Главным противником СССР стали его недавние союзники— США и Англия. В связи с этим появилась необходимость вскрыть их военно-политические планы и определить основные направления проводимой ими тайной войны против Советского Союза.
15 июня 1946 года произошла замена руководства 1-го Главного управления. Генерал-лейтенант Павел Михайлович Фитин был направлен в распоряжение Управления кадров МГБ СССР, в сентябре того же года он был назначен заместителем уполномоченного МГБ СССР в Германии. В 1947 году был переведен в Свердловск заместителем начальника областного управления МГБ, в 1951 году назначен министром госбезопасности Казахской ССР, с марта по июль 1953 года снова в Свердловске — начальник управления МВД. В ноябре того же года был уволен из органов госбезопасности, работал старшим контролером в Министерстве госконтроля СССР — Комиссии советского контроля при Совмине СССР. С 1959 года был директором фотокомбината Союза советских обществ дружбы и культурных связей с зарубежными странами. Скончался в Москве 24 декабря 1971 года.
Начальником внешней разведки был назначен генерал-лейтенант Петр Николаевич Кубаткин. Он родился в 1907 году в поселке Кольберовский Рудник Успенского уезда Елизаветградской губернии в семье шахтера. Окончил 4-классную сельскую школу и работал в Донбассе рудокопом, шахтером, был на советской и комсомольской работе. В 1929—1932 годы служил в погранвойсках ОГПУ (от рядового до помощника начальника заставы по политчасти). В 1930 году вступил в партию. Затем до 1937 года служил в органах ГПУ-НКВД в Одесской области — оперуполномоченным, замначальника политотдела МТС, начальником райотдела. В 1937 году после окончания полугодовых курсов при Центральной школе НКВД был переведен в центральный аппарат НКВД. Работал оперуполномоченным и помощником начальника отделения в Секретно-политическом отделе ГУГБ, был секретарем парткома ГУГБ. В 1939—1941 годы был начальником управления НКВД-НКГБ по Московской области, в августе 1941 года — начальником 3-го спецотдела НКВД. С конца августа 1941 года Кубаткин — начальник управления НКВД-НКГБ по Ленинградской области, работал в Ленинграде всю блокаду. После работы в разведке в ноябре 1946 года был назначен начальником УМГБ Горьковской области, в марте 1949 года уволен из МГБ и переведен в Саратов зампредом облисполкома, но уже в июле был арестован по «ленинградскому делу». В октябре 1950 года Особое совещание при МГБ СССР приговорило его к 20 годам заключения, но 27 октября 1950 года по приговору Военной коллегии Верховного суда СССР, пересмотревшей дело, Петр Николаевич Кубаткин был расстрелян. Реабилитирован в 1954 году.
9 сентября 1946 года Кубаткина сменил генерал-лейтенант Петр Васильевич Федотов. Он родился в 1900 году в Санкт-Петербурге в семье кондуктора конки. Окончил начальное и среднее училища. С 15 лет работал упаковщиком газет на Главпочтамте и киномехаником. В 1919— 1920 годы служил в Красной Армии — красноармейцем, ротным политруком. Воевал на Восточном, Южном, Кавказском фронтах, окончил курсы при политотделе Южного фронта. В 1918 году вступил в большевистскую партию, но в 1922 году выбыл автоматически. С 1920 года служил в Особом отделе Кавказской трудовой армии, в 1921—1927 годы в органах ЧК-ГПУ в Чечне, с 1927 года — в полпредстве ОГПУ — управлении НКВД Северо-Кавказского (с февраля 1937 г. Орджоникидзевского) края в информационном и секретно-политическом отделах — уполномоченным, начальником отделения. С 1932 года был кандидатом в члены ВКП(б), в 1937 году вступил в партию и в том же году переведен в Москву в секретно-политический отдел ГУГБ НКВД, где работал начальником отделения, заместителем начальника отдела, с сентября 1939года— начальником отдела. С сентября 1940 года он одновременно возглавлял 3-й (контрразведывательный) отдел ГУГБ НКВД СССР. После организации НКГБ Федотов стал начальником 2-го управления наркомата (с июля 1941 г. НКВД, с апреля 1943 г. вновь НКГБ) и руководил контрразведкой в течение Великой Отечественной войны.
4 мая 1946 года был создан отдел «ДР» (служба проведения диверсий и индивидуального террора), начальником которого был назначен генерал-лейтенант П. Судоплатов. Главной задачей отдела «ДР» являлась организация агентурно-разведывательной работы за рубежом и внутри страны.
