бросалось в глаза еще раньше. Медведев был единственным из ведущих политиков Кремля, который в 2002 году осмелился критиковать арест Ходорковского. В начале 2007-го — за год до того, как стать президентом, — он выступил на экономическом форуме в Давосе на тему необходимости интеграции России в мировую экономику и официально отрёкся от политики протекционизма в собственной стране. Это был мужественный жест, ведь тем самым он противоречил царящим тогда в России настроениям. После этого международного выступления Путин жестко отчитал своего бывшего заместителя и поднял вопрос о пригодности
Медведева на должность президента. Почему же он все-таки его выбрал? Путин должен был понимать, что Медведев, как президент, придал бы российской политике либеральную окраску. Многие наблюдатели не исключали, что назначение Медведева было сделано с прицелом на Запад. Россия, хотела она того или нет, должна была провести экономическую модернизацию, для чего нуждалась в технически более продвинутой Европе. Кстати, подобными соображениями руководствовались 25 лет назад старцы из Политбюро СССР, когда они выдвинули в партийную верхушку самого молодого из них, 50-летнего Горбачева. Горбачев должен был вызвать симпатию Запада. Медведев призван был сыграть такую же роль.
Однако сколь унизительным должно было быть для Медведева то, что Путин с первого дня ограничил свободу его действий. Путин доверительно сообщил одному журналисту, как его нервирует второстепенная роль в качестве премьера. Ничего-то ему не нравилось: ни квалификация подчиненных, ни уровень собеседников, ни радиус действия его решений. Поэтому он попытался наподобие вожака стаи (срав. с WikiLeaks) доминировать над Медведевым. Когда свежеиспеченный президент Медведев собрался во Францию на переговоры с французским председательством в совете ЕС, подчиненный ему премьер просто оттеснил его в сторону и сам объявился в Париже. Иностранные политики, например, Барак Обама, пытались поддержать Медведева в противостоянии с Путиным, однако это же и обернулось против них. Им было разъяснено, что в будущем для любого государственного гостя посещение Путина является обязательным. Не случайно американский журнал Forbes в своем списке самых влиятельных политиков мира назвал Путина в числе первой пятерки. Медведев же занял только двенадцатое место.
В течение трех лет Медведев воспринимался собственной элитой и населением России как дублер Путина. К нему прислушивались, потому что Путин указал на него пальцем. На месте Медведева любой другой политик мог бы почувствовать, что решающим является исключительно авторитет Путина. При Путине любой президент казался заменяемым. Однако Медведев медленно, но верно пробивал дорогу наверх. Он ругал министров и депутатов, взявших за привычку во время обращения президента шептаться и не слушать его. Через два года Медведев на одном из заседаний правительства пожаловался, что его указания на 80 % игнорируются. Медведев понимал, где находилось основное препятствие — на верхних этажах государственных концернов, где успешно засели путинские офицеры спецслужб. Медведев потребовал преобразования государственных монополий в акционерные общества, даже установил сроки. Но из этого ничего не вышло. Бюрократия высокомерно проигнорировала приказы главы государства, потому что Путин придерживался другого мнения. Оружием Путина стали государственные телевизионные каналы. Над ними он имел гораздо большую власть, чем новый глава Кремля. Чтобы донести свои послания до общественности, Медведеву пришлось прибегнуть к Интернету. Так он начал общение со своими избирателями посредством блогов.
Уместятся ли два царя на одном троне?
Отказ в помиловании Ходорковскому? — Первые трения — Медведев увольняет Лужкова — «Ручное управление» Путина во время кризиса — Путин — социальный царь
В 2009 году Медведев опубликовал в Интернете революционную статью с названием «Россия, вперед!». В ней он критически разбирал истощенную экономическую систему и дефицит демократии на своей родине. Путин не интересуется Интернетом. По его мнению, большинство публикаций в Интернете являются «чистой порнографией».
Не имея возможности направлять оперативную работу правительства в желаемом русле, Медведев сконцентрировался на улучшении функционирования правового государства. Он объявил войну правовому нигилизму и коррупции. На этом опасном поле столкновение с Путиным было неизбежно. Когда Путин открыто высказался по поводу жесткого наказания для Ходорковского, Медведев обрушил на него острую критику: ни один государственный чиновник не имеет права вмешиваться в ведущийся процесс. Медведев резко выступил против практикуемой «телефонной юстиции». Второй судебный процесс против Ходорковского продемонстрировал, как произвольно интерпретируют закон независимые суды после телефонного разговора со своим начальством.
Медведев хотел освободить Ходорковского как можно скорее, потому что видел, что скандальный процесс по делу «Юкоса», ведомый «управляемым» судом, нанёс вред имиджу его страны. Ходорковского в суде активно защищали даже некоторые ориентированные на реформы министры, но судья наказал подсудимого так жестко, как того потребовала прокуратура. По-видимому, политики, засудившие Ходорковского, хотели сначала услышать четкое признание вины от приговоренного и только после этого объявить о его амнистии. Они хотели уничтожить Ходорковского политически, чтобы позже он не мог бросить им вызов в качестве главы оппозиции. Несоразмерно жестокое обхождение с Ходорковским в то же время содержало предупреждение другим олигархам держаться подальше от политики.
Медведев не мог всерьез ставить под сомнение существующую путинскую систему, в создание которой он внес немаловажный вклад в качестве руководителя администрации Президента России. Но на бесчисленные законы, вновь выдвигаемые приверженцами жёсткого курса из Думы для создания авторитарной системы заново, он накладывал свое вето. Законы для усиления секретных служб и усиленного контроля над неправительственными организациями он поручил законодательным органам переработать. Он также заново переписал закон об ограничении свободы митингов и собраний. Медведев на свой лад симпатизировал либеральным оппозиционным партиям. В то время, когда Путин клеймил либералов, называя их паразитами и ворами, оспаривал их право на протест, Медведев добился того, чтобы они, даже не имея мест в Парламенте, получили право ежегодно выступать перед собранием депутатов. Медведев публично критиковал созданную Путиным систему управляемой демократии. Путинскому заигрыванию с китайской моделью он дал от ворот поворот. Если партия «Единая Россия» для своей правовой политики взяла за образец наводившего страх царя Александра III, то Медведев по случаю 150-летнего юбилея отмены крепостного права похвалил сторонника свободы «царя-освободителя» Александра II.