По окончании училища в июле 1968 г. назначен командиром танкового взвода танкового батальона отдельного танкового полка армии Группы советских войск в Германии.
В сентябре 1971 г. Ю.М. Неткачёв назначен командиром роты тяжелых танков танкового батальона отдельного танкового полка общевойсковой армии Группы советских войск в Германии.
В августе 1973 г. поступил в Военную академию бронетанковых войск.
По окончании академии в июне 1976 г. назначен начальником штаба — заместителем командира гвардейского танкового полка мотострелковой дивизии Краснознаменного Дальневосточного военного округа.
В ноябре 1977 г. Ю.М. Неткачёв назначен командиром гвардейского танкового полка гвардейской танковой дивизии Дальневосточного военного округа. В мае 1980 г. — заместителем командира мотострелковой дивизии ДВО.
Через год в августе 1981 г. назначен командиром танковой дивизии Дальневосточного военного округа, а в августе 1982 г. — командиром учебной танковой дивизии Дальневосточного военного округа.
В августе 1986 г. поступил на основной факультет Военной академии Генерального штаба ВС СССР им. К.Е. Ворошилова, которую окончил в июле 1988 г. По окончании академии был назначен первым заместителем командующего гвардейской танковой армией.
В январе 1992 г. назначен командующим 14-й гвардейской армией. В июле 1992 г. — командующим армией в Приволжском военном округе.
25 января Молдова объявляет о введении своей национальной валюты — лея. На территории ПМР лей не признается и не имеет хождения.
15 февраля президент Республики Молдова Мирна Снегур издал указ о передаче комплекса зданий и сооружений Главного командования войск Юго-Западного направления Министерству обороны Молдовы. Затем Кишинев представляет в Москву список частей и объектов бывшей Советской армии, которые немедленно должны отойти молдавской стороне. Все это явно указывало на то, что Молдова форсированными темпами стремилась «накачать военные мышцы», имея далеко идущие планы.
1 марта спецслужбы Молдовы совершают убийство начальника отдела милиции города Дубоссары майора И.С. Сипченко. В ответ на эту провокацию казаки Черноморского казачьего войска захватывают здание полиции и арестовывают 27 молдавских полицейских.
2 марта отряд полиции особого назначения Республики Молдова, переодевшись в гражданскую одежду, переходит по льду через водохранилище Дубоссарской ГЭС и захватывает полк гражданской обороны в селе Кочиеры.
В заложниках оказались офицеры полка и их семьи. Полк официально в состав 14-й армии не входил, а подчинялся Вооруженным силам СНГ. Командующий 14-й армией генерал-майор Ю.М. Неткачёв категорически отказался вмешиваться в этот конфликт. Он послал туда разбираться начальника штаба армии генерал-майора В.И. Ситникова, начальника разведки армии полковника С.Ф. Харламова и своего помощника по воспитательной работе полковника A.M. Баранова.
Опоновцы их продержали под обстрелом полтора часа и разговаривать с ними не стали.
Больно и стыдно было наблюдать, как на защиту офицеров полка и их семей выступили не части 14-й армии, а гвардия ПМР во главе с майором В.А. Воронковым. Во время этого боя он и еще три гвардейца погибли (прапорщик Л.А. Толстенко, сержант СВ. Титовский, рядовой СИ. Шинков), 21 человек был ранен. Семьи офицеров и прапорщиков были освобождены и вывезены из военного городка.
3 марта на трассе между населенными пунктами Ташлык и Григориополь ночью обстреляли машину скорой помощи, которая везла из молдавского села Спея в больницу роженицу. Погибла акушерка, получила множественные ранения сама роженица и водитель.
На следующий день И.Н. Смирнов обвинил в случившемся молдавских волонтеров и ввел чрезвычайное положение в Дубоссарском районе.
В 1993 г. выступая по местному независимому телевизионному каналу «АСКЕТ», свидетель случившегося Р. Сабиров, бывший рижский омоновец, сообщил, что машину по «ошибке» расстреляли приднестровские чекисты В. Никитенко и С. Бубнов.
7 марта у штаба 14-й армии в Тирасполе проводится пикет забастовочного женского комитета. Женщины требовали снять с должности командующего Ю.М. Неткачёва за бездействие и перевести армию под юрисдикцию ПМР.
