Среди перепончатокрылых особенным разнообразием отличаются муравьи, среди которых следует упомянуть эндемичных только для Неотропиков муравьев-листорезов (15 видов). В подземных муравейниках (диаметром до 10 м и глубиной до 6 м) эти муравьи на основе массы из пережеванных листьев растений разводят грибы, которыми и питаются.
Рассматривая энтомофауну Неотропической области следует отметить, что здесь обитает ряд насекомых, поражающих своими крупными размерами. Так длина тела усача-титана достигает 20 см, жука-геркулеса – 18 см, а размах крыльев крупнейшей ночной бабочки агриппины достигает 30 см; в Неотропической области обитает и самый большой в мире муравей размером с обыкновенную осу.
Исключительно богата ихтиофауна Неотропической области.
К эндемичному семейству Речные хвостоколы относятся несколько видов пресноводных скатов. Зазубренные хвостовые шипы крупных видов индейцы используют в качестве наконечников для копий и стрел. Мелкие виды речных хвостоколов содержатся в аквариумах в качестве декоративных рыб.
Только в Неотропиках встречаются представители семейства Ножетелые (15 видов). Представители этого семейства имеют длинное вытянутое уплощенное тело (длиной до 60 см), длинный заостренных хвост, который служит не только органом локомоции, но и органом осязания. Рыбы могут перемещаться и хвостом вперед среди зарослей подводной растительности.
В Южной Америке имеется своеобразное эндемичное семейство Клинобрюхие. Это мелкие рыбки (до 9 см длиной) с сильно сжатым с боков высоким телом, дугообразно выпяченным брюшком, очень большими грудными плавниками и сильной мускулатурой передних конечностей. Клинобрюшки держатся стайками у поверхности воды, где питаются в основном упавшими в воду насекомыми. При опасности они способны быстро скользить по поверхности воды (по другим данным – пролетать, используя активный машущий полет до 5 метров).
К эндемичному семейству Электрические угри относится один вид. Это крупная рыба длиной до 3 метров оливково-коричневой окраски с ярко-оранжевым горлом. Она обитает в слабопроточных, сильно заросших, заиленных водоемах и способна к дыханию атмосферным воздухом. Кожа у электрического угря голая, без чешуи. Плавает электрический угорь медленно с помощью волнообразного движения сильно развитого анального плавника. У этой рыбы имеются электрические органы, которые способны вырабатывать напряжение до 650 вольт, при силе тока до 0,5 ампер. Электрические органы используются как для защиты от врагов, так и для обездвиживания добычи, в основном некрупных рыб.
Для ихтиофауны Неотропической области очень характерно наличие большого числа эндемичных семейств сомов.
Семейство Броняковые включает около 90 видов. Голова и туловище броняка покрыты костными пластинками, из-за чего в поперечном сечении они выглядят гранеными. Рыбы этого семейства способны дышать атмосферным воздухом, а в засушливый период переползать при помощи грудных плавников из водоема в водоем, при помощи плавников они издают скрежет, слышимый на расстоянии до 35 м.
Панцирем из костных пластинок покрыто тело представителей эндемичных семейств Панцирные сомики и Кольчужные сомики. Для панцирных сомиков, как и для броняковых, свойственно дыхание атмосферным воздухом, а для кольчужных сомов – питание водорослевыми обрастаниями на камнях, с связи с чем у них в процессе эволюции развился присоскообразный рот и очень длинный кишечник.
К эндемичному семейству Ванделливые сомы относятся мелкие рыбки с вытянутым червеобразным телом и с шипами на жаберных крышках. Ванделливые сомы являются эктопаразитами, что в целом для класса рыб не свойственно. Некоторые виды прогрызают кожу крупных рыб и сосут кровь, другие присасываются к жабрам рыбы-хозяина, третьи паразитируют в мочеполовых протоках крупных рыб. Иногда привлеченные запахом мочевины они проникают в мочеполовые отверстия зверей и даже купающихся людей.
В составе ихтиофауны Неотропической области имеются древние виды проявляющие гондванские связи. Это представители надотряда Двоякодышащие из семейства Двулегочниковые – лепидосирен. У этой рыбы змееобразное длинное (до 125 см) тело и недоразвитые парные плавники. Лепидосирен населяет заболоченные водоемы. В засушливый период по мере понижения уровня воды лепидосирен все чаще прибегает к дыханию атмосферным воздухом. Напомним, что двоякодышащие рыбы встречаются еще в Африке и в Австралии.
