В свою очередь на роялистской эскадре дела были совсем плохи: настроение экипажей было мятежным, было много дезертиров, так что Руперту пришлось даже 10 из них повесить на реях. Положение с экипажами становилось отчаянным, даже на флагмане Руперта из команды в 300 человек осталось всего 40; это было сборище настоящих бандитов, которых привлекали только призовые деньги.
21 мая Блэйк захватил 10 английских торговых кораблей, зафрахтованных португальцами для торгового конвоя в Бразилию. Тут же он направил Жуану IV письмо, в котором предлагал освободить эти суда, если король передаст Парламентскому флоту корабли Руперта. Португальский монарх, прочитав послание Блэйка, рвал и метал – в ярости Жуан IV приказал арестовать всех находящихся на территории Португалии английских подданных, сочувствующих Протекторату, а эскадре Блэйка было запрещено использовать португальские гавани и брать питьевую воду у португальских берегов. В результате необдуманного поступка своего командующего Парламентский флот был вынужден теперь посылать за провизией и водой корабли в Кадис.
Однако 26 мая к Блэйку прибыло подкрепление – эскадра Эдварда Попхэма в составе 68‑пушечного «Резолюшн», 42‑пушечного «Эндрю», 36‑пушечного «Феникс», 28‑пушечного «Сатифэкшн» и четырех торговых судов с провиантом и припасами. Попхэм же привез приказ парламента Блэйку начать операции против португальской торговли, если Жуан IV не согласится на требования Англии. В этой ситуации португальский король попросил Руперта по возможности покинуть португальские воды. В ночь с 21 на 22 июля Руперт снялся с якоря и вместе с 22 португальскими и несколькими французскими судами взял курс в открытое море. Жуан нашел хитрый выход – он сообщил Руперту, что в его атаке на Блэйка принца поддержит португальский флот, поскольку Браганса уж очень хочет отомстить за 10 захваченных кораблей. В этот момент Блэйк был ослаблен – 7 его кораблей ушли в Кадис за провиантом и водой, у «морского генерала» было только 10 кораблей и 9 «бразильцев», захваченных в мае и включенных в Парламентский флот.
Однако вскоре португальцы отстали, а потом и вовсе бросили якорь, не выходя из устья реки, и Руперт оказался предоставленным сам себе. До 28 июля принц раздумывал, атаковать ему или нет, но потом подошли корабли из Кадиса, и Руперт вернулся в Лиссабонскую гавань.
19 августа Блэйк захватил и потопил богатый португальский корабль, возвращавшийся с грузом из Индии (ценностью в 100 тысяч фунтов стерлингов). 14 сентября «морской генерал» атаковал «Бразильский флот» (23 торговых судна), захватил шесть и сжег одно судно. На призах было взято 4000 ящиков сахара и 400 пленных. Еще 5 кораблей из этого злосчастного конвоя захватил позже Попхэм.
После этих событий Жуан IV резко охладел к Руперту, поэтому 12 октября принц был вынужден покинуть Лиссабон с «Констант Реформейшн», «Суоллоу», «Блэк Принс», «Секонд Чарльз», «Генри» и «Мэри», и направился в Средиземное море, захватив по пути 3 торговых английских судна.
18 октября Руперт миновал Гибралтарский пролив. Далее он взял курс на Малагу, где, по слухам, находилось много английских торговых судов. Данные эти подтвердились, и принц решил отправить замаскированный под купца «Генри» на рейд Малаги, с которого абордажные партии ночью должны были напасть на торговые суда. Сам же Руперт с основными силами планировал войти на рейд порта в полночь, чтобы ловить и захватывать беглецов. Однако план этот провалился – часть команды дезертировала с «Генри» и предупредила о готовящемся нападении испанские власти.
Разочарованный Руперт отплыл к Велес‑Малаге, где стояли 4 английских купца. Губернатор этого порта не разрешил принцу войти в гавань, тогда принц соорудил брандер и пустил его на торговцев. В результате два купца сгорели. Роялисты взяли курс на Гибралтар, но там столкнулись с флотом Блэйка, который 20 октября после жаркого боя захватил 36‑пушечный приватир Руперта «Жюль». «Морской генерал» после боя отошел к Кадису, чтобы продать приз, а «Сэконд Чарльз» в это время смог захватить торговца «Уильям энд Джон».