Приднестровские власти не теряли времени даром. Все, что говорилось в штабе 14-й армии на совещаниях, все приходящие шифровки, конфиденциальные беседы и совещания в кабинете командующего моментально становились известны руководству ПМР и Республики Молдова. Неткачёв поставил задачу особому отделу армии найти, откуда происходит утечка информации. И нашли. В штабе армии работала уборщицей незаметная женщина, такая «серая мышка», которая и установила подслушивающие устройства в кабинете командующего армией и зале заседаний Военного совета армии. Но это — был один из «ручейков».
Оставалось еще много офицеров и прапорщиков, которые понимали, что центральная власть их предала в угоду собственных амбиций. А им предстоит жить на этой земле вместе со своими семьями. Поэтому для Ю.М. Неткачёва не являлось секретом то, что большинство военнослужащих симпатизировали ПМР и были готовы ей всячески помогать.
11 марта в Дубоссарах полицейскими Молдовы были захвачены старший помощник прокурора В. Ливоненко и следователь И. Сачинский.
13 марта подполковник В.И. Жерегеля, командир эскадрильи военно-транспортной авиации Вооруженных сил СНГ, вылетел на разведку погоды. В районе сел Моловата и Кочиеры его самолет был обстрелян опоновцами Молдовы. Один двигатель был поврежден, и его самолет еле дотянул до аэродрома в Тирасполе.
В период с 3 по 16 марта Вооруженным силам Молдовы удалось захватить на левом берегу р. Днестр населенные пункты Новая Маловата, Кочиеры, Пырыта и Кошница, а в районах населенных пунктов Роги и Дороцкое два участка дороги Тирасполь — Рыбница. Сообщение по трассе Рыбница — Тирасполь было прервано. Но в результате ответных действий со стороны приднестровцев дорогу удалось отбить.
С целью хоть как-то воспрепятствовать успешным действиям Вооруженных сил Молдовы приднестровцами были взорваны мосты через р. Днестр возле населенных пунктов Дубоссары и Бычок.
14 марта женщинами, приезжими казаками и гвардейцами ПМР были захвачены склады с оружием в селе Парканы (батальон радиоэлектронной борьбы (РЭБ) 14-й армии, командир батальона подполковник А.Н. Петрясов). О планах приднестровской стороны по захвату парканского батальона РЭБ особый отдел и командование 14-й армии предупреждало Министерство обороны и ФСБ России. Однако никаких мер со стороны Москвы по пресечению намечаемых действий ПМР принято не было.
Со складов были вывезены 1307 автоматов, 255 пистолетов и полтора миллиона патронов. Вот как описывает этот случай Г.С. Андреева: «После того как были захвачены арсеналы, всё, что было в арсеналах, мы передали ребятам из ТСО, казакам 4KB, Дона и Кубани».
Просто взяли и передали без всякого учета, росписи. Передали — и всё. Хотя в ПМР уже были официально сформированные собственные вооруженные формирования — гвардия ПМР. Захватывали всё, что могли: шинели, котелки, машины, гранаты… Но самое страшное было то, что не было никакого учета оружия.
15 марта в районе села Рога был обстрелян автобус с туристами из Харькова. Пассажиры в панике пытались выбросить белый флаг, но это не помогло. Погибло двое пассажиров, один был ранен.
16 марта на территории Украины (на трассе Тирасполь — Одесса) спецслужбами Молдовы бьш захвачен бывший командующий 14-й армией генерал Г.И. Яковлев. 19 марта Молдова официально признала факт его похищения. 20 марта генерала Г.И. Яковлева обменяли на 27 полицейских, которых захватили казаки в городе Дубоссары в ночь с 1 на 2 марта.
18 марта совершено вооруженное нападение на 189-ю ракетную бригаду 14-й армии, дислоцировавшуюся в городе Бельцы. В ходе завязавшейся перестрелки один военнослужащий был ранен, но нападение было отбито.
23 марта в 12 часов дня в районе села Кошница, на линии соприкосновения противоборствующих сторон, молдавской стороной была обстреляна группа швейцарских журналистов (Андриана Цшокке, Кристофер Мюллер), которая появилась со стороны ПМР. Молдавская сторона заранее была предупреждена об их появлении.