В Неотропиках имеются представители одного из древнейших отрядов пресноводных костистых рыб – Араванообразные. К этому отряду относится одна из самых крупных пресноводных рыб – арапаима (длина тела до 4,6 м, масса – до 200 кг). Представители этого отряда встречаются кроме того в Эфиопской, Австралийской и Индо-Малайской областях.
Из других групп рыб, представители которых встречаются и в других зоогеографических областях (Эфиопской и Индо-Малайской), следует упомянуть харацинид (к ним относится множество видов аквариумных рыб – в частности неоны, тетры, грацилисы и др., а так же пираньи), цихлид (к ним так же относятся виды, содержащиеся в аквариумах, в частности скалярии и дискусы), и зубатых карпов (к этому семейству относятся такие популярные аквариумные рыбки как гуппи, моллинезии, меченосцы, пецилии).
Рассматривая представителей класса Земноводные, встречающихся в Неотропической области следует отметить, что хвостатые земноводные здесь представлены исключительно бедно, фауна бесхвостых наоборот очень богата и содержит 14 эндемичных семейств.
Седлоносные, или Короткоголовые жабы внешним обликом напоминают миниатюрных жаб (длина тела до 1,5 см), окрашенных в ярко-желтый цвет. Эти земноводные живут в опавшей листве, питаются мелкими насекомыми. Седлоносными они названы в связи с тем, что на спине у них имеется костная пластинка, срастающаяся с кожей и остистыми отростками позвонков.
К семейству Стеклянные лягушки относятся небольшие земноводные, ведущие древесный образ жизни, окрашенные в зеленоватые цвета и имеющие полупрозрачное тело.
К эндемичному семейству Циклорамфиды относится ринодерма – небольшое земноводное (длина тела до 3,3 см), окраска тела которого широко варьирует от серовато-коричневой до оливково-зеленой. Морда у животного вытянута в мягкий хоботок. Ринодерма населяет горные водоемы с холодной водой. В брачный период самка откладывает несколько раз небольшими порциями по 1–2 крупных яйца с большим содержанием желтка. После оплодотворения самец забирает их в рот и инкубирует в своем горловом мешке. Полностью сформированные детеныши покидают горловой мешок родителя.
К эндемичному семейству Древолазы относятся около 130 видов мелких амфибий (длина тела 2–4 см). Древолазы обладают яркой, контрастной окраской (из сочетания красных, оранжевых, зеленых и черных цветов). Плавательные перепонки у них отсутствуют, на концах пальцах имеются диски, облегчающие животным передвижение по деревьям. Кожные железы древолазов выделяют высокотоксичные вещества, которые аборигены используют для смазывания наконечников стрел для духовых трубок.
В Неотропической области из земноводных встречаются представители семейства Пиповые (виды этого таксона обитают также в Эфиопской области). Один из самых известных представителей этого семейства в Южной Америке – суринамская пипа – довольно крупная водная амфибия (длина тела около 20 см) имеющее четырехугольное сильно сплюснутое тело и очень маленькие обращенные вверх глаза. В период размножения самка при помощи длинного яйцеклада откладывает себе на спину оплодотворенные самцом икринки. Впоследствии икринки сверху затягиваются кожей самки. На спине матери происходит полное развитие и через 2,5 месяца из ячеек появляются молодые пипы.
В Неотропиках чрезвычайного разнообразия достигают квакши. Среди них надо отметить квашу кузнеца, которая названа так из-за голоса, напоминающего удары молотка по металлу.
Самка этого вида во время размножения отгораживает глиняными валиками специальные бассейны (диаметр до 30 см) у берегов водоемов, куда потом откладывает икру. Самки квакши Гельди и сумчатые квакши вынашивают оплодотворенные яйца на спине. Квакши из рода Филломедузы ведут древесный образ жизни. Интересная особенность филломедуз – хватательные лапы, благодаря тому, что у них как у приматов первые пальцы на передних и задних конечностях противопоставляется остальным.
Среди рептилий Неотропической области нет эндемиков на уровне семейств.
Представители семейства Каймановые черепахи населяют север Неотропической области и южную часть Неарктики (распространены от юго-восточной Канады до Колумбии и Эквадора). Длина панциря этих водных рептилий достигает 35 см, масса – 30 кг. У каймановой черепахи громадная голова с выпуклыми глазами, большая пасть с острыми челюстями. Животное агрессивно и при поимке сильно кусается. Питается эта черепаха в основном рыбой и падалью.