Тем временем парламент решил послать в Средиземное море для защиты торговли адмирала (commander in chief) Уильяма Пенна с 4 кораблями. У берегов Испании Блэйк должен был оставить Пенну свои лучшие корабли, а сам – возвращаться домой. Также Пенн имел и еще одно спецзадание – надо было перехватить Бразильский флот, чтобы, во‑первых, проучить короля Португалии, а во‑вторых – достать деньги для снаряжения и снабжения эскадры.
Блэйк же 3 ноября застиг врасплох у мыса Палос отделившиеся для крейсерства «Генри», «Блэк Принс», «Сэконд Чарльз», «Мэри» и два приза и загнал их в Картахену, откуда они уже никогда не вышли. При этом походя был захвачен «Генри», а «Блэк Принс» разбился при входе в гавань Картахены. До 23 ноября Блэйк искал повсюду оставшиеся корабли Руперта, дошел даже до Майорки, 13 декабря вернулся в Кадис, а 10 февраля 1651 года прибыл в Англию. Попхэм вернулся еще 24 октября 1650 года.
Результатом действия английских эскадр у берегов Иберийского полуострова стало то, что Испания признала Протекторат.
Руперт же 6 ноября после жаркого боя захватил английский корабль «Мармадюк», а потом прибыл на Балеарские острова. Далее он взял путь на Тулон, но попал в жестокий шторм, был отнесен на «Констант Реформэйшн» к Мессине, получил существенные повреждения. Брат же Руперта, принц Мориц, сумел со «Суоллоу» и «Мармадюк» дойти до Тулона.
Руперт пару недель ремонтировал в Мессине свой корабль и присоединился к брату 25 ноября 1650 года. В Тулоне их ласково встретил адмирал Франции Сезар де Бурбон, герцог де Вандом, который рассматривал Руперта как союзника по войне с Испанией. Благодаря Вандому Руперт смог выгодно продать во Франции груз с «Мармадюк», переоборудовать свои суда и докупить еще несколько кораблей. «Мармадюк» теперь стал «Ривендж оф Уайтхолл» (Месть за Уайтхолл), были куплены английский приватир «Хонест Симен» и еще одно судно – «Лоял Сабджект». К апрелю 1651 года вместе с «Констант Реформэйшн» и «Суоллоу» роялистская эскадра насчитывала 5 кораблей. Когда до Руперта дошли слухи, что в марте 1651 года в Средиземное море вошел адмирал Пенн с 8 кораблями, он понял, что оставаться ему здесь слишком опасно.
Поскольку Пенн знал, что Руперт находится в Тулоне, принц распространил слух, что собирается идти в Эгейское море, а сам 7 мая миновал Гибралтар и взял курс на юг. Вообще, изначально принц планировал плыть к Барбадосу, где были сильны роялистские настроения, но команды его судов – настоящее отребье, служащее только за призовые деньги – настояли на плавании к островам Зеленого Мыса, поскольку там надеялись захватить много купцов. Однако по пути они смогли взять только три генуэзских корабля и один испанский, эскадра вернулась к Мадейре, где продала призы, кроме одного, который был включен в состав отряда под наименованием «Сент‑Майкл зе Эркэнджел». 25 июля Руперт и Мориц прибыли в порт Сен‑Мигель на Азорских островах, где их тепло принял португальский губернатор. За время стоянки «Сент‑Майкл зе Эркэнджел» сбежал вместе со всей командой в Англию, а шторм у острова Терсейра, разыгравшийся 26 сентября 1651 года, погнал эскадру Руперта в океан. На «Констант Реформэйшн» не выдержал корпус, и образовалась сильная течь. Четверо суток экипаж упорно боролся за жизнь корабля. 30 сентября, видя, что корабль тонет, «Суоллоу» и «Хонест Симен» подходили к флагману Руперта с намерением забрать команду, однако капитан «Констант Реформэйшн» Энтони Честер отказался покинуть корабль. Пример его оказался настолько заразителен, что вся команда, большую часть которой составляли явно не «люди чести», также решила разделить участь судна. В 21.00 корабль разломился на волнах и утонул. Вместе с ним утонули и 300 человек экипажа. В этом же шторме был потерян «Лоял Сабджект». 7 декабря потрепанные корабли Руперта пришли к Кабо‑Бланко у берегов Западной Африки, где занялись починкой уцелевших кораблей. Отсюда же Руперт на голландском торговом судне отослал долю от захватов принцу Уэльскому, который теперь роялистами именовался королем Англии Карлом II. Он также просил в письме, чтобы из своей доли Карл II оплатил его долги, сделанные в Тулоне зимой 1651 года.