Постановлением Совета Министров СССР 30 мая 1947 года был создан Комитет информации при Совете Министров СССР, в состав которого вошли 1-е Главное управление МГБ, ГРУ Министерства вооруженных сил, а также разведывательные и информационные структуры ЦК ВКП(б), МИД и Министерства внешней торговли. Первым председателем КИ стал В. М. Молотов. Однако поскольку Молотов не был профессиональным разведчиком, то непосредственным руководителем КИ являлся его первый заместитель генерал-лейтенант Петр Васильевич Федотов (с 30 мая 1947 по 24 августа 1949 г.).
Федотов работал в КИ до 1952 года, когда вернулся в разведку (был заместителем начальника ПГУ МГБ). С марта 1953 до апреля 1956 года вновь возглавлял Управление контрразведки в МВД СССР— КГБ при СМ СССР, затем работал в редакционно-издательском отделе Высшей школы КГБ. В 1959 году был уволен в запас, лишен генеральского звания и исключен из партии за нарушения законности в период 30—40-х годов. Умер Петр Васильевич Федотов в Москве в 1963 году.
В структуру КИ входили 8 оперативных управлений (3 географических, нелегальной разведки, научно-технической разведки, шифровальное и управление советников в странах народной демократии), два самостоятельных направления — «ЕМ» (эмиграция) и «СК» (советские колонии за рубежом) — и шесть функциональных отделов (оперативной техники, связи и т. д.).
Для руководства разведаппаратами за рубежом в КИ был введен так называемый институт главных резидентов, которыми, как правило, назначались послы или посланники. Первым таким главным резидентом стал бывший сотрудник ИНО НКВД Александр Семенович Панюшкин. С ноября 1947 по июнь 1952 года он был послом в США, являясь одновременно главным резидентом.
В конце 1948 года министру обороны СССР Н. А. Булганину удалось вернуть военную разведку в состав Генерального штаба.
В том же 1948 году в состав МГБ перешли Управление советников в странах народной демократии и службы «ЕМ» и «СК», которые 17 октября 1949 года вошли в 1-е управление МГБ, на которое возлагались задачи по управлению внешней контрразведкой.
Начальником 1-го управления 17 октября 1949 года был назначен Г. В Утехин, которого 4 января 1951 года сменил С. Н. Карташов. Для выполнения поставленных перед ним задач 1-е управление имело собственные резидентуры в советских представительствах за рубежом.
Что касается КИ, то в феврале 1949 года его статус был изменен — его передали в ведение МИДа. Новым начальником КИ после ухода В. Молотова с поста министра иностранных дел с 4 марта 1949 года стал новый глава МИД А. Я. Вышинский, а затем первый заместитель министра В. А. Зорин. Практическое руководство работой разведки осуществлял первый заместитель А. Вышинского генерал-лейтенант Сергей Романович Савченко — с 24 августа 1949 по 2 ноября 1951 года, когда загранаппараты КИ и 1-го управления МГБ были объединены.
2 ноября 1951 года в МГБ было вновь образовано 1-е Главное управление (ПГУ), которое возглавил Сергей Романович Савченко, который, как начальник ПГУ, получил статус заместителя министра госбезопасности.
С. Р. Савченко родился в городе Скадовске Днепровского уезда Таврической губернии в 1904 году в крестьянской семье. Окончил земское училище и 4 класса гимназии. Работал сторожем и конторщиком. С 1921 года служил в погранвойсках на Украине. Окончил Высшую пограничную школу ОГПУ в 1925 году. В 1930 году вступил в партию. В 1939—1940 годы был заместителем начальника Управления погранвойск НКВД Украины, с 1941 по 1943 годы заместителем наркома госбезопасности — внутренних дел-УССР. Нарком-министр госбезопасности Украины с мая 1943 до августа 1949 года. С марта по декабрь
1953 года был заместителем начальника разведки. В 1953—1954 годы начальник Особого отдела МВД-КГБ при одном из строительств Московского района ПВО. Уволен в запас в 1955 году. Умер в Москве в 1966 году.
ПГУ МГБ включало в себя секретариат, Управление нелегальной разведки, 9 географических и 5 функциональных отделов.
Позднее на базе европейских направлений (английского, германского, французского и других) было создано Управление Западной Европы ПГУ МГБ.
Реорганизации начала 50-х годов коснулись и отдела «ДР» МГБ, отвечавшего за проведение диверсий за границей. Осенью 1950 года он был расформирован, а на его базе 9 сентября 1950 года были созданы бюро № 1 (проведение диверсий и террора за границей) и бюро № 2 (проведение похищений и убийств внутри СССР). 28 сентября 1950 года были сформированы бюро № 1 (начальник генерал-лейтенант Павел Анатольевич Судоплатов) и бюро №2 (начальник генерал-лейтенант В. А. Дроздов). Оба бюро действовали на правах управлений и подчинялись непосредственно министру.
